-
BSA
פלטפורמת ניתוח Segregant Bulked מורכבת מניתוח סטנדרטי חד-שלבי וניתוח מתקדם עם הגדרת פרמטר מותאם אישית.BSA היא טכניקה המשמשת לזיהוי מהיר של סמנים גנטיים הקשורים לפנוטיפ.זרימת העבודה העיקרית של BSA מכילה: 1. בחירת שתי קבוצות של אנשים עם פנוטיפים מנוגדים ביותר;2. איחוד ה-DNA, ה-RNA או ה-SLAF-seq (פותח על ידי Biomarker) של כל הפרטים ליצירת שני חלקים של DNA;3. זיהוי רצפים דיפרנציאליים מול גנום ייחוס או ביניהם, 4. חיזוי אזורים מקושרים מועמדים באמצעות אלגוריתם ED ו-SNP-index;5. ניתוח פונקציונלי והעשרה על גנים באזורים מועמדים וכו'. כרייה מתקדמת יותר בנתונים כולל סקר סמנים גנטיים ועיצוב פריימר זמינים גם כן.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
פלטפורמת Amplicon (16S/18S/ITS) פותחה עם שנים של ניסיון בניתוח פרויקטים של מגוון מיקרוביאלי, המכילה ניתוח בסיסי וניתוח מותאם אישית: ניתוח בסיסי מכסה את תוכן הניתוח המיינסטרים של מחקר מיקרוביאלי עדכני, תוכן הניתוח עשיר ומקיף, ותוצאות הניתוח מוצגות בצורה של דוחות פרויקטים;התוכן של ניתוח מותאם אישית הוא מגוון.ניתן לבחור דוגמאות וניתן להגדיר פרמטרים באופן גמיש בהתאם לדוח הניתוח הבסיסי ולמטרת המחקר, כדי לממש דרישות מותאמות אישית.מערכת הפעלה Windows, פשוטה ומהירה.
-
גנטיקה אבולוציונית
גנטיקה אבולוציונית היא שירות רצף ארוז המיועד לספק פרשנות מקיפה על מידע אבולוציוני של חומרים נתונים בהתבסס על וריאציות גנטיות, כולל SNPs, InDels, SVs ו-CNVs.הוא מספק את כל הניתוחים הבסיסיים הנדרשים לתיאור שינויים אבולוציוניים ומאפיינים גנטיים של אוכלוסיות, כגון מבנה אוכלוסייה, מגוון גנטי, קשרי פילוגניה וכו'. הוא מכיל גם מחקרים על זרימת גנים, מה שמאפשר הערכה של גודל אוכלוסיה יעיל, זמן סטייה.
-
גנומיקה השוואתית
גנומיקה השוואתית פירושה, פשוטו כמשמעו, השוואת רצפי הגנום המלאים והמבנים של מינים שונים.דיסציפלינה זו שואפת לחשוף את התפתחות המינים, תפקוד הגנים, מנגנון ויסות הגנים ברמת הגנום על ידי זיהוי מבני הרצף והאלמנטים ששמרו או התמיינו בין מינים שונים.מחקר גנומי השוואתי טיפוסי כולל ניתוחים במשפחת הגנים, התפתחות אבולוציונית, שכפול גנום שלם, לחץ סלקטיבי וכו'.
-
גנטיקה אבולוציונית
פלטפורמת ניתוח גנטי אבולוציוני של אוכלוסיות הוקמה על בסיס ניסיון מסיבי שנצבר בצוות המו"פ של BMK במשך שנים.זהו כלי ידידותי למשתמש במיוחד עבור חוקרים שאינם מתמחים בביואינפורמטיקה.פלטפורמה זו מאפשרת ניתוח בסיסי הקשור לגנטיקה אבולוציונית, כולל בניית עצים פילוגנטיים, ניתוח חוסר שיווי משקל, הערכת מגוון גנטי, ניתוח סריקה סלקטיבי, ניתוח קרבה, PCA, ניתוח מבנה אוכלוסיה וכו'.
-
מכלול גנום מבוסס Hi-C
Hi-C היא שיטה המיועדת ללכוד תצורת כרומוזומים על ידי שילוב של אינטראקציות מבוססות קרבה גישושים ורצף תפוקה גבוהה.מאמינים כי עוצמת האינטראקציות הללו נמצאת בקורלציה שלילית עם המרחק הפיזי בכרומוזומים.לכן, נתוני Hi-C יכולים להנחות את הקיבוץ, הסדר והכיוון של רצפים מורכבים בגנום טיוטה ועיגון אלה על מספר מסוים של כרומוזומים.טכנולוגיה זו מעצימה מכלול גנום ברמת הכרומוזום בהיעדר מפה גנטית מבוססת אוכלוסייה.כל גנום בודד צריך Hi-C.
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
רצף הגנום של צמח/חיה דה נובו
דה נובוריצוף מתייחס לבניית הגנום המלא של המין תוך שימוש בטכנולוגיות ריצוף, למשל PacBio, Nanopore, NGS וכו', בהיעדר גנום ייחוס.השיפור המדהים באורך הקריאה של טכנולוגיות רצף מהדור השלישי הביא הזדמנויות חדשות בהרכבת גנומים מורכבים, כגון אלה עם הטרוזיגוטיות גבוהה, יחס גבוה של אזורים חוזרים, פוליפלואידים וכו'. עם אורך קריאה ברמת עשרות קילו-בסיסים, קריאות רצף אלו מאפשרות פתרון של אלמנטים חוזרים, אזורים עם תוכן GC חריג ואזורים מורכבים אחרים.
פלטפורמה: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ פלטפורמת Illumina NovaSeq
-
רצף אנושי שלמות האקסומים
רצף אקסום שלם (WES) נחשב כאסטרטגיית רצף חסכונית לזיהוי מוטציות הגורמות למחלות.למרות שאקסונים תופסים רק כ-1.7% מהגנום כולו, הוא מייצג את הפרופיל של תפקודי החלבון הכוללים ישירות.בגנום האנושי, דווח כי יותר מ-85% מהמוטציות הקשורות למחלה מתרחשות באזור המקודד לחלבון.
BMKGENE מציעה שירותי רצף אקסומים שלמים אנושיים מקיפים וגמישים עם אסטרטגיות שונות של לכידת אקסונים זמינות כדי לעמוד ביעדי מחקר שונים.
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq
-
רצף קטעים מוגבר של לוקוס ספציפי (SLAF-Seq)
גנוטיפ בתפוקה גבוהה, במיוחד באוכלוסיה בקנה מידה גדול, הוא שלב בסיסי במחקרי אסוציאציות גנטי, המספקים בסיס גנטי לגילוי גנים פונקציונליים, ניתוח אבולוציוני וכו'. במקום ריצוף מחדש של גנום שלם עמוק, רצף גנום ייצוג מופחת (RRGS) ) מוצג כדי למזער את עלות הרצף לדגימה, תוך שמירה על יעילות סבירה בגילוי סמן גנטי.זה מושג בדרך כלל על ידי חילוץ קטע הגבלה בטווח גודל נתון, אשר נקרא ספריית ייצוג מופחתת (RRL).רצף מקטעים מוגבר במיקום ספציפי (SLAF-Seq) הוא אסטרטגיה שפותחה בעצמה עבור גנוטיפ SNP עם או בלי גנום ייחוס.
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq -
אילומינה ו-BGI
טכנולוגיית רצף Illumina, המבוססת על Sequencing by Synthesis (SBS), היא חידוש של NGS שאומצו בעולם, האחראית על יצירת למעלה מ-90% מנתוני הרצף בעולם.העיקרון של SBS כולל הדמיה של terminators הפיכים עם תיוג פלואורסצנטי כאשר כל dNTP מתווסף, ולאחר מכן מבוקע כדי לאפשר את השילוב של הבסיס הבא.עם כל ארבעת ה-dNTPs הקשורים ל-terminator הפיך נוכחים בכל מחזור רצף, תחרות טבעית ממזערת את הטיית השילוב.טכנולוגיה רב-תכליתית זו תומכת הן בספריות קריאה בודדת והן בספריות קצה זוגיות, המספקת מגוון יישומים גנומיים.יכולות התפוקה הגבוהה והדיוק של רצף Illumina מציבים אותו כאבן יסוד במחקר הגנומי, ומעצים מדענים לפענח את נבכי הגנום עם פירוט ויעילות ללא תחרות.
DNBSEQ, שפותחה על ידי BGI, היא טכנולוגיית NGS חדשנית נוספת שהצליחה להפחית עוד יותר את עלויות הרצף ולהגדיל את התפוקה.הכנת ספריות DNBSEQ כוללת פיצול DNA, הכנת ssDNA והגברת מעגל מתגלגל להשגת ננו-כדורי ה-DNA (DNB).לאחר מכן הם נטענים על משטח מוצק ולאחר מכן רצף על ידי סינתזה קומבינטורית Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
שירות רצף הספרייה המוכן מראש שלנו מקל על הלקוחות להכין את ספריות הרצף שלהם ממקורות מגוונים (mRNA, גנום שלם, אמפליקון, בין היתר).לאחר מכן, ניתן לשלוח ספריות אלו למרכזי הרצף שלנו לבקרת איכות ורצף בפלטפורמות Illumina או BGI.
