-
רצף Metatranscriptome
ריצוף Metatranscriptome מזהה ביטוי גנים של חיידקים (גם אוקריוטים וגם פרוקריוטים) בסביבות טבעיות (כלומר אדמה, מים, ים, צואה ומעי.). באופן ספציפי, שירותים אלה מאפשרים לך לקבל פרופיל ביטוי גנים שלם של קהילות מיקרוביאליות מורכבות, ניתוח טקסונומי. של מינים, ניתוח העשרה תפקודית של גנים בעלי ביטוי שונה ועוד.
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq
-
גנום פטרייתי
Biomarker Technologies מספקות סקר גנום, גנום עדין וגנום מלא של פטרייה בהתאם למטרת מחקר ספציפית.ניתן להשיג רצף גנום, הרכבה וביאור פונקציונלי על ידי שילוב של רצף הדור הבא + רצף הדור השלישי להשגת הרכבה של גנום ברמה גבוהה.ניתן להשתמש בטכנולוגיית Hi-C גם כדי להקל על הרכבת הגנום ברמת הכרומוזומים.
פּלַטפוֹרמָה:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
פלטפורמת Illumina NovaSeq
-
ערכות כלים
BMKCloud היא פלטפורמה ביו-אינפורמטית מובילה המספקת פתרון נקודתי עבור תוכניות גנומיות, אשר זוכה לאמון נרחב על ידי חוקרים בזירות שונות, כולל רפואי, חקלאי, סביבתי וכו'. BMKCloud מחויבת לספק שירותים משולבים, אמינים ויעילים, כולל פלטפורמות וכלים לניתוח ביו-אינפורמט. , משאבי מחשוב, מסד נתונים ציבורי, קורסים מקוונים ביו-אינפורמטיים וכו'. ל-BMKCloud יש כלים ביו-אינפורמטיים שונים בשימוש תכוף הכוללים ביאור גנים, כלים גנטיים אבולוציוניים, ncRNA, בקרת איכות נתונים, הרכבה, יישור, מיצוי נתונים, מוטציות, סטטיסטיקות, מחולל דמויות, רצף ניתוח וכו'.
-
חיידקים שלם גנום
Biomarker Technologies מספקת שירות רצף לבניית גנום שלם של חיידקים עם פער אפס.זרימת העבודה העיקרית של בניית גנום שלם של חיידקים כוללת רצף דור שלישי, הרכבה, הערות פונקציונליות וניתוח ביואינפורמטי מתקדם המגשימה יעדי מחקר ספציפיים.פרופיל מקיף יותר של גנום חיידקים מעצים חשיפה של מנגנונים בסיסיים העומדים בבסיס התהליכים הביולוגיים שלהם, שיכולים גם לספק התייחסות חשובה למחקרים גנומיים במינים אוקריוטיים גבוהים יותר.
פּלַטפוֹרמָה:Nanopore PromethION P48 + פלטפורמת Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
-
RNA קטן
RNAs קטנים הם סוג של RNA קצר שאינו מקודד באורך ממוצע של 18-30 nt, כולל miRNA, siRNA ו-piRNA.RNAs קטנים אלו דווחו באופן מסיבי כמעורבים בתהליכים ביולוגיים שונים כגון פירוק mRNA, עיכוב תרגום, יצירת הטרוכרומטין וכו'. ניתוח רצף SmallRNA יושם באופן נרחב במחקרים על התפתחות בעלי חיים/צמחים, מחלות, וירוסים וכו'. RNA קטן פלטפורמת ניתוח רצף מורכבת מניתוח סטנדרטי וכריית נתונים מתקדמת.על בסיס נתוני RNA-seq, ניתוח סטנדרטי יכול להשיג זיהוי וחיזוי מירנא, חיזוי גן יעד של miRNA, ביאור וניתוח ביטוי.ניתוח מתקדם מאפשר חיפוש וחילוץ מירנא מותאמים אישית, יצירת דיאגרמות Venn, בניית רשתות מירנה וגני יעד.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS היא פלטפורמת ניתוח רצף מחדש של גנום שלם, אשר פותחה על בסיס ניסיון עשיר בטכנולוגיות Biomarker.פלטפורמה קלה לשימוש זו מאפשרת הגשה מהירה של זרימת עבודה ניתוח משולבת על ידי הגדרת מספר פרמטרים בסיסיים, המתאימים לנתוני רצף DNA שנוצרו הן מפלטפורמת Illumina והן מפלטפורמת רצף BGI.פלטפורמה זו נפרסת על שרת מחשוב בעל ביצועים גבוהים, מה שמאפשר ניתוח נתונים יעיל ביותר בזמן מוגבל מאוד.כריית נתונים מותאמת אישית זמינה על בסיס ניתוח סטנדרטי, כולל שאילתת גנים שעברו מוטציה, עיצוב פריימר PCR וכו'.
-
mRNA (הפניה)
תעתיק הוא הקשר בין מידע גנטי גנומי לבין הפרוטאום של התפקוד הביולוגי.ויסות רמת התעתיק הוא אופן הוויסות החשוב והנחקר ביותר של אורגניזמים.רצף תעתיק יכול לרצף את התעתיק בכל נקודת זמן או בכל מצב, ברזולוציה מדויקת לנוקלאוטיד בודד. הוא יכול לשקף באופן דינמי את רמת שעתוק הגנים, לזהות ולכמת תמלילים נדירים ונורמליים בו זמנית ולספק את המידע המבני של תמלילים ספציפיים לדוגמה.
נכון להיום, נעשה שימוש נרחב בטכנולוגיית רצף התעתיקים באגרונומיה, ברפואה ובתחומי מחקר אחרים, כולל ויסות התפתחות של בעלי חיים וצמחים, הסתגלות סביבתית, אינטראקציה חיסונית, לוקליזציה של גנים, אבולוציה גנטית של מינים וזיהוי גידולים ומחלות גנטיות.
-
מטאגנומיקה (NGS)
פלטפורמת ניתוח זו מיועדת לניתוח נתונים מטאנומי של רובה ציד על בסיס שנים של ניסיון.הוא מורכב מזרימת עבודה משולבת המכילה ניתוחי מטאנומיקה שונים הנחוצים, כולל עיבוד נתונים, מחקרים ברמת המינים, מחקרים ברמת תפקוד גנים, איסוף מטאנומים וכו'. בנוסף, כלים מותאמים אישית לכריית נתונים זמינים בזרימת עבודה סטנדרטית של ניתוח, כולל שאילתת גנים ומינים. , הגדרת פרמטר, יצירת דמויות מותאמת אישית וכו'.
-
LncRNA
RNAs ארוכים שאינם מקודדים (lncRNA) הם סוג של תעתיקים באורך של יותר מ-200 nt, שאינם מסוגלים לקודד חלבונים.עדויות מצטברות מצביעות על כך שרוב ה-lncRNAs צפויים להיות פונקציונליים.טכנולוגיות רצף בתפוקה גבוהה וכלי ניתוח ביואינפורמטיים מחזקים אותנו לחשוף רצפי lncRNA ומיקום מידע בצורה יעילה יותר ומובילים אותנו לגלות lncRNA עם פונקציות רגולטוריות חיוניות.BMKCloud גאה לספק ללקוחותינו פלטפורמת ניתוח רצף lncRNA להשגת ניתוח lncRNA מהיר, אמין וגמיש.
-
GWAS
מחקר איגוד רחב גנום (GWAS) נועד לזהות וריאנטים גנטיים (גנוטיפ) הקשורים לתכונות ספציפיות (פנוטיפ).מחקרי GWA חוקרים סמנים גנטיים חוצים את הגנום השלם של מספר רב של פרטים ומנבאים קשרים בין גנוטיפ לפנוטיפ על ידי ניתוח סטטיסטי ברמת האוכלוסייה.ריצוף מחדש של גנום שלם יכול לגלות את כל הווריאציות הגנטיות.בשילוב עם נתונים פנוטיפיים, ניתן לעבד GWAS לזיהוי SNPs, QTLs וגנים מועמדים הקשורים לפנוטיפ, אשר מגבים חזק גידול בעלי חיים/צמחים מודרניים.SLAF היא אסטרטגיית רצף גנום מפושטת שפותחה בעצמה, המגלה סמנים מבוזרים ברחבי הגנום, SNP.SNPs אלה, כסמנים גנטיים מולקולריים, ניתנים לעיבוד עבור מחקרי קשר עם תכונות ממוקדות.זוהי אסטרטגיה חסכונית בזיהוי תכונות מורכבות הקשורות לוריאציות גנטיות.
-
Transcriptomics של Nanopore באורך מלא
איזופורמים אלטרנטיביים מורכבים ומשתנים באורגניזמים הם מנגנונים גנטיים חשובים לוויסות ביטוי גנים ומגוון חלבונים.זיהוי מדויק של מבני תמלול הוא הבסיס למחקר מעמיק של דפוסי ויסות ביטוי גנים.פלטפורמת רצף Nanopore הביאה בהצלחה את המחקר התעתיק לרמת איזופורמה.פלטפורמת ניתוח זו נועדה לנתח נתוני RNA-Seq שנוצרו על פלטפורמת Nanopore על בסיס הגנום הייחוס, המשיג ניתוחים איכותיים וכמותיים גם ברמת הגן וגם ברמת התמלילים.
-
circ-RNA
RNA מעגלי (circRNA) הוא סוג של RNA לא מקודד, אשר לאחרונה נמצא כי הוא ממלא תפקיד חיוני ברשתות רגולטוריות המעורבות בפיתוח, עמידות סביבתית וכו'. להבדיל ממולקולות RNA ליניאריות, למשל mRNA, lncRNA, 3' ו-5' קצוות של circRNA מחוברים זה לזה ליצירת מבנה מעגלי, שמציל אותם מעיכול של אקסונוקלאז והם יציבים יותר מרוב ה-RNA הליניארי.ל-CircRNA נמצאו פונקציות מגוונות בוויסות ביטוי גנים.CircRNA יכול לפעול כ-ceRNA, הקושר את מירנה באופן תחרותי, המכונה ספוג מירנה.פלטפורמת ניתוח רצף CircRNA מעצימה ניתוח מבנה וביטוי circRNA, חיזוי יעד וניתוח משותף עם סוגים אחרים של מולקולות RNA
