עיקרי הדברים
בסמינר מקוון זה בן שעתיים, זה הכבוד הגדול שלנו להזמין שישה מומחים בזירת גנומיקת יבול.הדוברים שלנו יתנו פרשנות מעמיקה על שני מחקרים גנומיים של שיפון, שפורסמו רק לאחרונהגנטיקה של הטבע:
1. הרכבה של גנום בקנה מידה של כרומוזומים מספק תובנות לגבי ביולוגיה של שיפון, אבולוציה ופוטנציאל אגרונומי
2. מכלול גנום איכותי מדגיש מאפיינים גנומיים של שיפון וגנים חשובים מבחינה אגרונומית
כמו כן, אנו שמחים שיש לנו מדען מו"פ בכיר של Biomarker Technologies לחלוק את הניסיון שלו בהרכבת גנום דה נובו.
סֵדֶר הַיוֹם
09:00 בבוקר CET
הערות בברכה
ג'נג הונג-קון
מייסד ומנכ"ל Biomarker Technologies
דנג שינג-ואנג
נשיא בית הספר למדעי החקלאות המתקדמים באוניברסיטת פקין
09:15 בבוקר
שיפור שיפון, טריטיקל וחיטה באמצעות רצף גנום ייחוס איכותי
בסמינר המקוון הזה, פרופ' וואנג נתן לנו עדכונים כלליים על המצב הנוכחי של המחקר הגנומי של triticeae והדגים את ההצלחה ופריצות הדרך של שני העבודות המדהימות על מחקרי גנום שיפון, שפורסמו לאחרונה ב-Nature Genetics ומציגות את כל המחקר. קבוצות מובילות ותורמות בעבודות.
09:25 בבוקר
גנומיקת דגנים @ IPK Gatersleben
עשבי דגנים של שבט Triticeae היו מקור מזון עיקרי באזורים ממוזגים, אשר נחשבו זה מכבר כנקודה חמה בהשבחת יבול ורבייה.בין כל המינים המתורבתים, שבט זה מפורסם בתכונות הגנומיות המורכבות ביותר שלהם, כולל גדלי גנום גדולים, תכולה גבוהה של TEs, פוליפלואידיה וכו'. בפגישה זו, פרופ' נילס שטיין נתן לנו מבוא כולל על IPK Gatersleben והסטטוס הנוכחי של דגנים מחקר genomic@IPK Gatersleben.
09:35 בבוקר
הרכבה של גנום בקנה מידה של כרומוזומים מספקת תובנות לגבי ביולוגיה של שיפון, אבולוציה ופוטנציאל אגרונומי
ד"ר טימותי רבנוס-וואלאס, מכון לייבניץ לגנטיקה של צמחים וחקר תוכניות יבול (IPK)שיפון (Secale cereale L.) הוא גידול דגנים עמיד במיוחד באקלים, בשימוש נרחב לייצור זני חיטה משופרים באמצעות הכלאה אינטגרסיבית, ובעל כל רפרטואר הגנים הדרוש לאפשר גידול היברידי.שיפון הוא אלוגמי ורק לאחרונה מבוית, מה שנותן לשיפון תרבותי גישה למאגר גני בר מגוון וניתן לניצול.כדי לשפר עוד יותר את הפוטנציאל האגרונומי של שיפון, הפקנו מכלול מובא בקנה מידה כרומוזום של גנום השיפון של 7.9 Mbp, ואימתנו בהרחבה את איכותו באמצעות חבילה של משאבים גנטיים מולקולריים.אנו מדגימים יישומים של משאב זה באמצעות מגוון רחב של חקירות.אנו מציגים ממצאים על בידוד גנטי לא שלם של שיפון מתורבת מקרובי טבע, מנגנונים של אבולוציה מבנית של גנום, עמידות לפתוגנים, סבילות לטמפרטורה נמוכה, מערכות בקרת פוריות לגידול היברידי, ויתרונות התפוקה של חדירות חיטה שיפון.
10:05 בבוקר
מכלול גנום איכותי מדגיש מאפיינים גנומיים של שיפון וגנים חשובים מבחינה אגרונומית
שיפון הוא גידול מזון וגידול מספוא יקר ערך, משאב גנטי חשוב להשבחת חיטה וטריטיקלה, וחומר הכרחי למחקרי גנומיקה השוואתיים יעילים בעשבים.כאן, רצפנו את הגנום של שיפון ווינינג, זן שיפון סיני מובחר.הקונטיגים המורכבים (7.74 Gb) היוו 98.47% מגודל הגנום המשוער (7.86 Gb), כאשר 93.67% מהקונטיגים (7.25 Gb) הוקצו לשבעה כרומוזומים.אלמנטים חוזרים היוו 90.31% מהגנום המורכב.בהשוואה לגנומים של Triticeae שנרשמו בעבר, רטרוטרנספוזונים של Daniela, Sumaya ו-Sumana הראו התרחבות חזקה בשיפון.ניתוחים נוספים של הרכבת ויינינג שופכים אור חדש על כפילויות גנים בכל הגנום והשפעתם על גנים ביוסינתזה של עמילן, ארגונים פיזיים של לוקוסים מורכבים של פרולמין, תכונות ביטוי גנים העומדות בבסיס תכונת הכותרת המוקדמת, ואזורים כרומוזומליים משוערים הקשורים לביות בשיפון.רצף הגנום הזה מבטיח להאיץ את הגנומיקה ומחקרי הרבייה של שיפון וגידולי דגנים קשורים.
10:35 בבוקר
אתגרים, פתרונות ועתיד להרכבת הגנום דה נובו
גנום באיכות גבוהה הוא הבסיס למחקר הגנומי.למרות שההתפתחות המהירה ברצף ובאלגוריתם העצימה הרכבת גנום פשוטה ויעילה הרבה יותר, גם הדרישות לדיוק ושלמות ההרכבה עולות עם העמקת יעדי המחקר.בהרצאה זו אדון בטכנולוגיות הפופולריות הנוכחיות בהרכבת הגנום עם מספר מקרים מוצלחים ואראה הצצה להתפתחות העתידית.
זמן פרסום: ינואר-08-2022