פרוטאומיקה כוללת יישומים של טכנולוגיות לכימות של תכולת החלבונים הכוללת של תא, רקמה או אורגניזם.טכנולוגיות מבוססות פרוטאומיקה מנוצלות ביכולות שונות עבור מסגרות מחקר שונות כגון זיהוי סמני אבחון שונים, מועמדים לייצור חיסון, הבנת מנגנוני פתוגניות, שינוי דפוסי ביטוי בתגובה לאותות שונים ופרשנות של מסלולי חלבון פונקציונליים במחלות שונות.כיום, טכנולוגיות פרוטאומיקה כמותיות מחולקות בעיקר לאסטרטגיות כמותיות TMT, Label Free ו-DIA.