-
פרוטאומיקה
פרוטאומיקה כוללת יישומים של טכנולוגיות לכימות של תכולת החלבונים הכוללת של תא, רקמה או אורגניזם.טכנולוגיות מבוססות פרוטאומיקה מנוצלות ביכולות שונות עבור מסגרות מחקר שונות כגון זיהוי של סמני אבחון שונים, מועמדים לייצור חיסון, הבנת מנגנוני פתוגניות, שינוי דפוסי ביטוי בתגובה לאותות שונים ופרשנות של מסלולי חלבון פונקציונליים במחלות שונות.כיום, טכנולוגיות פרוטאומיקה כמותיות מחולקות בעיקר לאסטרטגיות כמותיות TMT, Label Free ו-DIA.
-
מטבולומי
המטבולום הוא התוצר הסופי במורד הזרם של הגנום ומורכב מההשלמה הכוללת של כל המולקולות (מטבוליטים) בעלות משקל מולקולרי נמוך בתא, ברקמה או באורגניזם.מטבולומיקה שואפת למדוד רוחב רחב של מולקולות קטנות בהקשר של גירויים פיזיולוגיים או מצבי מחלה.מתודולוגיות מטבולומיקה מתחלקות לשתי קבוצות נפרדות: מטבולומיקה לא ממוקדת, ניתוח מקיף המיועד של כל האנליטים הניתנים למדידה בדגימה, כולל לא ידועים כימיים באמצעות GC-MS/LC-MS, ומטבולומיקה ממוקדת, מדידה של קבוצות מוגדרות של מאפיינים כימיים ו מטבוליטים בעלי הערות ביוכימיות.
-
ניתוח של Segregant בכמות גדולה
אנליזה מבודדת בתפזורת (BSA) היא טכניקה המשמשת לזיהוי מהיר של סמנים גנטיים הקשורים לפנוטיפ.זרימת העבודה העיקרית של BSA מכילה בחירת שתי קבוצות של פרטים עם פנוטיפים מנוגדים ביותר, איחוד ה-DNA של כל הפרטים ליצירת שני חלקים של DNA, זיהוי רצפים דיפרנציאליים בין שני מאגרים.טכניקה זו הופעלה רבות בזיהוי סמנים גנטיים הקשורים חזק על ידי גנים ממוקדים בגנום צמחי/חי.
-
רצף DNA/RNA – Nanopore Sequencer
רצף ONT הוא מולקולה בודדת טכנולוגיית רצף אותות חשמליים בזמן אמת המבוססת על ננו-נקבוביות, עקרון הרצף של כל פלטפורמה זהה.DNA/RNA דו-גדילי ייקשר לחלבון ננו-נקבי המוטבע בביופילם ומתפרק תחת הובלת חלבון מוטורי, תחת פעולת הפרש מתחים משני צידי הביופילם, גדילי DNA/RNA עוברים בחלבון הערוץ הננופורי בשלב מסוים ציון.בשל ההבדלים בתכונות הכימיות של הבסיסים השונים על גדיל ה-DNA/RNA, כאשר בסיס בודד או מולקולת DNA עוברים דרך ערוץ הננו-פוריים, זה יגרום לשינוי של אותות חשמליים שונים.על ידי זיהוי והתאמת אותות אלה, ניתן לחשב את סוגי הבסיס המתאימים, ולהשלים את זיהוי הרצף בזמן אמת.
-
רצף DNA/RNA -PacBio Sequencer
פלטפורמת רצף PacBio היא פלטפורמת רצף לקריאה ארוכה, הידועה גם כאחת מטכנולוגיות ה-Third Generation Sequencing (TGS).טכנולוגיית הליבה, חד מולקולה בזמן אמת (SMRT), מעצימה יצירת קריאות באורך של עשרות קילוגרמים.על בסיס "רצף לפי סינתזה", רזולוציית נוקלאוטיד בודד מושגת על ידי מוליך גל אפס (ZMW), כאשר רק נפח מוגבל בתחתית (אתר סינתזת מולקולות), מואר.בנוסף, רצף SMRT מונע במידה רבה הטיה ספציפית לרצף במערכת NGS, בכך שרוב שלבי ההגברה של PCR אינם נדרשים בתהליך בניית הספרייה.
פלטפורמה: Sequel II, Revio
