● מקרי פרויקטים רבים: מאז הקמתה ב-2009, BMKGENE השלימה מאות פרויקטים של מינים במחקר GWAS של אוכלוסיות, סייעה לחוקרים לפרסם יותר מ-100 מאמרים, ומקדם ההשפעה המצטבר הגיע ל-500.
● אנליסטים מקצועיים.
● מחזור ניתוח קצר.
● כריית נתונים מדויקת.
סוּג | סולם אוכלוסייה | אסטרטגיית רצף ועומק |
SLAF-GWAS | מספר דוגמה ≥200 | גודל הגנום < 400M, עם ref-genome, WGS מומלץ |
גודל הגנום ≤ 1G, 100K תגיות ו-10X | ||
1G ≤ גודל הגנום ≤ 2G, 200K תגיות ו-10X | ||
גודל הגנום > 2G, 300K תגיות ו-10X | ||
WGS-GWAS | מספר דוגמה ≥200 | פי 10 עבור כל דגימה |
זנים שונים, תת-מינים, גזעים ארץ / גנים / משפחות מעורבות / משאבי בר
זנים שונים, תת-מינים, גזעים יבשתיים
משפחת אחים למחצה/משפחה של אח מלא/ משאבי פרא
● ניתוח אסוציאציות כלל-גנום
● ניתוח והקרנה של SNP משמעותי
● ביאור פונקציונלי של גן מועמד
א.פנוטיפ QC
היסטוגרמת התפלגות תדר
סטטיסטיקה של פנוטיפ
ב.ניתוח שיוך (דגם: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
עלילת QQ
עלילת מנהטן
שָׁנָה | כתב עת | IF | כותרת |
2022 | NC | 17.69 | בסיס גנומי של הג'יגה-כרומוזומים והג'יגה-גנום של אדמונית העץ Paeonia ostii |
2015 | NP | 7.43 | טביעות הרגל של ביות מעגנים אזורים גנומיים בעלי חשיבות אגרונומית בפולי סויה |
2018 | MP | 9.32 | ריצוף מחדש של גנום שלם של אוסף כלל עולמי של כניסות לפתית חושף את הבסיס הגנטי לסטייה האקוטייפ שלהם |
2022 | HR | 7.29 | ניתוח אסוציאציות רחב הגנום מספק תובנות מולקולריות לגבי השונות הטבעית של גודל זרעי האבטיח |