פרסום מומלץ

התעמקו בפוטנציאל של חקר מגוון פראי של מינים מחקריים, המודגם על ידי מקרה מרכזי מלקוחות BMKGENE.פורסם לאחרונה במהדורת השנה של כתב העת Plant Biotechnology Journal, המאמר שכותרתו "Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" עומד כהתייחסות בעלת ערך.

עץ הגומי הברזילאי (Hevea brasiliensis) מתנשא לגובה כמקור גומי טבעי מרכזי.לאורך המאה הקודמת, מתודולוגיות גידול מסורתיות גרמו לעלייה מדהימה של פי שישה בייצור הגומי.עם זאת, הסלע הגנטי הבסיסי האחראי לשיפור תפוקת הגומי הפוטנציאלית נותר חידתי.

מחקר זה החל בבניית גנום ברמת הכרומוזום עבור עץ הגומי הפראי, תוך שימוש בסינרגיה של רצף Nanopore לקריאה ארוכה, רצף Illumina NGS וטכנולוגיית Hi-C.

במקביל, אוסף של 147 משאבי נבט, הכוללים וריאציות של תשואה גבוהה, זני בר ומינים קשורים, הורכב עבור ריצוף מקיף של הגנום המלא (WGS) באמצעות פלטפורמת Illumina.נתוני הרצף שלאחר מכן עברו ניתוח גנטיקה קפדני של האוכלוסייה, המאפשר לנתח את מבנה האוכלוסייה, המגוון וחוסר שיווי המשקל בקישור.ניתוח זה שופך אור על שונות בביות בין אוכלוסיות.

חקירות נוספות כללו ניתוח הכולל Fst, π, Tajima's D ו-LD, במטרה לחשוף אותות בחירה הנובעים מתפוקת לטקס משופרת, בעיקר תוך התמקדות בשיבוטי Wickham.

בשיאו ב-Genome-wide Association Analysis (GWAS), סומנו סמנים הקשורים לתכונות תשואה ולאחר מכן לגנים הקשורים לתשואה.אימות ראשוני חשף פעילויות תעתיק ייחודיות על פני מוטנטים שונים עבור שני גנים ERF, מה שסיפק הצצה ראשונית למשמעות התפקודית שלהם.אישור נוסף מתוכנן במסגרת המחקר הקרוב.

BMKGENE מתגאה בתרומה לריצוף מחדש של הגנום המלא של אוכלוסייה גדולה זו, יחד עם תפקיד משמעותי בניתוח הביואינפורמטיקה.הניסיון הרב שלנו כולל רצף NGS/TGS וניתוח ביואינפורמטיקה מולטיומיקה על פני מערך של 1000+ מינים.אנו מצפים לאפשרות לשתף איתך פעולה בפרויקטים הקרובים שלך.

לחץ כאן כדילמד עוד על מחקר זה