-
רצף חיסוני כרומטין (ChIP-seq)
ChIP-Seq מספקת פרופיל גנום רחב של יעדי DNA עבור שינוי היסטון, גורמי שעתוק וחלבונים אחרים הקשורים ל-DNA.הוא משלב את הסלקטיביות של משקעים אימונו של כרומטין (ChIP) כדי לשחזר מתחמי חלבון-DNA ספציפיים, עם הכוח של רצף הדור הבא (NGS) לרצף תפוקה גבוהה של ה-DNA המשוחזר.בנוסף, מכיוון שמתחמי החלבון-DNA משוחזרים מתאי חיים, ניתן להשוות אתרי קישור בסוגי תאים ורקמות שונות, או בתנאים שונים.היישומים נעים בין ויסות שעתוק למסלולי התפתחות למנגנוני מחלה ומעבר לכך.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq 6000
-
רצף בי-סולפיט שלם של הגנום
מתילציה של DNA במיקום החמישי בציטוזין (5-mC) משפיעה מהותית על ביטוי גנים ופעילות התא.דפוסי מתילציה חריגים נקשרו למספר מצבים ומחלות, כגון סרטן.WGBS הפך לתקן הזהב לחקר מתילציה בכל הגנום ברזולוציית בסיס בודד.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq6000
-
בדיקה עבור כרומטין נגיש ל-Transposase עם רצף תפוקה גבוה (ATAC-seq)
ATAC-seq היא שיטת ריצוף בתפוקה גבוהה לניתוח נגישות לכרומטין רחב הגנום, החשובה לבקרה אפיגנטית גלובלית של ביטוי גנים.מתאמי רצף מוכנסים לאזורי כרומטין פתוחים על ידי טרנספוזאז Tn5 היפראקטיבי.לאחר הגברה של PCR, נבנית ספריית רצף.ניתן להשיג את כל אזורי הכרומטין הפתוחים בתנאי מרחב-זמן ספציפיים, לא רק לאתרי הקישור של גורם שעתוק, או לאזור מסוים שעבר שינוי בהיסטון.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
חקר מתילציה של DNA תמיד היה נושא חם בחקר מחלות, והוא קשור קשר הדוק לביטוי גנים ולתכונות פנוטיפיות.RRBS היא שיטה מדויקת, יעילה וחסכונית למחקר מתילציה של DNA.העשרה של אזורי פרומטור ואיי CpG על ידי ביקוע אנזימטי (Msp I), בשילוב עם רצף Bisulfite, מספקת זיהוי מתילציה של DNA ברזולוציה גבוהה.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq 6000
