אילומינה ו-BGI
מאפיינים
●פלטפורמות:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten ו-BGI-DNB-T7
●מצבי רצף:PE50, PE100, PE150, PE250
●בקרת איכות של ספריות לפני רצף
●מסירת נתונים ברצף ו-QC:מסירת דוח QC ונתונים גולמיים בפורמט fastq לאחר דה-מולטיפלקס וסינון קריאות Q30.
יתרונות השירות
●מגוון שירותי רצף:הלקוח יכול לבחור לרצף לפי נתיב, תא זרימה או כמות נתונים.
●מגוון פלטפורמות:ניתן להעביר ספריות DNB לפלטפורמות של Illumina
●ניסיון רב בפלטפורמת רצף Illumina:עם אלפי פרויקטים סגורים עם מינים שונים.
●מסירת דוח QC ברצף:עם מדדי איכות, דיוק נתונים וביצועים כלליים של פרויקט הרצף.
●תהליך רצף בוגר:עם זמן אחזור קצר.
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים דרישות QC קפדניות כדי להבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
דרישות לדוגמה*
רצף נתיב חלקי
| כמות נתונים (X) | ריכוז (qPCR/nM) | כרך |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 ננומטר | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 ננומטר | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 ננומטר | ≥ 20 μl |
נתיב יחיד (אילומינה)
| פּלַטפוֹרמָה | ריכוז (qPCR/nM) | כרך |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 ננומטר | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 ננומטר | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 ננומטר | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1.5 ננומטר | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 ננומטר | ≥ 25 μl |
בנוסף לריכוז ולכמות הכוללת, נדרשת גם תבנית שיא מתאימה.
אנא פנה אלינו אם הדוגמאות שלך אינן עומדות בדרישות חומר המוצא.
זרימת עבודה של שירות
בקרת איכות הספרייה
רצף
בקרת איכות נתונים
משלוח פרויקט
דוח QC של הספרייה
דוח על איכות הספרייה מסופק לפני ביצוע הרצף, הערכת כמות הספרייה והפיצול.
דוח QC ברצף
טבלה 1. סטטיסטיקה על נתוני רצף.
| מזהה לדוגמא | BMKID | קריאות גולמיות | נתונים גולמיים (bp) | קריאות נקיות (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
איור 1. התפלגות איכות לאורך קריאות בכל מדגם
איור 2. הפצת תוכן בסיסי
איור 3. התפלגות תוכן שנקרא בנתוני רצף
