מוצרים

רצף circRNA-Illumina

רצף RNA מעגלי (circRNA-seq) נועד ליצור פרופיל ולנתח RNAs מעגלי, סוג של מולקולות RNA היוצרות לולאות סגורות עקב אירועי שחבור לא קנוניים, המספקים ל-RNA אלו יציבות מוגברת.בעוד שחלק מה- circRNAs הוכחו לפעול כספוגים של מיקרו-RNA, קובעים מיקרו-RNA ומונעים מהם לווסת את ה-mRNA של היעד שלהם, circRNAs אחרים עשויים לקיים אינטראקציה עם חלבונים, לווסת את ביטוי הגנים או למלא תפקידים בתהליכים תאיים.ניתוח ביטוי circRNA מספק תובנות לגבי התפקידים הרגולטוריים של מולקולות אלו ומשמעותן בתהליכים תאיים שונים, בשלבי התפתחות ומצבי מחלה, תורם להבנה עמוקה יותר של המורכבות של ויסות RNA בהקשר של ביטוי גנים.

צור קשר

פרטי שירות

ביואינפורמטיקה

תוצאות הדגמה

פרסומים מומלצים

מאפיינים

● דלדול rRNA ואחריו הכנת ספרייה כיוונית, המאפשרת רצף נתונים ספציפיים לגדילים.

● זרימת עבודה ביואינפורמטית מאפשרת חיזוי circRNA וכימות ביטוי

יתרונות השירות

●ספריות RNA מקיפות יותר:אנו משתמשים בדלדול rRNA במקום דלדול RNA ליניארי בהכנה הקדם-ספרייה שלנו, ומבטיחים שנתוני הרצף כוללים לא רק circRNA אלא גם mRNA ו-lncRNA, מה שמאפשר ניתוח משותף על מערכי נתונים אלה

●ניתוח אופציונלי של רשתות RNA אנדוגני תחרותיות (ceRNA).: מתן תובנות מעמיקות יותר על מנגנוני הרגולציה הסלולריים

●מומחיות רבה: עם רקורד של עיבוד של למעלה מ-20,000 דגימות ב-BMK, המתפרשות על סוגי דגימות מגוונים ופרויקטים של lncRNA, הצוות שלנו מביא ניסיון עשיר לכל פרויקט.

●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרה ליבה בכל השלבים, מהכנת דגימות וספרייה ועד לרצף וביואינפורמטיקה.ניטור קפדני זה מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.

● תמיכה לאחר מכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה.במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי לטפל בכל שאלה הקשורה לתוצאות.

דרישות לדוגמא ומשלוח

סִפְרִיָה	פּלַטפוֹרמָה	נתונים מומלצים	נתונים QC
פולי A מועשר	Illumina PE150	16-20 ג'יגה-בייט	Q30≥85%

דרישות לדוגמה:

נוקלאוטידים:

ריכוז (ng/μl)

כמות (מיקרוגרם)

טוֹהַר

יושרה

≥ 100

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA מוצג על ג'ל.

לצמחים: RIN≥6.5;

לבעלי חיים: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

גובה בסיס מוגבל או ללא

● צמחים:

שורש, גבעול או עלה כותרת: 450 מ"ג

עלה או זרע: 300 מ"ג

פירות: 1.2 גרם

● בעל חיים:

לב או מעי: 450 מ"ג

קרביים או מוח: 240 מ"ג

שריר: 600 מ"ג

עצמות, שיער או עור: 1.5 גרם

● פרוקי רגליים:

חרקים: 9 גרם

סרטן: 450 מ"ג

● דם מלא:2 צינורות

● תאים: 10⁶תאים

● סרום ופלזמה: 6 מ"ל

משלוח לדוגמא מומלץ

מיכל: שפופרת צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ נייר כסף)

תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפל, למשל A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

מִשׁלוֹחַ:

1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.

2. צינורות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.

זרימת עבודה בשירות

עיצוב ניסוי

משלוח לדוגמא

מיצוי RNA

בניית ספרייה

רצף

ניתוח נתונים

שירותים לאחר המכירה

קודם: רצף תעתיק שלם - Illumina

הַבָּא: רצף RNA קטן-אילומינה

ביואינפורמטיקה

חיזוי circRNA: התפלגות כרומוזומלית

circRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי - עלילת הר געש

circRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי - מקבץ היררכי

העשרה פונקציונלית של הגנים המארח של circRNA

חקור את ההתקדמות המחקרית המועברת על ידי שירותי רצף ה-circRNA של BMKGene באמצעות אוסף של פרסומים.

Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 מווסת את היווצרות circRNA והשתקת גנים בתיווך מיקרו-RNA בקרצינומה של הפטוצלולרית', Oncogene 2021 40:25, 40(25), עמ' 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.

Xia, K. et al.(2023) 'תעתיק מגיב X oo חושף את תפקידו של ה-RNA133 העגול בעמידות למחלות על ידי ויסות הביטוי של OsARAB באורז', Phytopathology Research, 5(1), עמ' 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.

י, ח. ואח'.(2023) 'CPSF3 מווסת את האיזון של תמלילים מעגליים ולינאריים בקרצינומה כבדית'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.

Zhang, Y. et al.(2023) 'הערכה מקיפה של circRNAs בקרדיומיופתיה שחמת הכבד לפני ואחרי השתלת כבד', International Immunopharmacology, 114, p.109495. דוי: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.