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Sequenziamento di mRNA a lunghezza intera-Nanopore
Il sequenziamento dell'RNA è stato uno strumento prezioso per l'analisi completa del trascrittoma.Indubbiamente, il tradizionale sequenziamento a lettura breve ha ottenuto numerosi importanti sviluppi qui.Tuttavia, incontra spesso limitazioni nelle identificazioni isoforme a lunghezza intera, nella quantificazione, nella distorsione della PCR.
Il sequenziamento dei nanopori si distingue dalle altre piattaforme di sequenziamento, in quanto i nucleotidi vengono letti direttamente senza sintesi del DNA e genera una lettura lunga a decine di kilobasi.Ciò consente la lettura diretta attraversando trascrizioni a lunghezza intera e affrontando le sfide negli studi a livello di isoforma.
piattaforma：Promozione Nanopore
Biblioteca:cDNA-PCR
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Sequenziamento del trascrittoma a lunghezza intera de novo -PacBio
De novosequenziamento del trascrittoma a lunghezza intera, noto anche comeDe novoIso-Seq sfrutta i vantaggi del sequenziatore PacBio nella lunghezza di lettura, che consente il sequenziamento di molecole di cDNA a lunghezza intera senza interruzioni.Ciò evita completamente qualsiasi errore generato nelle fasi di assemblaggio della trascrizione e costruisce insiemi unigene con risoluzione a livello di isoforma.Questo set unigene fornisce potenti informazioni genetiche come "genoma di riferimento" a livello di trascrittoma.Inoltre, in combinazione con i dati di sequenziamento di nuova generazione, questo servizio consente una quantificazione accurata dell'espressione a livello di isoforma.
Piattaforma: PacBio Sequel IILibreria: Libreria di campane SMRT -
Sequenziamento dell'mRNA eucariotico-Illumina
Il sequenziamento dell'mRNA consente la profilazione di tutti gli mRNA trascritti dalle cellule in condizioni specifiche.È una potente tecnologia per rivelare il profilo di espressione genica, le strutture geniche e i meccanismi molecolari di determinati processi biologici.Ad oggi, il sequenziamento dell'mRNA è stato ampiamente impiegato nella ricerca fondamentale, nella diagnostica clinica, nello sviluppo di farmaci, ecc.
Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenziamento di mRNA non di riferimento-Illumina
Il sequenziamento dell'mRNA adotta la tecnica di sequenziamento di nuova generazione (NGS) per catturare l'RNA messaggero (mRNA) dall'eucariota in un periodo specifico in cui alcune funzioni speciali stanno attivando.La trascrizione giuntata più lunga è stata chiamata "Unigene" e utilizzata come sequenza di riferimento per l'analisi successiva, che è un mezzo efficace per studiare il meccanismo molecolare e la rete di regolazione della specie senza riferimento.
Dopo l'assemblaggio dei dati del trascrittoma e l'annotazione funzionale unigene
(1)Saranno effettuate analisi SNP, analisi SSR, predizione CDS e struttura genica.
(2) Sarà effettuata la quantificazione dell'espressione unigene in ciascun campione.
(3) Verranno scoperti unigeni espressi in modo differenziato tra campioni (o gruppi) sulla base dell'espressione unigene
(4)Saranno effettuate analisi di clustering, annotazione funzionale e arricchimento di unigeni differenzialmente espressi
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Sequenziamento lungo non codificante-Illumina
Gli RNA lunghi non codificanti (lncRNA) sono un tipo di molecole di RNA con lunghezza superiore a 200 nt, che sono caratterizzate da un potenziale codificante estremamente basso.LncRNA, come membro chiave negli RNA non codificanti, si trova principalmente nel nucleo e nel plasma.Lo sviluppo della tecnologia di sequenziamento e della bioinformatica consente l'identificazione di numerosi nuovi lncRNA e li associa a funzioni biologiche.Evidenze cumulative suggeriscono che lncRNA è ampiamente coinvolto nella regolazione epigenetica, nella regolazione della trascrizione e nella regolazione post-trascrizione.
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Sequenziamento di piccoli RNA-Illumina
Small RNA si riferisce a una classe di molecole di RNA non codificanti che di solito hanno una lunghezza inferiore a 200 nt, inclusi micro RNA (miRNA), Small Interference RNA (siRNA) e RNA piwi-interacting (piRNA).
Il microRNA (miRNA) è una classe di piccolo RNA endogeno con una lunghezza di circa 20-24 nt, che svolge una varietà di importanti ruoli regolatori nelle cellule.miRNA coinvolti in molti processi vitali che rivelano un'espressione specifica del tessuto - specifico e stadio - e altamente conservati in diverse specie.
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Sequenziamento di circRNA-Illumina
Il sequenziamento dell'intero trascrittoma è progettato per profilare tutti i tipi di molecole di RNA, inclusi gli RNA codificanti (mRNA) e non codificanti (inclusi lncRNA, circRNA e miRNA) che vengono trascritti da cellule specifiche in un determinato momento.Il sequenziamento dell'intero trascrittoma, noto anche come "sequenziamento dell'RNA totale" mira a rivelare reti regolatorie complete a livello di trascrittoma.Sfruttando la tecnologia NGS, le sequenze di interi prodotti del trascrittoma sono disponibili per l'analisi del ceRNA e l'analisi dell'RNA articolare, che fornisce il primo passo verso la caratterizzazione funzionale.Rivelando la rete regolatoria del ceRNA basato su circRNA-miRNA-mRNA.
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Sequenziamento dell'intero trascrittoma – Illumina
Il sequenziamento dell'intero trascrittoma è progettato per profilare tutti i tipi di molecole di RNA, inclusi gli RNA codificanti (mRNA) e non codificanti (inclusi lncRNA, circRNA e miRNA) che vengono trascritti da cellule specifiche in un determinato momento.Il sequenziamento dell'intero trascrittoma, noto anche come "sequenziamento dell'RNA totale" mira a rivelare reti regolatorie complete a livello di trascrittoma.Sfruttando la tecnologia NGS, le sequenze di interi prodotti del trascrittoma sono disponibili per l'analisi del ceRNA e l'analisi dell'RNA articolare, che fornisce il primo passo verso la caratterizzazione funzionale.Rivelando la rete regolatoria del ceRNA basato su circRNA-miRNA-mRNA.
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Sequenziamento dell'RNA procariotico
Il sequenziamento dell'RNA procariotico utilizza il sequenziamento di nuova generazione (NGS) per rivelare la presenza e la quantità di RNA in un dato momento, analizzando il trascrittoma cellulare mutevole.Il sequenziamento dell'RNA procariotico della nostra azienda mira specificamente ai procarioti con genomi di riferimento, fornendo profili del trascrittoma, analisi della struttura genica, ecc. È stato ampiamente applicato alla ricerca scientifica di base, alla ricerca e sviluppo di farmaci e altro ancora.
Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenziamento del metatrascrittoma
Il sequenziamento del metatrascrittoma identifica l'espressione genica dei microbi (sia eucarioti che procarioti) all'interno di ambienti naturali (es. suolo, acqua, mare, feci e intestino.). Nello specifico, questo servizio consente di ottenere la profilazione dell'intera espressione genica di comunità microbiche complesse, analisi tassonomica di specie, analisi di arricchimento funzionale di geni diversamente espressi e altro ancora.
Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000
