Sequenziamento di piccoli RNA-Illumina
Caratteristiche
● Selezione delle dimensioni dell'RNA prima della preparazione della libreria
● Analisi bioinformatica incentrata sulla previsione dei miRNA e sui loro obiettivi
Vantaggi del servizio
●Analisi bioinformatica completa:consentendo l'identificazione di miRNA sia noti che nuovi, l'identificazione dei bersagli dei miRNA e la corrispondente annotazione funzionale e l'arricchimento con più database (KEGG, GO)
●Controllo qualità rigoroso: implementiamo punti di controllo fondamentali in tutte le fasi, dalla preparazione dei campioni e delle librerie al sequenziamento e alla bioinformatica.Questo meticoloso monitoraggio garantisce la fornitura di risultati costantemente di alta qualità.
●Supporto post-vendita: Il nostro impegno si estende oltre il completamento del progetto con un periodo di servizio post-vendita di 3 mesi.Durante questo periodo, offriamo follow-up del progetto, assistenza per la risoluzione dei problemi e sessioni di domande e risposte per rispondere a qualsiasi domanda relativa ai risultati.
●Ampia competenza: con un track record di chiusura con successo di molteplici progetti sRNA che coprono oltre 100 specie in vari settori di ricerca, il nostro team apporta una vasta esperienza a ogni progetto.
Requisiti e consegna del campione
| Biblioteca | piattaforma | Dati consigliati | Controllo qualità dei dati |
| Taglia selezionata | Illumina SE50 | 10M-20M letture | Q30≥85% |
Requisiti del campione:
Nucleotidi:
| Concentrazione (ng/μl) | Quantità (μg) | Purezza | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | DE260/280=1,7-2,5 DE260/230=0,5-2,5 Contaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata sul gel. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevazione della linea di base limitata o assente |
● Piante:
Radice, stelo o petalo: 450 mg
Foglia o seme: 300 mg
Frutta: 1,2 g
● Animale:
Cuore o Intestino: 450 mg
Visceri o cervello: 240 mg
Muscolo: 600 mg
Ossa, capelli o pelle: 1,5 g
● Artropodi:
Insetti: 9 g
Crostacei: 450 mg
● Sangue intero: 2 tubi
● Celle: 106 cellule
● Siero e plasma:6 ml
Consegna del campione consigliata
Contenitore:
Provetta da centrifuga da 2 ml (la carta stagnola non è consigliata)
Etichettatura del campione: Gruppo+replica, ad esempio A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Spedizione:
1. Ghiaccio secco: i campioni devono essere confezionati in sacchetti e sepolti nel ghiaccio secco.
2.Provette RNAstable: i campioni di RNA possono essere essiccati in provette di stabilizzazione dell'RNA (ad esempio RNAstable®) e spediti a temperatura ambiente.
Flusso di lavoro del servizio
Progettazione dell'esperimento
Consegna del campione
Estrazione dell'RNA
Costruzione della biblioteca
Sequenziamento
Analisi dei dati
Servizi post-vendita
Bioinformatica
Identificazione dei miRNA: struttura e profondità
Espressione differenziale dei miRNA – clustering gerarchico
Annotazione funzionale del target di miRNA espressi in modo differenziale
Esplora i progressi della ricerca facilitati dai servizi di sequenziamento dell'sRNA di BMKGene attraverso una raccolta curata di pubblicazioni.
Chen, H. et al.(2023) "Le infezioni virali inibiscono la biosintesi e la fotosintesi della saponina nel Panax notoginseng", Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038.doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) "La proteina FREE1 contenente il dominio FYVE della pianta si associa ai componenti del microprocessore per reprimere la biogenesi dei miRNA", riporta EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) "Il microRNA Ame-Bantam-3p controlla lo sviluppo delle pupe larvali prendendo di mira il gene multiplo simile al fattore di crescita epidermico 8 (megf8) nell'ape mellifera, Apis mellifera", International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726.doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) "L'analisi integrata di MiRNA e geni associati alla qualità della carne rivela che Gga-MiR-140-5p influisce sulla deposizione di grasso intramuscolare nei polli", Fisiologia cellulare e biochimica, 46(6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
