Sequenziamento del bisolfito a rappresentazione ridotta (RRBS)
Specifiche del servizio
Piattaforma: piattaforma NovaSeq, PE150
Tipo di libreria: libreria di DNA trattata con bisolfito con inserto da 200-400 bp
Strategia di sequenziamento: Paired-End 150 bp
Output dati consigliato: 10 Gb di dati grezzi/campione
Requisiti del campione
Quantità di DNA: ≥ 2ug
Concentrazione del DNA: ≥ 20 ng/μl.
Purezza: OD260/280 = da 1,8 a 2,0 senza degradazione o contaminazione da RNA
Analisi bioinformatica
Flusso di lavoro del servizio
Consegna del campione
Costruzione della biblioteca
Sequenziamento
Analisi dei dati
Servizi post-vendita
a.Statistiche di allineamento del genoma di riferimento
Statistiche delle letture di mappatura
Sstatistiche della profondità di sequenziamento e della copertura del sito C
Acopertura cumulata
Defficienza di igestione di ciascun campione
b.Rilevazione del sito di metilazione
Elenco dei livelli di metilazione nel sito C
BConversione S
Mcitosina etilata
Distribuzione del livello di metilazione
c.Mappa della metilazione
Ga livello di enome
Gelemento enomico
d.Confronto dei livelli di metilazione tra i campioni
PCorrelazione aerea della metilazione CG
PMetilazione CA-CG
Clucentezza della metilazione CG
d.Analisi differenziale della metilazione
Sstatistiche del DMR
Distribuzione della lunghezza DMR
Hmangia la mappa
DDistribuzione MR nella regione target
