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Sequenziamento dell'RNA a nucleo singolo
Il progresso nella tecnica di cattura di singole cellule e di costruzione di librerie individuali, combinato con il sequenziamento ad alto rendimento, consente studi di espressione genica cellula per cellula.Consente un'analisi del sistema più profonda e completa su popolazioni cellulari complesse, in cui evita in gran parte il mascheramento della loro eterogeneità prendendo la media di tutte le cellule.
Tuttavia, alcune cellule non sono adatte per essere trasformate in sospensione unicellulare, quindi sono necessari altri metodi di preparazione del campione, ad esempio l'estrazione del nucleo dai tessuti, ovvero il nucleo viene estratto direttamente dai tessuti o dalla cellula e preparato in sospensione a nucleo singolo per sequenziamento cellulare.
BMK fornisce il servizio di sequenziamento di RNA a singola cellula basato su Genomics ChromiumTM 10×.Questo servizio è stato ampiamente utilizzato in studi relativi a malattie, come la differenziazione delle cellule immunitarie, l'eterogeneità del tumore, lo sviluppo dei tessuti, ecc.
Chip del trascrittoma spaziale: 10× Genomica
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
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Trascrittoma spaziale BMKMANU S1000
La trascrittomica spaziale è all’avanguardia nell’innovazione scientifica e consente ai ricercatori di approfondire intricati modelli di espressione genetica all’interno dei tessuti preservandone al tempo stesso il contesto spaziale.Tra varie piattaforme, BMKGene ha sviluppato il chip per trascrittoma spaziale BMKManu S1000, che vanta unrisoluzione miglioratadi 5μM, raggiungendo la gamma subcellulare e consentendoimpostazioni di risoluzione multilivello.Il chip S1000, caratterizzato da circa 2 milioni di spot, utilizza micropozzetti stratificati con sfere caricate con sonde di cattura con codice a barre spaziali.Una libreria di cDNA, arricchita con codici a barre spaziali, viene preparata dal chip S1000 e successivamente sequenziata sulla piattaforma Illumina NovaSeq.La combinazione di campioni con codici a barre spaziali e UMI garantisce l'accuratezza e la specificità dei dati generati.L'attributo unico del chip BMKManu S1000 risiede nella sua versatilità, offrendo impostazioni di risoluzione multilivello che possono essere regolate con precisione su diversi tessuti e livelli di dettaglio.Questa adattabilità posiziona il chip come una scelta eccezionale per diversi studi di trascrittomica spaziale, garantendo un preciso clustering spaziale con un rumore minimo.
Utilizzando il chip BMKManu S1000 e altre tecnologie di trascrittomica spaziale, i ricercatori possono acquisire una migliore comprensione dell'organizzazione spaziale delle cellule e delle complesse interazioni molecolari che si verificano all'interno dei tessuti, fornendo preziose informazioni sui meccanismi alla base dei processi biologici in un'ampia gamma di campi, tra cui oncologia, neuroscienze, biologia dello sviluppo, immunologia e studi botanici.
Piattaforma: chip BMKManu S1000 e Illumina NovaSeq
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10x trascrittoma spaziale Genomics Visium
La trascrittomica spaziale è una tecnologia all’avanguardia che consente ai ricercatori di studiare i modelli di espressione genetica all’interno dei tessuti preservandone il contesto spaziale.Una potente piattaforma in questo ambito è 10x Genomics Visium abbinato al sequenziamento Illumina.Il principio di 10X Visium si basa su un chip specializzato con un'area di cattura designata in cui vengono posizionate le sezioni di tessuto.Quest'area di cattura contiene punti con codice a barre, ciascuno corrispondente a una posizione spaziale unica all'interno del tessuto.Le molecole di RNA catturate dal tessuto vengono quindi etichettate con identificatori molecolari univoci (UMI) durante il processo di trascrizione inversa.Questi punti con codice a barre e UMI consentono una mappatura spaziale precisa e una quantificazione dell'espressione genica con una risoluzione di singola cellula.La combinazione di campioni con codici a barre spaziali e UMI garantisce l'accuratezza e la specificità dei dati generati.Utilizzando questa tecnologia di trascrittomica spaziale, i ricercatori possono acquisire una comprensione più profonda dell'organizzazione spaziale delle cellule e delle complesse interazioni molecolari che si verificano all'interno dei tessuti, offrendo informazioni preziose sui meccanismi alla base dei processi biologici in molteplici campi, tra cui oncologia, neuroscienze, biologia dello sviluppo, immunologia. e studi botanici.
Piattaforma: 10X Genomics Visium e Illumina NovaSeq
