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PacBio-Trascrittoma a lunghezza intera (non di riferimento)

Prendendo come input i dati di sequenziamento delle isoforme di Pacific Biosciences (PacBio), questa app è in grado di identificare sequenze di trascrizione a lunghezza intera (senza assemblaggio).Mappando sequenze a lunghezza intera rispetto al genoma di riferimento, le trascrizioni possono essere ottimizzate da geni, trascrizioni, regioni codificanti noti, ecc. In questo caso, è possibile ottenere un'identificazione più accurata delle strutture dell'mRNA, come lo splicing alternativo, ecc.L'analisi congiunta con i dati di sequenziamento del trascrittoma NGS consente un'annotazione più completa e una quantificazione più accurata dell'espressione a livello di trascrizione, il che avvantaggia ampiamente l'espressione differenziale a valle e l'analisi funzionale.


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