Punti salienti
In questo webinar di due ore, è per noi un grande onore aver invitato sei esperti nel campo della genomica delle colture.I nostri relatori forniranno un'interpretazione approfondita di due studi genomici sulla segale, recentemente pubblicati suGenetica della natura:
1. L'assemblaggio del genoma su scala cromosomica fornisce approfondimenti sulla biologia, l'evoluzione e il potenziale agronomico della segale
2. Un assemblaggio genomico di alta qualità evidenzia le caratteristiche genomiche della segale e i geni agronomicamente importanti
Inoltre, siamo lieti di avere uno scienziato senior di ricerca e sviluppo di Biomarker Technologies per condividere la sua esperienza nell'assemblaggio del genoma de novo.
ordine del giorno
09:00 CET
Osservazioni di benvenuto
Zheng Hong-kun
Fondatore e CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Presidente della Scuola di Scienze Agrarie Avanzate dell'Università di Pechino
09:15
Miglioramento del miglioramento della segale, del triticale e del frumento attraverso l'utilizzo di una sequenza genomica di riferimento di alta qualità
In questo webinar, il Prof. Wang ci ha fornito aggiornamenti generali sullo stato attuale della ricerca genomica sulle triticeae e ha dimostrato il successo e le scoperte dei due eccezionali lavori sugli studi sul genoma della segale, che sono stati recentemente pubblicati su Nature Genetics e introducono l'intera ricerca gruppi che guidano e contribuiscono ai lavori.
09:25
Genomica dei cereali @ IPK Gatersleben
Le erbe dei cereali della tribù delle Triticeae sono state un'importante fonte di cibo nelle regioni temperate, che sono state a lungo considerate un punto caldo per il miglioramento e la selezione delle colture.Tra tutte le specie coltivate, questa tribù è famosa per le sue caratteristiche genomiche estremamente complesse, tra cui grandi dimensioni del genoma, alto contenuto di TE, poliploidia, ecc. In questa sessione, il Prof. Nils Stein ci ha fornito un'introduzione generale sull'IPK Gatersleben e sullo stato attuale dei cereali ricerca genomica@IPK Gatersleben.
09:35
L’assemblaggio del genoma su scala cromosomica fornisce approfondimenti sulla biologia, l’evoluzione e il potenziale agronomico della segale
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Istituto Leibniz di genetica vegetale e ricerca sui piani colturali (IPK)La segale (Secale cereale L.) è una coltura di cereali eccezionalmente resistente al clima, ampiamente utilizzata per produrre varietà di grano migliorate tramite ibridazione introgressiva e che possiede l'intero repertorio di geni necessari per consentire la selezione ibrida.La segale è allogama e addomesticata solo di recente, il che dà alla segale coltivata l’accesso a un pool genetico selvatico diversificato e sfruttabile.Per migliorare ulteriormente il potenziale agronomico della segale, abbiamo prodotto un assemblaggio annotato su scala cromosomica del genoma della segale da 7,9 Mbp e ne abbiamo validato ampiamente la qualità utilizzando una serie di risorse genetiche molecolari.Dimostriamo le applicazioni di questa risorsa con un'ampia gamma di indagini.Presentiamo i risultati sull'isolamento genetico incompleto della segale coltivata dai parenti selvatici, sui meccanismi di evoluzione strutturale del genoma, sulla resistenza agli agenti patogeni, sulla tolleranza alle basse temperature, sui sistemi di controllo della fertilità per la selezione ibrida e sui benefici in termini di resa delle introgressioni di segale e grano.
10:05
Un assemblaggio del genoma di alta qualità evidenzia le caratteristiche genomiche della segale e i geni agronomicamente importanti
La segale è una preziosa coltura alimentare e foraggera, un'importante risorsa genetica per il miglioramento del grano e del triticale e un materiale indispensabile per efficienti studi genomici comparativi sulle graminacee.Qui abbiamo sequenziato il genoma della segale Weining, una varietà di segale cinese d'élite.I contig assemblati (7,74 Gb) rappresentavano il 98,47% della dimensione stimata del genoma (7,86 Gb), con il 93,67% dei contig (7,25 Gb) assegnato a sette cromosomi.Gli elementi ripetitivi costituivano il 90,31% del genoma assemblato.Rispetto ai genomi Triticeae precedentemente sequenziati, i retrotrasposoni Daniela, Sumaya e Sumana hanno mostrato una forte espansione nella segale.Ulteriori analisi dell'assemblaggio di Weining hanno gettato nuova luce sulle duplicazioni geniche dell'intero genoma e sul loro impatto sui geni della biosintesi dell'amido, sulle organizzazioni fisiche dei complessi loci della prolamina, sulle caratteristiche dell'espressione genica alla base del tratto iniziale dell'intestazione e sulle presunte regioni cromosomiche e loci cromosomici associati all'addomesticamento nella segale.Questa sequenza del genoma promette di accelerare gli studi genomici e di selezione della segale e delle colture di cereali correlate.
10:35
Sfide, soluzioni e futuro per l'assemblaggio del genoma de novo
Il genoma di alta qualità è la base dello studio genomico.Sebbene il rapido sviluppo del sequenziamento e dell'algoritmo abbia consentito un assemblaggio del genoma molto più semplice ed efficiente, anche i requisiti di accuratezza e completezza dell'assemblaggio stanno aumentando con l'approfondimento degli obiettivi di ricerca.In questo discorso discuterò delle attuali tecnologie popolari nell'assemblaggio del genoma con diversi casi di successo e darò uno sguardo allo sviluppo futuro.
Orario di pubblicazione: 08 gennaio 2022