Esplorare i modelli di espressione genetica nella posizione originale di un organismo è fondamentale per comprendere i tipi e le funzioni delle sue cellule.Tuttavia, gli attuali metodi di analisi del trascrittoma spaziale presentano limitazioni come una bassa produttività o una risoluzione insufficiente.Il chip spaziale BMKMANU S1000, sviluppato da BMKMANU, è in grado di rilevare informazioni sull'espressione genica in situ in sezioni di tessuto complete a risoluzione subcellulare, consentendo un'interpretazione sfumata della struttura del tessuto.
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Componenti del prodotto
Il chip spaziale BMKMANU S1000 e il kit di reagenti corrispondenti includono:
1) Kit di ottimizzazione dei tessuti, contenente reagenti per l'ottimizzazione dei tessuti (esplorazione del tempo ottimale per la permeabilizzazione dei tessuti).
2) Kit di espressione genica, contenente reagenti per la cattura di mRNA in fette di tessuto per la successiva preparazione e sequenziamento della libreria.
3) Kit di avvio: include un adattatore termostatico e un separatore magnetico per trascrittoma.
Principio tecnico
Il chip è basato su micropori e microsfere e l'mRNA può essere catturato in situ attraverso Oligo sulle microsfere.L'Oligo è composto da quattro parti: Read1, Spatial Barcode, UMI e Poly(dT)VN.Dopo che il tessuto è stato attaccato al chip, l'mRNA viene rilasciato dal tessuto da un enzima di permeabilizzazione.Poiché la maggior parte delle estremità 3' dell'mRNA hanno una coda Poly-A, vengono catturate da Oligo con Poly(dT)VN.Dopo l'amplificazione RT-PCR e del cDNA, la preparazione e il sequenziamento delle librerie, il tracciamento della posizione spaziale viene ottenuto tramite il codice a barre spaziale.Ciò consente l'analisi dell'espressione genica in posizioni spaziali e nell'eterogeneità dei tessuti.
Vantaggi del prodotto
Applicazioni
Può essere applicato alla maggior parte delle aree della ricerca biologica e medica, tra cui tumori, malattie, immunologia e biologia dello sviluppo, contribuendo a raggiungere nuove scoperte in questi campi con l'analisi dell'espressione spaziale a risoluzione subcellulare.
● Tumore e malattia:
Eterogeneità spaziale e microambiente di tumori e malattie
Insorgenza e sviluppo di tumori e malattie
Risposta terapeutica di tumori e malattie
●Biologia dello sviluppo
Atlante spaziotemporale degli organi
Meccanismi di regolazione genica durante lo sviluppo
●Risposta allo stress
Risposta allo stress biotico
Risposta allo stress abiotico
●Immunologia
Risposta immunitaria nel trapianto d'organo
Meccanismi immunitari di tumori e malattie
Patogenesi delle malattie autoimmuni
●Analisi della resistenza ai farmaci
Meccanismi di resistenza ai farmaci
Ricerca e sviluppo di nuovi farmaci
Casi e dati dimostrativi
Le prestazioni di BMKMANU S1000 sono state verificate in centinaia di casi su diversi tipi di tessuto.
