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Sequenziamento dell'intero esoma umano

Il sequenziamento dell’intero esoma (WES) è considerato una strategia di sequenziamento economicamente vantaggiosa per identificare le mutazioni che causano malattie.Sebbene gli esoni occupino solo circa l'1,7% dell'intero genoma, rappresentano direttamente il profilo delle funzioni proteiche totali.Nel genoma umano, è stato riportato che oltre l'85% delle mutazioni correlate alla malattia si verificano nella regione codificante la proteina.

BMKGENE offre servizi completi e flessibili di sequenziamento dell'intero esoma umano con diverse strategie di cattura degli esoni disponibili per soddisfare vari obiettivi di ricerca.

Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq


Dettagli del servizio

Risultati dimostrativi

Vantaggi del servizio

● Regione codificante delle proteine ​​mirata: catturando e sequenziando la regione codificante delle proteine, hWES viene utilizzato per rivelare varianti correlate alla struttura delle proteine;
● Alta precisione: con un'elevata profondità di sequenziamento, hWES facilita il rilevamento di varianti comuni e varianti rare con frequenze inferiori all'1%;
● Conveniente: hWES produce circa l'85% delle mutazioni di malattie umane dall'1% del genoma umano;
● Cinque rigorose procedure di controllo qualità che coprono l'intero processo con Q30>85% garantito.

Specifiche del campione

piattaforma

 

Biblioteca

 

Strategia di cattura degli esoni

 

 Consigliare la strategia di sequenziamento

 

 

 

Piattaforma Illumina NovaSeq

 

PE150

Agilent SureSelect Human All Exon V6

Pannello IDT xGen Exome Hyb V2

5 GB

10 GB

Requisiti del campione

Tipo di campione

 

 Quantità(Qubit®)

 

Volume

 

 Concentrazione

 

 

 Purezza(NanoDrop™)

 

DNA genomico

 

≥ 300ng
≥ 15 µl
≥ 20 ng/μL
 
DE260/280=1,8-2,0
 
nessun degrado, nessuna contaminazione

 

Profondità di sequenziamento consigliata

Per disturbi mendeliani/malattie rare: profondità di sequenziamento effettiva superiore a 50×
Per campioni tumorali: profondità di sequenziamento effettiva superiore a 100×

Bioinformatica

Flusso di lavoro WES_BI_Disease-01
Flusso di lavoro WES_BI_Tumore-01

Flusso di lavoro del servizio

consegna del campione

Consegna del campione

Esperimento pilota

Estrazione del DNA

Preparazione della biblioteca

Costruzione della biblioteca

Sequenziamento

Sequenziamento

Analisi dei dati

Analisi dei dati

数据上传-01

Consegna dei dati

Servizi post vendita

Servizi post-vendita


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  • Prossimo:

  • 1.Statistiche di allineamento

    Tabella 1 Statistiche dei risultati della mappa

     

    wps_doc_19

    Tabella 2 Statistiche sulla cattura dell'esoma

    wps_doc_2

    2.Rilevamento delle variazioni

    Figura 1 Statistiche di SNV e InDel

    wps_doc_4

    wps_doc_3


     

    3.Analisi avanzata

    Figura 2 Grafico Circos di SNV e InDel dannosi a livello genomico

    wps_doc_5 wps_doc_6

    Tabella 3 Screening dei geni che causano malattie

    wps_doc_7 wps_doc_8 wps_doc_9

     

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