Lo studio di associazione sull'intero genoma (GWAS) mira a identificare varianti genetiche (genotipo) associate a tratti specifici (fenotipo).Gli studi GWA indagano i marcatori genetici che attraversano l'intero genoma di un gran numero di individui e prevedono associazioni genotipo-fenotipo mediante analisi statistica a livello di popolazione.Il risequenziamento dell’intero genoma può potenzialmente scoprire tutte le varianti genetiche.Insieme ai dati fenotipici, il GWAS può essere elaborato per identificare SNP, QTL e geni candidati correlati al fenotipo, il che sostiene fortemente la moderna selezione di animali/piante.SLAF è una strategia di sequenziamento del genoma semplificata auto-sviluppata, che scopre marcatori distribuiti sull'intero genoma, SNP.Questi SNP, come marcatori genetici molecolari, possono essere elaborati per studi di associazione con tratti mirati.È una strategia economicamente vantaggiosa per identificare tratti complessi associati a variazioni genetiche.
