Un'importante caratteristica orticola che distingue le arance navel dalle altre varietà comuni di arance dolci è la presenza di un'arancia navel sul frutto.Questa caratteristica è anche un criterio importante per la classificazione delle varietà orticole di arancia dolce.
I clienti di BMKGENE hanno utilizzato la tecnologia di sequenziamento SLAF sviluppata autonomamente da BMKGENE per condurre uno studio intitolato "Geni di estrazione correlati alla qualità della frutta nelle arance dolci sulla base del sequenziamento di frammenti amplificati di locus specifico.“
Lo studio ha coinvolto il sequenziamento di 240 risorse di germoplasma di arancia dolce con ampia diversità genetica e diverse origini geografiche, ottenendo 497,82 Mb di dati di lettura breve.L'analisi dei dati ha prodotto 1.467.968 genotipi SNP nell'intero genoma.Utilizzando l'analisi Fst, lo studio ha identificato 6 geni candidati correlati alla presenza di un ombelico, al peso del frutto e all'acidità titolabile, fornendo una base per il miglioramento mirato delle varietà di arance dolci.
Per il sequenziamento della popolazione su larga scala, il sequenziamento dei frammenti amplificati con locus specifico (SLAF) è più conveniente ed altamente efficace rispetto al sequenziamento dell'intero genoma (WGS).
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Orario di pubblicazione: 05-dic-2023