BMKGENE ha fornito servizi di sequenziamento completo del trascrittoma utilizzando le tecnologie PacBio e ONT per uno studio intitolato "Analisi comparativa dei metodi di sequenziamento dell'RNA PacBio e ONT per l'identificazione del veleno di Nemopilema Nomurai", che è stato pubblicato sulla rivista Genomics.Lo studio mirava a confrontare l’efficacia dei metodi di sequenziamento dell’RNA PacBio e ONT nell’identificazione del veleno della specie di medusa Nemopilema nomurai.
I risultati dello studio suggeriscono che ONT generalmente ha prodotto una qualità dei dati grezzi più elevata nell’analisi del trascrittoma, mentre PacBio ha generato lunghezze di lettura più lunghe.PacBio si è rivelato superiore nell'identificare sequenze codificanti e RNA non codificante a catena lunga, mentre ONT era più conveniente nel prevedere eventi di splicing alternativo, semplici ripetizioni di sequenze e fattori di trascrizione.
Questo studio ha implicazioni significative per le future tecnologie di sequenziamento delle meduse marine ed evidenzia il potere dell’analisi del trascrittoma a lunghezza intera nella scoperta di potenziali bersagli terapeutici per la dermatite da medusa.
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Orario di pubblicazione: 20 dicembre 2023