Il 20 maggio è la Giornata Mondiale delle Api!Le api sono impollinatori essenziali che contribuiscono alla diversità e alla produttività degli ecosistemi, nonché alla produzione di colture alimentari che nutrono sia gli esseri umani che gli animali.
L’ape mellifera asiatica è un’importante specie impollinatrice che svolge un ruolo vitale nell’agricoltura e nei servizi ecosistemici.La bozza del genoma di A. cerana è stata pubblicata utilizzando la tecnologia NGS nel 2015, che era altamente frammentata e priva di impalcature a livello cromosomico, rendendo necessario ottenere sequenze genomiche più complete e accurate.
Uno dei casi di successo di BMKGENE, un team di ricercatori provenienti da Cina e Australia ha pubblicato un nuovo studio intitolato “A Chromosome-Scale Assembly of the Asian Honeybee Apis cerana Genome”.In questo studio, presentano un assemblaggio su scala cromosomica altamente contiguo del genoma di A. cerana utilizzando una combinazione di sequenziamento a lettura lunga PacBio e dati Hi-C.L'insieme aggiornato ha una dimensione di 215,67 Mb con un contig N50 di 4,49 Mb, che rappresenta un miglioramento di 212 volte rispetto alla precedente versione basata su Illumina.Il nuovo assemblaggio ha avuto anche una maggiore completezza, con il 97,6% dei BUSCO presenti, contro solo l'86,9% dell'assemblaggio precedente.I ricercatori hanno condotto analisi genomiche più accurate e complete, come la previsione di nuovi geni e il rilevamento di variazioni strutturali, che potrebbero avere importanti implicazioni per la comprensione della biologia e dell'evoluzione di questa specie.
BMKEGENE possiede una vasta esperienza nell'assemblaggio di genomi di alta qualità e non vede l'ora di fornirvi i nostri servizi.
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Orario di pubblicazione: 22 maggio 2023