●Piattaforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten e BGI-DNB-T7
●Modalità di sequenziamento:PE50, PE100, PE150, PE250
●Controllo di qualità delle librerie prima del sequenziamento
●Sequenziamento della consegna dei dati e QC:consegna del report QC e dei dati grezzi in formato fastq dopo aver demultiplexato e filtrato le letture Q30.
●Versatilità dei servizi di sequenziamento:il cliente può scegliere di sequenziare per corsia, cella a flusso o quantità di dati.
●Versatilità delle piattaforme:Le librerie DNB possono essere trasferite su piattaforme Illumina
●Vasta esperienza sulla piattaforma di sequenziamento Illumina:con migliaia di progetti chiusi con varie specie.
●Consegna del rapporto QC del sequenziamento:con metriche di qualità, accuratezza dei dati e prestazioni complessive del progetto di sequenziamento.
●Processo di sequenziamento maturo:con tempi di consegna brevi.
●Controllo qualità rigoroso: implementiamo severi requisiti di controllo qualità per garantire la fornitura di risultati costantemente di alta qualità.
Quantità di dati (X) | Concentrazione (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50 GB | ≥ 2 nM | ≥ 20 µl |
50 GB ≤ X < 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 20 µl |
X ≥ 100 GB | ≥ 4 nM | ≥ 20 µl |
piattaforma | Concentrazione (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 µl |
NovaSeq 6000SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 µl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
NovaSeqX | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
Oltre alla concentrazione e alla quantità totale, è necessario anche un adeguato schema dei picchi.
Prima del sequenziamento viene fornito un rapporto sulla qualità della libreria, valutando la quantità e la frammentazione della libreria.
Tabella 1. Statistiche sui dati di sequenziamento.
ID campione | BMKID | Letture crude | Dati grezzi (bp) | Letture pulite (%) | Q20(%) | Q30(%) | GA(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione della qualità lungo le letture in ciascun campione
Figura 2. Distribuzione del contenuto di base
Figura 3. Distribuzione dei contenuti letti nei dati di sequenziamento