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Trascrittoma spaziale BMKMANU S1000

L'organizzazione spaziale delle cellule svolge un ruolo vitale in vari processi biologici, come l'infiltrazione immunitaria, lo sviluppo dell'embrione, ecc. Il sequenziamento del trascrittoma spaziale, che indica il profilo dell'espressione genica conservando le informazioni sulla posizione spaziale, ha fornito grandi informazioni sull'architettura dei tessuti a livello del trascrittoma.Con lo sviluppo della tecnologia, la morfologia del tessuto ultrachiaro e la reale differenza strutturale dell'espressione molecolare spaziale devono essere studiate con una risoluzione più elevata.BMKGENE fornisce un servizio completo e unico di sequenziamento del trascrittoma spaziale, dai campioni agli approfondimenti biologici.

Le tecnologie di trascrittomica spaziale hanno potenziato nuove prospettive in diversi ambiti di ricerca risolvendo il profilo di espressione genetica con contenuto spaziale in campioni eterogenei.

Chip del trascrittoma spaziale: BMKMANU S1000

Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq

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Dettagli del servizio

Bioinformatica

Risultati dimostrativi

Schema tecnico del trascrittoma spaziale BMKMANU S1000

Vantaggi di BMKMANU S1000

1) Risoluzione subcellulare: ciascuna area di cattura conteneva >2 milioni di spot spaziali con codice a barre con un diametro di 2,5 µm e una spaziatura di 5 µm tra i centri degli spot, consentendo l'analisi del trascrittoma spaziale con risoluzione subcellulare (5 µm).

2) Analisi di risoluzione multilivello: analisi multilivello flessibile che va da 100 μm a 5 μm per risolvere diverse caratteristiche dei tessuti con una risoluzione ottimale.

3) Profilazione completa del trascrittoma: è possibile analizzare le trascrizioni catturate dall'intero vetrino di tessuto, senza restrizioni sul numero di geni bersaglio e sull'area bersaglio.

Specifiche del servizio

Biblioteca	Strategia di sequenziamento	Consigliato l'output dei dati
Libreria di cDNA S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60 Gb/campione

Requisiti del campione

Campione	Numero	Misurare	Qualità dell'RNA
Blocco di tessuto incorporato OCT	2-3 blocchi/campione	ca.6,8x6,8x6,8mm³	RIN≥7

Per ulteriori dettagli sulla guida alla preparazione dei campioni e sul flusso di lavoro del servizio, non esitate a parlare con aEsperto di BMKGENE

Flusso di lavoro del servizio

Progettazione dell'esperimento

Consegna del campione

Pre-esperimento

Codici a barre spaziali

Costruzione della biblioteca

Sequenziamento

Analisi dei dati

Servizi post-vendita

Precedente: 10x trascrittoma spaziale Genomics Visium

Prossimo: Sequenziamento dell'intero genoma di piante/animali

I dati generati da BMKMANU S1000 vengono analizzati utilizzando il software "BSTMatrix", progettato in modo indipendente da BMKGENE, tra cui:

1) Generazione di matrici di espressione genica
2) Elaborazione delle immagini HE
3) Compatibile con software di terze parti a valle per l'analisi
4) “BSTViewer” online aiuta a ottenere risultati di visualizzazione a diverse risoluzioni.

1.Cluster di punti

s1000 (4)