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Trascrittoma PacBio-Full-Length (senza riferimento)
La piattaforma Amplicon (16S/18S/ITS) è stata sviluppata con anni di esperienza nell'analisi di progetti sulla diversità microbica, che contiene analisi di base standardizzate e analisi personalizzate: l'analisi di base copre il contenuto dell'analisi principale dell'attuale ricerca microbica, il contenuto dell'analisi è ricco e completo, e i risultati dell'analisi sono presentati sotto forma di relazioni di progetto;Il contenuto dell'analisi personalizzata è vario.I campioni possono essere selezionati e i parametri possono essere impostati in modo flessibile in base al rapporto di analisi di base e allo scopo della ricerca, per realizzare requisiti personalizzati.Sistema operativo Windows, semplice e veloce.
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Trascrittoma PacBio-Full-Length (senza riferimento)
Prendendo come input i dati di sequenziamento isoforme di Pacific Biosciences (PacBio), questa app è in grado di identificare sequenze di trascrizione a lunghezza intera (senza assemblaggio).Mappando sequenze a lunghezza intera rispetto al genoma di riferimento, le trascrizioni possono essere ottimizzate da geni noti, trascrizioni, regioni codificanti, ecc. In questo caso, è possibile ottenere un'identificazione più accurata delle strutture dell'mRNA, come lo splicing alternativo, ecc.L'analisi congiunta con i dati di sequenziamento del trascrittoma NGS consente un'annotazione più completa e una quantificazione più accurata nell'espressione a livello di trascrizione, il che avvantaggia ampiamente l'espressione differenziale a valle e l'analisi funzionale.
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Kit di strumenti
BMKCloud è una piattaforma bioinformatica leader che fornisce una soluzione completa per i programmi genomici, ampiamente considerata dai ricercatori in vari settori tra cui medico, agricolo, ambientale, ecc. BMKCloud si impegna a fornire servizi integrati, affidabili ed efficienti, comprese piattaforme e strumenti di analisi bioinformatica , risorse informatiche, database pubblico, corsi bioinformatici online, ecc. BMKCloud ha vari strumenti bioinformatici utilizzati di frequente tra cui annotazione genica, strumenti genetici evolutivi, ncRNA, controllo della qualità dei dati, assemblaggio, allineamento, estrazione dei dati, mutazioni, statistiche, generatore di figure, sequenza analisi, ecc.
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piccolo RNA
I piccoli RNA sono un tipo di RNA corto non codificante con una lunghezza media di 18-30 nt, inclusi miRNA, siRNA e piRNA.È stato ampiamente segnalato che questi piccoli RNA sono coinvolti in vari processi biologici come la degradazione dell'mRNA, l'inibizione della traduzione, la formazione di eterocromatina, ecc. L'analisi del sequenziamento del piccolo RNA è stata ampiamente applicata negli studi sullo sviluppo di animali/piante, malattie, virus, ecc. Piccolo RNA la piattaforma di analisi del sequenziamento consiste in analisi standard e data mining avanzato.Sulla base dei dati RNA-seq, l'analisi standard può ottenere l'identificazione e la previsione del miRNA, la previsione del gene target del miRNA, l'annotazione e l'analisi dell'espressione.L'analisi avanzata consente la ricerca e l'estrazione di miRNA personalizzate, la generazione di diagrammi di Venn, il miRNA e la creazione di reti di geni target.
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NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS è una piattaforma di analisi di ri-sequenziamento dell'intero genoma, sviluppata sulla base di una ricca esperienza nelle tecnologie dei biomarcatori.Questa piattaforma facile da usare consente l'invio rapido di un flusso di lavoro di analisi integrato semplicemente impostando alcuni parametri di base, che si adattano ai dati di sequenziamento del DNA generati sia dalla piattaforma Illumina che dalla piattaforma di sequenziamento BGI.Questa piattaforma è implementata su server di elaborazione ad alte prestazioni, che consente un'analisi dei dati altamente efficiente in un tempo molto limitato.Il data mining personalizzato è disponibile sulla base di analisi standard, inclusa la query del gene mutato, la progettazione di primer PCR, ecc.
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mRNA (riferimento)
Il trascrittoma è il collegamento tra l'informazione genetica genomica e il proteoma della funzione biologica.La regolazione del livello trascrizionale è la modalità di regolazione degli organismi più importante e più studiata.Il sequenziamento del trascrittoma può sequenziare il trascrittoma in qualsiasi momento o in qualsiasi condizione, con una risoluzione accurata fino a un singolo nucleotide. Può riflettere dinamicamente il livello di trascrizione genica, identificare e quantificare simultaneamente trascrizioni rare e normali e fornire le informazioni strutturali di campioni di trascrizioni specifiche.
Attualmente, la tecnologia di sequenziamento del trascrittoma è stata ampiamente utilizzata in agronomia, medicina e altri campi di ricerca, tra cui la regolamentazione dello sviluppo di animali e piante, l'adattamento ambientale, l'interazione immunitaria, la localizzazione dei geni, l'evoluzione genetica delle specie e il rilevamento di tumori e malattie genetiche.
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Metagenomica (NGS)
Questa piattaforma di analisi è progettata per l'analisi dei dati metagenomici dei fucili sulla base di anni di esperienza.Consiste in un flusso di lavoro integrato contenente varie analisi metagenomiche comunemente necessarie, tra cui elaborazione dei dati, studi a livello di specie, studi a livello di funzione genica, binning del metagenoma, ecc. Inoltre, sono disponibili strumenti di data mining personalizzati sul flusso di lavoro di analisi standard, tra cui query di geni e specie , impostazione parametri, generazione di cifre personalizzate, ecc.
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LncRNA
Gli RNA lunghi non codificanti (lncRNA) sono un tipo di trascrizioni con lunghezza superiore a 200 nt, che non sono in grado di codificare proteine.Prove cumulative suggeriscono che è molto probabile che la maggior parte degli lncRNA sia funzionale.Le tecnologie di sequenziamento ad alto rendimento e gli strumenti di analisi bioinformatica ci consentono di rivelare sequenze di lncRNA e informazioni di posizionamento in modo più efficiente e ci portano a scoprire lncRNA con funzioni regolatorie cruciali.BMKCloud è orgogliosa di fornire ai nostri clienti la piattaforma di analisi del sequenziamento lncRNA per ottenere un'analisi lncRNA veloce, affidabile e flessibile.
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GWA
Lo studio di associazione dell'intero genoma (GWAS) mira a identificare le varianti genetiche (genotipo) associate a tratti specifici (fenotipo).Gli studi GWA studiano i marcatori genetici che attraversano l'intero genoma di un gran numero di individui e predicono le associazioni genotipo-fenotipo mediante analisi statistiche a livello di popolazione.Il risequenziamento dell'intero genoma può potenzialmente scoprire tutte le varianti genetiche.Accoppiandosi con dati fenotipici, GWAS può essere elaborato per identificare SNP, QTL e geni candidati correlati al fenotipo, il che supporta fortemente l'allevamento di animali/piante moderno.SLAF è una strategia di sequenziamento del genoma semplificata auto-sviluppata, che scopre marcatori distribuiti sull'intero genoma, SNP.Questi SNP, come marcatori genetici molecolari, possono essere elaborati per studi di associazione con tratti mirati.È una strategia economicamente vantaggiosa per identificare tratti complessi associati a variazioni genetiche.
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Nanopore Trascrittomica a lunghezza intera
Le isoforme alternative complesse e variabili negli organismi sono meccanismi genetici importanti per la regolazione dell'espressione genica e della diversità proteica.L'accurata identificazione delle strutture di trascrizione è la base per uno studio approfondito dei modelli di regolazione dell'espressione genica.La piattaforma di sequenziamento dei nanopori ha portato con successo lo studio trascrittomico a livello di isoforma.Questa piattaforma di analisi è progettata per analizzare i dati RNA-Seq generati sulla piattaforma Nanopore sulla base del genoma di riferimento, che ottiene analisi qualitative e quantitative sia a livello di geni che di trascrizioni.
