Mikil skilvirkni merkjauppgötvunar- Röðunartækni með mikilli afköst aðstoðar SLAF-Seq við að uppgötva hundruð þúsunda merkja innan alls erfðamengisins.
Lítið háð erfðamenginu- Það er hægt að nota á tegundir annað hvort með eða án viðmiðunarerfðamengis.
Sveigjanleg kerfishönnun- Single-ensím, tví-ensím, fjöl-ensím melting og ýmsar tegundir af ensímum, allt er hægt að velja til að koma til móts við mismunandi rannsóknarmarkmið eða tegundir.Format í silico er notað til að tryggja ákjósanlega ensímhönnun.
Skilvirk ensímmelting- Fortilraun var gerð til að hámarka aðstæður, sem gerir formtilraunina stöðuga og áreiðanlega.Skilvirkni brotasöfnunar getur náð yfir 95%.
Jafnt dreift SLAF merki- SLAF merki dreifast jafnt í öllum litningum að mestu leyti og ná að meðaltali 1 SLAF á 4 kb.
Skilvirkt forðast endurtekningar- Endurtekin röð í SLAF-Seq gögnum minnkar niður í lægri en 5%, sérstaklega í tegundum með mikið magn endurtekningar, eins og hveiti, maís o.s.frv.
Mikil reynsla-Yfir 2000 lokuð SLAF-Seq verkefni á hundruðum tegunda sem ná yfir plöntur, spendýr, fugla, skordýr, vatnalífverur o.fl.
Sjálf þróað lífupplýsingavinnuflæði- Samþætt lífupplýsingavinnuflæði fyrir SLAF-Seq var þróað af BMKGENE til að tryggja áreiðanleika og nákvæmni lokaúttaks.
Pallur | Samþ.(ng/gl) | Samtals (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Bind>15μl) | 1,6-2,5 |
Röðunardýpt: 10X/Tag
Erfðamengi stærð | Mælt er með SLAF merkjum |
< 500 Mb | 100K eða WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 K |
1 Gb -2 Gb | 200 K |
Risastór eða flókin erfðamengi | 300 - 400 þúsund |
Umsóknir
| Mælt er með Mannfjöldakvarði
| Röð stefnu og dýpt
| |
Dýpt
| Merkinúmer
| ||
GWAS
| Sýnisnúmer ≥ 200
| 10X
|
Samkvæmt erfðamengi stærð
|
Erfðafræðileg þróun
| Einstaklingar hvers og eins undirhópur ≥ 10; heildarsýni ≥ 30
| 10X
|
Ílát: 2 ml skilvindurör
Fyrir flest sýni mælum við með að varðveita ekki í etanóli.
Merking sýnis: Sýnishorn þurfa að vera greinilega merkt og eins og framlagt sýnishorn upplýsingaeyðublaðs.
Sending: Þurrís: Fyrst þarf að pakka sýnum í poka og grafa í þurrís.
1. Tölfræði yfir kortaniðurstöðu
2. SLAF merkjaþróun
3. Fráviksskýring
Ár | Tímarit | IF | Titill | Umsóknir |
2022 | Náttúrusamskipti | 17.694 | Erfðafræðilegur grunnur gíga-litninga og gíga-erfðamengis trjábóna Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
2015 | Nýr plantafræðingur | 7.433 | Heimilisfótspor festa erfðafræðileg svæði sem eru mikilvæg í landbúnaði sojabaunir | SLAF-GWAS |
2022 | Journal of Advanced Research | 12.822 | Erfðamengi gervi innrás Gossypium barbadense inn í G. hirsutum sýna betri staðsetningar til að bæta gæði og afrakstur bómullartrefja samtímis eiginleikar | SLAF-Þróunarerfðafræði |
2019 | Sameindaplanta | 10,81 | Íbúaerfðafræðileg greining og De Novo Assembly sýna uppruna Weedy Hrísgrjón sem þróunarleikur | SLAF-Þróunarerfðafræði |
2019 | Náttúruerfðafræði | 31.616 | Erfðaefnisröð og erfðafræðilegur fjölbreytileiki karpsins, Cyprinus carpio | SLAF-Linkage kort |
2014 | Náttúruerfðafræði | 25.455 | Erfðamengi ræktaðra hneta veitir innsýn í karyotýpur belgjurta, fjöllitna þróun og ræktun ræktunar. | SLAF-Linkage kort |
2022 | Plöntulíftækniblað | 9.803 | Auðkenning á ST1 sýnir úrval sem felur í sér hitchhighhiking á formgerð fræs og olíuinnihald við tæmingu sojabauna | SLAF-Marker þróun |
2022 | International Journal of Molecular Sciences | 6.208 | Auðkenning og þróun DNA-merkja fyrir Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D) Disomic Chromosome Substitution | SLAF-Marker þróun |