BMKCloud Log in
条形 banner-03

Vörur

Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Arfgerð með miklum afköstum, sérstaklega á stórum stofnum, er grundvallarskref í rannsóknum á erfðatengslum, sem gefur erfðafræðilegan grunn fyrir starfræna genauppgötvun, þróunargreiningu o.s.frv. ) er kynnt til að lágmarka raðgreiningarkostnað á hvert sýni, en viðhalda hæfilegri skilvirkni við uppgötvun erfðamerkja.Þetta er almennt náð með því að draga út takmörkunarbrot innan tiltekins stærðarsviðs, sem er nefnt minnkað framsetningasafn (RRL).SLAF-Seq) er sjálfþróuð aðferð fyrir SNP arfgerð með eða án viðmiðunarerfðamengis.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur


Upplýsingar um þjónustu

Niðurstöður kynningar

Valin rit

Upplýsingar um þjónustu

Tækniáætlun

111

Vinnuflæði

流程图

Þjónustukostir

Mikil skilvirkni merkjauppgötvunar- Röðunartækni með mikilli afköst aðstoðar SLAF-Seq við að uppgötva hundruð þúsunda merkja innan alls erfðamengisins.

Lítið háð erfðamenginu- Það er hægt að nota á tegundir annað hvort með eða án viðmiðunarerfðamengis.

Sveigjanleg kerfishönnun- Single-ensím, tví-ensím, fjöl-ensím melting og ýmsar tegundir af ensímum, allt er hægt að velja til að koma til móts við mismunandi rannsóknarmarkmið eða tegundir.Format í silico er notað til að tryggja ákjósanlega ensímhönnun.

Skilvirk ensímmelting- Fortilraun var gerð til að hámarka aðstæður, sem gerir formtilraunina stöðuga og áreiðanlega.Skilvirkni brotasöfnunar getur náð yfir 95%.

Jafnt dreift SLAF merki- SLAF merki dreifast jafnt í öllum litningum að mestu leyti og ná að meðaltali 1 SLAF á 4 kb.

Skilvirkt forðast endurtekningar- Endurtekin röð í SLAF-Seq gögnum minnkar niður í lægri en 5%, sérstaklega í tegundum með mikið magn endurtekningar, eins og hveiti, maís o.s.frv.

Mikil reynsla-Yfir 2000 lokuð SLAF-Seq verkefni á hundruðum tegunda sem ná yfir plöntur, spendýr, fugla, skordýr, vatnalífverur o.fl.

Sjálf þróað lífupplýsingavinnuflæði- Samþætt lífupplýsingavinnuflæði fyrir SLAF-Seq var þróað af BMKGENE til að tryggja áreiðanleika og nákvæmni lokaúttaks.

 

Þjónustulýsingar

 

Pallur

Samþ.(ng/gl)

Samtals (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(Bind>15μl)

1,6-2,5

Athugið: Þrjú sýni, hvert með þremur ensímkerfum, verða tekin fyrir fortilraun.

Mælt er með raðsetningarstefnu

Röðunardýpt: 10X/Tag

Erfðamengi stærð

Mælt er með SLAF merkjum

< 500 Mb

100K eða WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 Gb -2 Gb

200 K

Risastór eða flókin erfðamengi

300 - 400 þúsund

 

Umsóknir

 

Mælt er með

Mannfjöldakvarði

 

Röð stefnu og dýpt

 

Dýpt

 

Merkinúmer

 

GWAS

 

Sýnisnúmer ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

Samkvæmt

erfðamengi stærð

 

Erfðafræðileg þróun

 

Einstaklingar hvers og eins

undirhópur ≥ 10;

heildarsýni ≥ 30

 

10X

 

Mælt er með sýnishornafhendingu

Ílát: 2 ml skilvindurör

Fyrir flest sýni mælum við með að varðveita ekki í etanóli.

Merking sýnis: Sýnishorn þurfa að vera greinilega merkt og eins og framlagt sýnishorn upplýsingaeyðublaðs.

Sending: Þurrís: Fyrst þarf að pakka sýnum í poka og grafa í þurrís.

Þjónustuverkflæði

Dæmi um QC
Tilraun
SLAF tilraun
Undirbúningur bókasafns
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu

Dæmi um QC

Tilraun

SLAF-tilraun

Undirbúningur bókasafns

Röðun

Gagnagreining

Þjónusta eftir sölu


  • Fyrri:
  • Næst:

  • 1. Tölfræði yfir kortaniðurstöðu

    mynd 1

    A1

    2. SLAF merkjaþróun

    A2

    3. Fráviksskýring

    A3

    Ár

    Tímarit

    IF

    Titill

    Umsóknir

    2022

    Náttúrusamskipti

    17.694

    Erfðafræðilegur grunnur gíga-litninga og gíga-erfðamengis trjábóna

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    Nýr plantafræðingur

    7.433

    Heimilisfótspor festa erfðafræðileg svæði sem eru mikilvæg í landbúnaði

    sojabaunir

    SLAF-GWAS

    2022

    Journal of Advanced Research

    12.822

    Erfðamengi gervi innrás Gossypium barbadense inn í G. hirsutum

    sýna betri staðsetningar til að bæta gæði og afrakstur bómullartrefja samtímis

    eiginleikar

    SLAF-Þróunarerfðafræði

    2019

    Sameindaplanta

    10,81

    Íbúaerfðafræðileg greining og De Novo Assembly sýna uppruna Weedy

    Hrísgrjón sem þróunarleikur

    SLAF-Þróunarerfðafræði

    2019

    Náttúruerfðafræði

    31.616

    Erfðaefnisröð og erfðafræðilegur fjölbreytileiki karpsins, Cyprinus carpio

    SLAF-Linkage kort

    2014

    Náttúruerfðafræði

    25.455

    Erfðamengi ræktaðra hneta veitir innsýn í karyotýpur belgjurta, fjöllitna

    þróun og ræktun ræktunar.

    SLAF-Linkage kort

    2022

    Plöntulíftækniblað

    9.803

    Auðkenning á ST1 sýnir úrval sem felur í sér hitchhighhiking á formgerð fræs

    og olíuinnihald við tæmingu sojabauna

    SLAF-Marker þróun

    2022

    International Journal of Molecular Sciences

    6.208

    Auðkenning og þróun DNA-merkja fyrir Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D)

    Disomic Chromosome Substitution

    SLAF-Marker þróun

    fáðu tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu okkur

    Sendu skilaboðin þín til okkar: