Lítið RNA

Lítil RNA eru tegund af stuttu RNA sem ekki er kóðað með meðallengd 18-30 nt, þar á meðal miRNA, siRNA og piRNA.Greint hefur verið frá því að þessi litlu RNA taki þátt í ýmsum líffræðilegum ferlum eins og mRNA niðurbroti, þýðingarhömlun, heterókrómatínmyndun o.s.frv. SmallRNA raðgreiningu hefur verið víða beitt í rannsóknum á þróun dýra/plantna, sjúkdóma, veira o.s.frv. raðgreiningarvettvangur samanstendur af staðlaðri greiningu og háþróaðri gagnavinnslu.Á grundvelli RNA-seq gagna getur staðlað greining náð miRNA auðkenningu og spá, miRNA markgena spá, athugasemd og tjáningargreiningu.Ítarleg greining gerir kleift að sérsniðna miRNA leit og útdrátt, gerð Venn skýringarmynda, uppbyggingu miRNA og miðgena netkerfis.