Vörur

Einkjarna RNA röðun

Framfarir í handtöku stakrar frumu og byggingartækni einstakra bókasafna í sameiningu við raðgreiningu með mikilli afköst gerir genatjáningarrannsóknum á frumu-fyrir-frumu grundvelli.Það gerir dýpri og fullkomna kerfisgreiningu á flóknum frumuhópum kleift, þar sem það forðast að mestu leyti að hylja misleitni þeirra með því að taka meðaltal allra frumna.

Sumar frumur henta hins vegar ekki til að búa til einfrumu sviflausn, þannig að aðrar aðferðir til undirbúnings sýna – nauðsynlegt er að draga kjarna úr vefjum, það er að segja að kjarni er dreginn beint úr vefjum eða frumu og útbúinn í einskjarna sviflausn fyrir einn-kjarna frumuröðun.

BMK veitir 10× Genomics ChromiumTM byggða einfrumu RNA raðgreiningarþjónustu.Þessi þjónusta hefur verið mikið notuð í rannsóknum á sjúkdómatengdum rannsóknum, svo sem aðgreiningu ónæmisfrumna, misleitni æxla, þróun vefja o.fl.

Spatial transcriptome chip: 10× Genomics

Pallur: Illumina NovaSeq pallur

Hafðu samband við okkur

Upplýsingar um þjónustu

Lífupplýsingafræði

Niðurstöður kynningar

Tæknileg meginregla

Einangrun kjarna er náð með 10× Genomics ChromiumTM, sem samanstendur af átta rása örvökvakerfi með tvöföldum krossum.Í þessu kerfi eru gelperlur með strikamerkjum og grunni, ensímum og einum kjarna hjúpuð í nanólítra-stærð olíudropa, sem myndar Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Þegar GEM hefur myndast er frumugreining og slepping strikamerkja framkvæmd í hverjum GEM.mRNA eru öfug umrituð í cDNA sameindir með 10× strikamerkjum og UMI, sem eru frekar háðar stöðluðu raðgreiningarsafni.

Vefur hentar ekki til undirbúnings einfrumusviflausnar

Fruma / vefur	Ástæða
Óferskur frosinn vefur	Ekki er hægt að fá ný eða lengi vistuð samtök
Vöðvafrumur, Megakaryocyte, Fita…	Þvermál frumunnar er of stórt til að komast inn í tækið
Lifur…	Of viðkvæmt til að brjóta, ófær um að greina stakar frumur
Taugafrumur, heili…	Næmari, auðvelt að stressa sig á, mun breyta niðurstöðum raðgreiningarinnar
Bris, skjaldkirtill…	Ríkt af innrænum ensímum sem hafa áhrif á framleiðslu einfrumusviflausnar

Einfruma vs einfruma

Einkjarna	Einfruma
Ótakmarkað frumuþvermál	Þvermál frumu: 10-40 μm
Efnið getur verið frosinn vefur	Efnið verður að vera ferskur vefur
Lítið álag á frosnum frumum	Ensímmeðferð getur valdið frumustreituviðbrögðum
Ekki þarf að fjarlægja rauð blóðkorn	Fjarlægja þarf rauð blóðkorn
Kjarnorka tjáir lífupplýsingar	Öll fruman tjáir lífupplýsingar

Þjónustulýsingar

Bókasafn

Röðunarstefna

Gagnamagn

Dæmi um kröfur

Vefur

10× Genomics einkjarna bókasafn

10x Genomics -Illumina PE150

100.000 lestur/klefi u.þ.b.100-200 Gb

Hólfnúmer: >2× 10⁵

Frumusamþ.við 700-1.200 frumur/μL

≥ 200 mg

Fyrir frekari upplýsingar um leiðbeiningar um undirbúning sýnishorns og þjónustuvinnuflæði, vinsamlegast ekki hika við að tala við aBMKGENE sérfræðingur