-
BSA
Bulked Segregant Analysis pallur samanstendur af eins þrepa staðlaðri greiningu og háþróaðri greiningu með sérsniðnum færibreytum.BSA er tækni sem notuð er til að bera kennsl á svipgerðartengd erfðamerki fljótt.Helstu vinnuflæði BSA inniheldur: 1. að velja tvo hópa einstaklinga með afar andstæðar svipgerðir;2. sameina DNA, RNA eða SLAF-seq (Þróað af Biomarker) allra einstaklinga til að mynda tvö magn af DNA;3. að bera kennsl á mismunandi raðir gegn viðmiðunarerfðamengi eða þar á milli, 4. spá fyrir um tengd svæði með ED og SNP-vísitölu reiknirit;5. Virknigreining og auðgun á genum á umsækjendum svæðum o.s.frv. Ítarlegri námuvinnslu í gögnum, þ.mt erfðamerkjaskimun og grunnhönnun er einnig fáanleg.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) vettvangur er þróaður með margra ára reynslu í verkefnagreiningu á fjölbreytileika örvera, sem inniheldur staðlaða grunngreiningu og persónulega greiningu: grunngreining nær yfir almennt greiningarinnihald núverandi örverurannsókna, greiningarinnihaldið er mikið og yfirgripsmikið, og greiningarniðurstöður eru settar fram í formi verkefnaskýrslna;Innihald einstaklingsmiðaðrar greiningar er fjölbreytt.Hægt er að velja sýni og stilla færibreytur á sveigjanlegan hátt í samræmi við grunngreiningarskýrsluna og rannsóknartilganginn, til að gera sérsniðnar kröfur.Windows stýrikerfi, einfalt og hratt.
-
Þróunarerfðafræði
Þróunarerfðafræði er pakkað raðgreiningarþjónusta sem er hönnuð til að veita yfirgripsmikla túlkun á þróunarupplýsingum tiltekinna efna sem byggjast á erfðabreytileika, þar á meðal SNP, InDels, SVs og CNVs.Það veitir alla grundvallargreiningu sem þarf til að lýsa þróunarbreytingum og erfðafræðilegum eiginleikum íbúa, svo sem stofngerð, erfðafræðilegan fjölbreytileika, tengslamyndun o.s.frv. Það inniheldur einnig rannsóknir á genaflæði, sem gerir kleift að meta árangursríka stofnstærð, frávikstíma.
-
Samanburður erfðafræði
Samanburður erfðafræði þýðir bókstaflega að bera saman heilar erfðamengisraðir og uppbyggingu mismunandi tegunda.Þessi fræðigrein miðar að því að sýna tegundaþróun, genavirkni, genastjórnunarkerfi á erfðamengistigi með því að bera kennsl á raðbyggingar og þætti sem varðveittu eða aðgreindu milli mismunandi tegunda.Dæmigerð samanburðarrannsókn á erfðafræði felur í sér greiningar í genafjölskyldu, þróunarþróun, fjölföldun í heilu erfðamengi, sértækur þrýstingur osfrv.
-
Þróunarerfðafræði
Mannfjölda- og þróunarfræðileg erfðagreiningarvettvangur er stofnaður á grundvelli gríðarlegrar reynslu sem hefur safnast innan BMK R&D teymisins í mörg ár.Það er notendavænt tól sérstaklega fyrir vísindamenn sem eru ekki með aðalnám í lífupplýsingafræði.Þessi vettvangur gerir grunngreiningu sem tengist þróunarerfðafræði, þar með talið trébyggingu, tengingarójafnvægisgreiningu, erfðafræðilegum fjölbreytileikamati, sértækri sópgreiningu, skyldleikagreiningu, PCA, greiningu á stofngerð o.s.frv.
-
Hi-C byggt erfðamengi samkoma
Hi-C er aðferð sem er hönnuð til að fanga uppsetningu litninga með því að sameina rannsakandi nálægðarsamskipti og raðgreiningu með mikilli afköstum.Talið er að styrkleiki þessara víxlverkana sé í neikvæðri fylgni við líkamlega fjarlægð á litningum.Þess vegna gætu Hi-C gögn leiðbeint þyrping, röðun og stefnumótun samsettra raða í drögum erfðamengis og festingu þeirra á ákveðinn fjölda litninga.Þessi tækni styrkir erfðamengissamsetningu á litningastigi í fjarveru erfðakorts sem byggir á íbúafjölda.Hvert einasta erfðamengi þarf Hi-C.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur / DNBSEQ
-
Plöntu/dýr De Novo erfðamengi röðun
De NovoMeð raðgreiningu er átt við byggingu alls erfðamengis tegundar með því að nota raðgreiningartækni, td PacBio, Nanopore, NGS, o.s.frv., þar sem ekki er til viðmiðunarerfðamengi.Hin ótrúlega framför í lestrarlengd þriðju kynslóðar raðgreiningartækni hefur fært ný tækifæri við að setja saman flókin erfðamengi, eins og þau sem eru með mikla arfblendni, hátt hlutfall endurtekinna svæða, fjöllitna o.s.frv. úrlausn endurtekinna þátta, svæði með óeðlilegt GC innihald og önnur mjög flókin svæði.
Pallur: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq pallur
-
Human Whole Exome Sequencing
Litið er á heila exome raðgreiningu (WES) sem hagkvæma raðgreiningaraðferð til að greina stökkbreytingar sem valda sjúkdómum.Þó að exons taki aðeins upp um það bil 1,7% af öllu erfðamengi, táknar það prófíl heildarpróteinvirkni beint.Í erfðamengi mannsins hefur verið greint frá því að meira en 85% sjúkdómstengdra stökkbreytinga eigi sér stað á próteinkóða svæði.
BMKGENE býður upp á yfirgripsmikla og sveigjanlega raðgreiningarþjónustu fyrir mannlega heild með mismunandi exon-fangaaðferðum til að mæta ýmsum rannsóknarmarkmiðum.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Arfgerð með miklum afköstum, sérstaklega á stórum stofnum, er grundvallarskref í rannsóknum á erfðatengslum, sem gefur erfðafræðilegan grunn fyrir starfræna genauppgötvun, þróunargreiningu o.s.frv. ) er kynnt til að lágmarka raðgreiningarkostnað á hvert sýni, en viðhalda hæfilegri skilvirkni við uppgötvun erfðamerkja.Þetta er almennt náð með því að draga út takmörkunarbrot innan tiltekins stærðarsviðs, sem er nefnt minnkað framsetningasafn (RRL).SLAF-Seq) er sjálfþróuð aðferð fyrir SNP arfgerð með eða án viðmiðunarerfðamengis.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur -
Illumina og BGI
Illumina raðgreiningartækni, sem byggir á Sequencing by Synthesis (SBS), er NGS nýsköpun sem hefur verið tekin fyrir á heimsvísu, sem ber ábyrgð á að búa til yfir 90% af raðgreiningargögnum heimsins.Meginreglan um SBS felur í sér að mynda flúrljómandi merkta afturkræfa terminators þar sem hverju dNTP er bætt við og síðan klofið til að leyfa innlimun næsta basa.Þar sem öll fjögur afturkræf terminator-bundin dNTP eru til staðar í hverri raðlotu, lágmarkar náttúruleg samkeppni innlimunarskekkju.Þessi fjölhæfa tækni styður bæði einlesin og pöruð bókasöfn, sem hentar ýmsum erfðafræðilegum forritum.Hátt afköst og nákvæmni Illumina raðgreiningar staðsetja hana sem hornstein í erfðafræðirannsóknum, sem gerir vísindamönnum kleift að afhjúpa ranghala erfðamengis með óviðjafnanlegum smáatriðum og skilvirkni.
DNBSEQ, þróað af BGI, er önnur nýstárleg NGS tækni sem hefur tekist að lækka frekar niður röðunarkostnað og auka afköst.Undirbúningur DNBSEQ bókasöfnum felur í sér DNA sundrun, undirbúning ssDNA og rúllandi hringmögnun til að fá DNA nanókúlurnar (DNB).Þessum er síðan hlaðið á fast yfirborð og í kjölfarið raðað með combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Forsmíðaða raðgreiningarþjónustan okkar auðveldar viðskiptavinum að undirbúa raðgreiningarsöfn sín frá ýmsum aðilum (mRNA, heilu erfðamengi, amplicon o.fl.).Í kjölfarið er hægt að senda þessi söfn til raðgreiningarmiðstöðva okkar til gæðaeftirlits og raðgreiningar í Illumina eða BGI kerfum.
