-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq veitir erfðamengi-vítt snið á DNA markmiðum fyrir histónbreytingar, umritunarþætti og önnur DNA tengd prótein.Það sameinar sérhæfni krómatínónæmisútfellingar (ChIP) til að endurheimta sértækar prótein-DNA fléttur, með krafti næstu kynslóðar raðgreiningar (NGS) fyrir raðgreiningu með miklum afköstum á endurheimt DNA.Þar að auki, vegna þess að prótein-DNA flétturnar eru endurheimtar úr lifandi frumum, er hægt að bera saman bindistaði í mismunandi frumugerðum og vefjum, eða við mismunandi aðstæður.Umsóknir eru allt frá umritunarstjórnun til þroskaferla til sjúkdómsferla og víðar.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenome vísar til safns alls erfðaefnis úr blönduðu samfélagi lífvera, svo sem umhverfismetagenome, mannametagenome, osfrv. Það inniheldur erfðamengi bæði ræktanlegra og óræktanlegra örvera.Metagenomic raðgreining er sameindaverkfæri sem notað er til að greina blönduð erfðafræðileg efni sem dregin eru út úr umhverfissýnum, sem veitir nákvæmar upplýsingar um tegundafjölbreytileika og gnægð, stofnuppbyggingu, fylgjendatengsl, starfræn gen og fylgninet við umhverfisþætti.
Pallur:Illumina NovaSeq pallur
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics er sameindaverkfæri sem notað er til að greina blönduð erfðafræðileg efni sem dregin eru út úr umhverfissýnum, sem veitir nákvæmar upplýsingar um tegundafjölbreytileika og gnægð, stofngerð, fylgjutengsl, starfræn gen og fylgninet við umhverfisþætti o.s.frv. Nanopore raðgreiningarvettvangar hafa nýlega kynnt til metagenomic rannsókna.Framúrskarandi frammistaða þess í lestrarlengd jók að mestu leyti niðurstreymis metagenomic greiningu, sérstaklega metagenome samsetningu.Með því að nýta leslengdina, er Nanopore-undirstaða metagenomic rannsókn fær um að ná samfelldri samsetningu samanborið við haglabyssumetagenomics.Það hefur verið gefið út að metagenomics byggðar á Nanopore mynduðu með góðum árangri fullkomið og lokað bakteríuerfðamengi úr örverum (Moss, EL, et. al,Náttúrulíftækni, 2020)
Pallur:Nanopore PromethION P48
-
Bisúlfít raðgreining í heilu erfðamengi
DNA metýlering í fimmta stöðu í cýtósíni (5-mC) hefur grundvallaráhrif á tjáningu gena og frumuvirkni.Óeðlilegt metýleringarmynstur hefur verið tengt nokkrum sjúkdómum og sjúkdómum, svo sem krabbameini.WGBS hefur orðið gulls ígildi til að rannsaka erfðamengi-breiður metýleringu við eins basa upplausn.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Greining fyrir transposasa-aðgengilegu krómatíni með raðgreiningu með mikilli afköst (ATAC-seq)
ATAC-seq er raðgreiningaraðferð með mikilli afköstum til að greina aðgengi að litningi um allt erfðamengi, sem er mikilvægt fyrir alþjóðlega epigenetic stjórn á tjáningu gena.Raðunarmillistykki eru sett inn í opin litningasvæði með ofvirkum Tn5 transposasa.Eftir PCR mögnun er raðgreiningarsafn smíðað.Hægt er að fá öll opnu litningasvæðin undir sérstöku rúm-tíma ástandi, ekki aðeins takmörkuð við bindistaði umritunarþáttar eða ákveðið histón breytt svæði.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Undireiningin á 16S og 18S rRNA sem inniheldur bæði mjög varðveitt svæði og of breytileg svæði er fullkomið sameindafingrafar til að bera kennsl á dreifkjörnunga og heilkjörnunga lífvera.Með því að nýta sér raðgreiningu er hægt að miða á þessar þéttingar byggðar á varðveittu hlutunum og hægt er að greina ofur-breytilegu svæðin að fullu til örveruauðkenningar sem stuðlar að rannsóknum sem ná yfir örverufjölbreytileikagreiningu, flokkunarfræði, flokkun osfrv. Einsameind í rauntíma (SMRT) ) raðgreining PacBio vettvangs gerir kleift að fá mjög nákvæmar langar lestur, sem gætu náð yfir magnara í fullri lengd (u.þ.b. 1,5 Kb).Víðtæka sýn á erfðasviðið jók mjög upplausnina í tegundaskýringum í bakteríum eða sveppum.
Pallur:PacBio framhald II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS magnaröðun miðar að því að sýna fram á flokkun, flokkun og fjölda tegunda í örverusamfélagi með því að rannsaka PCR afurðir erfðavísa fyrir heimilishald sem innihalda bæði mjög umtalaða og ofbreytilega hluta.Kynning á þessum fullkomnu sameindafingraförum af Woeses o.fl., (1977) styrkir einangrunarlausa örverusnið.Raðgreining á 16S (bakteríum), 18S (sveppum) og innri umrituðu spacer (ITS, sveppir) gerir kleift að bera kennsl á bæði algengar tegundir sem og sjaldgæfar og óþekktar tegundir.Þessi tækni hefur orðið mikið notað og stórt tæki til að bera kennsl á mismunandi örverusamsetningu í ýmsum umhverfi, svo sem munni manna, þörmum, saur osfrv.
Pallur:Illumina NovaSeq pallur
-
Endurrað röð baktería og sveppa í heilu genamengi
Endurraðgreining á heilu erfðamengi baktería og sveppa er mikilvægt tæki til að fullkomna erfðamengi þekktra baktería og sveppa, sem og til að bera saman mörg erfðamengi eða kortleggja erfðamengi nýrra lífvera.Það er afar mikilvægt að raða heilu erfðamengi baktería og sveppa til að búa til nákvæm viðmiðunarerfðamengi, gera örveruauðkenningu og aðrar samanburðarrannsóknir á erfðamengi.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
PacBio 16S/18S/ITS magnaraöðun í fullri lengd
Amplicon (16S/18S/ITS) vettvangur er þróaður með margra ára reynslu í verkefnagreiningu á fjölbreytileika örvera, sem inniheldur staðlaða grunngreiningu og persónulega greiningu: grunngreining nær yfir almennt greiningarinnihald núverandi örverurannsókna, greiningarinnihaldið er mikið og yfirgripsmikið, og greiningarniðurstöður eru settar fram í formi verkefnaskýrslna;Innihald einstaklingsmiðaðrar greiningar er fjölbreytt.Hægt er að velja sýni og stilla færibreytur á sveigjanlegan hátt í samræmi við grunngreiningarskýrsluna og rannsóknartilganginn, til að gera sérsniðnar kröfur.Windows stýrikerfi, einfalt og hratt.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Reference)
Með því að taka Pacific Biosciences (PacBio) Isoform raðgreiningargögn sem inntak, er þetta forrit fær um að bera kennsl á afritsraðir í fullri lengd (án samsetningar).Með því að kortleggja raðir í fullri lengd á móti viðmiðunarerfðamengi er hægt að fínstilla umrit með þekktum genum, umritum, kóðunarsvæðum o.s.frv. Í þessu tilviki er hægt að ná nákvæmari auðkenningu á mRNA-byggingum, svo sem annarri splicing, osfrv.Sameiginleg greining með NGS transcriptome raðgreiningargögnum gerir ítarlegri skýringu og nákvæmari magngreiningu í tjáningu á umritsstigi, sem gagnast að miklu leyti niðurstreymis mismunatjáningu og virknigreiningu.
-
Minni birgða bísúlfít raðgreining (RRBS)
DNA metýleringarrannsóknir hafa alltaf verið mikið umræðuefni í sjúkdómsrannsóknum og eru nátengdar genatjáningu og svipgerðaeinkennum.RRBS er nákvæm, skilvirk og hagkvæm aðferð til rannsókna á DNA metýleringu.Auðgun verkefnis- og CpG eyjasvæða með ensímklofnun (Msp I), ásamt Bisulfite raðgreiningu, veitir háupplausn DNA metýleringargreiningar.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Dreifkjarna mRNA raðgreining
mRNA raðgreining styrkir alhliða prófílgreiningu allra mRNA umrita innan frumna við sérstakar aðstæður.Þessi háþróaða tækni þjónar sem öflugt tæki, afhjúpar flókna tjáningarsnið gena, genabyggingar og sameindakerfi sem tengjast fjölbreyttum líffræðilegum ferlum.MRNA raðgreining, sem er mikið notað í grundvallarrannsóknum, klínískri greiningu og lyfjaþróun, býður upp á innsýn í ranghala frumuvirkni og erfðastjórnun.Dreifkjörnunga-mRNA-sýnisvinnsla okkar er sniðin fyrir dreifkjörnunga umrit, sem felur í sér rRNA-eyðingu og stefnumótandi bókasafnsgerð.
Pallur: Illumina NovaSeq X
