-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenome vísar til safns alls erfðaefnis úr blönduðu samfélagi lífvera, svo sem umhverfismetagenome, mannametagenome, osfrv. Það inniheldur erfðamengi bæði ræktanlegra og óræktanlegra örvera.Metagenomic raðgreining er sameindaverkfæri sem notað er til að greina blönduð erfðafræðileg efni sem dregin eru út úr umhverfissýnum, sem veitir nákvæmar upplýsingar um tegundafjölbreytileika og gnægð, stofnuppbyggingu, fylgjendatengsl, starfræn gen og fylgninet við umhverfisþætti.
Pallur:Illumina NovaSeq pallur
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics er sameindaverkfæri sem notað er til að greina blönduð erfðafræðileg efni sem dregin eru út úr umhverfissýnum, sem veitir nákvæmar upplýsingar um tegundafjölbreytileika og gnægð, stofngerð, fylgjutengsl, starfræn gen og fylgninet við umhverfisþætti o.s.frv. Nanopore raðgreiningarvettvangar hafa nýlega kynnt til metagenomic rannsókna.Framúrskarandi frammistaða þess í lestrarlengd jók að mestu leyti niðurstreymis metagenomic greiningu, sérstaklega metagenome samsetningu.Með því að nýta leslengdina, er Nanopore-undirstaða metagenomic rannsókn fær um að ná samfelldri samsetningu samanborið við haglabyssumetagenomics.Það hefur verið gefið út að metagenomics byggðar á Nanopore mynduðu með góðum árangri fullkomið og lokað bakteríuerfðamengi úr örverum (Moss, EL, et. al,Náttúrulíftækni, 2020)
Pallur:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Undireiningin á 16S og 18S rRNA sem inniheldur bæði mjög varðveitt svæði og of breytileg svæði er fullkomið sameindafingrafar til að bera kennsl á dreifkjörnunga og heilkjörnunga lífvera.Með því að nýta sér raðgreiningu er hægt að miða á þessar þéttingar byggðar á varðveittu hlutunum og hægt er að greina ofur-breytilegu svæðin að fullu til örveruauðkenningar sem stuðlar að rannsóknum sem ná yfir örverufjölbreytileikagreiningu, flokkunarfræði, flokkun osfrv. Einsameind í rauntíma (SMRT) ) raðgreining PacBio vettvangs gerir kleift að fá mjög nákvæmar langar lestur, sem gætu náð yfir magnara í fullri lengd (u.þ.b. 1,5 Kb).Víðtæka sýn á erfðasviðið jók mjög upplausnina í tegundaskýringum í bakteríum eða sveppum.
Pallur:PacBio framhald II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS magnaröðun miðar að því að sýna fram á flokkun, flokkun og fjölda tegunda í örverusamfélagi með því að rannsaka PCR afurðir erfðavísa fyrir heimilishald sem innihalda bæði mjög umtalaða og ofbreytilega hluta.Kynning á þessum fullkomnu sameindafingraförum af Woeses o.fl., (1977) styrkir einangrunarlausa örverusnið.Raðgreining á 16S (bakteríum), 18S (sveppum) og innri umrituðu spacer (ITS, sveppir) gerir kleift að bera kennsl á bæði algengar tegundir sem og sjaldgæfar og óþekktar tegundir.Þessi tækni hefur orðið mikið notað og stórt tæki til að bera kennsl á mismunandi örverusamsetningu í ýmsum umhverfi, svo sem munni manna, þörmum, saur osfrv.
Pallur:Illumina NovaSeq pallur
-
Endurrað röð baktería og sveppa í heilu genamengi
Endurraðgreining á heilu erfðamengi baktería og sveppa er mikilvægt tæki til að fullkomna erfðamengi þekktra baktería og sveppa, sem og til að bera saman mörg erfðamengi eða kortleggja erfðamengi nýrra lífvera.Það er afar mikilvægt að raða heilu erfðamengi baktería og sveppa til að búa til nákvæm viðmiðunarerfðamengi, gera örveruauðkenningu og aðrar samanburðarrannsóknir á erfðamengi.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Metatranscriptome raðgreining
Metatranscriptome raðgreining auðkennir genatjáningu örvera (bæði heilkjörnunga og dreifkjörnunga) í náttúrulegu umhverfi (þ.e. jarðvegi, vatni, sjó, saur og þörmum.). Nánar tiltekið gerir þessi þjónusta þér kleift að fá heildar genatjáningarsnið flókinna örverusamfélaga, flokkunarfræðilega greiningu tegunda, virkniauðgunargreiningu á mismunandi tjáðum genum og fleira.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Erfðamengi sveppa
Biomarker Technologies veitir erfðamengi könnun, fínt erfðamengi og pena-heill erfðamengi sveppa eftir sérstökum rannsóknarmarkmiðum.Hægt er að ná fram raðgreiningu erfðamengis, samsetningu og hagnýtri skýringu með því að sameina næstu kynslóðar raðgreiningu + þriðju kynslóðar raðgreiningu til að ná háu stigi erfðamengissamsetningar.Einnig er hægt að nota Hi-C tækni til að auðvelda samsetningu erfðamengis á litningastigi.
Pallur:PacBio framhald II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq pallur
-
Bakteríur fullkomið erfðamengi
Biomarker Technologies veitir raðgreiningarþjónustu við að smíða fullkomið erfðamengi baktería með núllbili.Helstu verkflæði baktería fullkominnar erfðamengisbyggingar felur í sér þriðju kynslóðar raðgreiningu, samsetningu, virkniskýringar og háþróaða lífupplýsingagreiningu sem uppfyllir ákveðin rannsóknarmarkmið.Víðtækari útlistun á erfðamengi baktería gerir kleift að sýna grundvallaraðferðir sem liggja að baki líffræðilegum ferlum þeirra, sem gæti einnig veitt verðmæta viðmiðun fyrir erfðafræðilegar rannsóknir á hærri heilkjörnungategundum
Pallur:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq pallur
PacBio framhald II
