-
PacBio 16S/18S/ITS magnaraöðun í fullri lengd
Amplicon (16S/18S/ITS) vettvangur er þróaður með margra ára reynslu í verkefnagreiningu á fjölbreytileika örvera, sem inniheldur staðlaða grunngreiningu og persónulega greiningu: grunngreining nær yfir almennt greiningarinnihald núverandi örverurannsókna, greiningarinnihaldið er mikið og yfirgripsmikið, og greiningarniðurstöður eru settar fram í formi verkefnaskýrslna;Innihald einstaklingsmiðaðrar greiningar er fjölbreytt.Hægt er að velja sýni og stilla færibreytur á sveigjanlegan hátt í samræmi við grunngreiningarskýrsluna og rannsóknartilganginn, til að gera sérsniðnar kröfur.Windows stýrikerfi, einfalt og hratt.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Reference)
Með því að taka Pacific Biosciences (PacBio) Isoform raðgreiningargögn sem inntak, er þetta forrit fær um að bera kennsl á afritsraðir í fullri lengd (án samsetningar).Með því að kortleggja raðir í fullri lengd á móti viðmiðunarerfðamengi er hægt að fínstilla umrit með þekktum genum, umritum, kóðunarsvæðum o.s.frv. Í þessu tilviki er hægt að ná nákvæmari auðkenningu á mRNA-byggingum, svo sem annarri splicing, osfrv.Sameiginleg greining með NGS transcriptome raðgreiningargögnum gerir ítarlegri skýringu og nákvæmari magngreiningu í tjáningu á umritsstigi, sem gagnast að miklu leyti niðurstreymis mismunatjáningu og virknigreiningu.
-
Verkfærasett
BMKCloud er leiðandi lífupplýsingavettvangur sem býður upp á eina stöðvunarlausn fyrir erfðafræðiforrit, sem er víða treyst af vísindamönnum á ýmsum sviðum, þar á meðal læknisfræði, landbúnaði, umhverfismálum osfrv. BMKCloud hefur skuldbundið sig til að veita samþætta, áreiðanlega og skilvirka þjónustu, þ. , tölvuauðlindir, opinber gagnagrunnur, lífupplýsinganámskeið á netinu o.s.frv. BMKCloud hefur ýmis oft notuð lífupplýsingatæki, þar á meðal genaskýringar, þróunarerfðafræðilegar verkfæri, ncRNA, gæðaeftirlit með gögnum, samsetningu, röðun, gagnaútdrátt, stökkbreytingar, tölfræði, myndframleiðsla, röð greining o.s.frv.
-
lítið RNA
Lítil RNA eru tegund af stuttu RNA sem ekki er kóðað með meðallengd 18-30 nt, þar á meðal miRNA, siRNA og piRNA.Greint hefur verið frá því að þessi litlu RNA taki þátt í ýmsum líffræðilegum ferlum eins og mRNA niðurbroti, þýðingarhömlun, heterókrómatínmyndun o.s.frv. SmallRNA raðgreiningu hefur verið víða beitt í rannsóknum á þróun dýra/plantna, sjúkdóma, veira o.s.frv. raðgreiningarvettvangur samanstendur af staðlaðri greiningu og háþróaðri gagnavinnslu.Á grundvelli RNA-seq gagna getur staðlað greining náð miRNA auðkenningu og spá, miRNA markgena spá, athugasemd og tjáningargreiningu.Ítarleg greining gerir kleift að sérsniðna miRNA leit og útdrátt, gerð Venn skýringarmynda, uppbyggingu miRNA og miðgena netkerfis.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS er vettvangur fyrir endurraðgreiningu í heilu erfðamengi, sem er þróaður á grundvelli mikillar reynslu í Biomarker Technologies.Þessi vettvangur sem er auðveldur í notkun gerir kleift að senda inn samþætt greiningarverkflæði fljótt með því einfaldlega að stilla nokkrar grunnfæribreytur, sem passa fyrir DNA raðgreiningargögn sem myndast bæði frá Illumina vettvangi og BGI raðgreiningarvettvangi.Þessi vettvangur er settur á afkastamikinn tölvuþjón, sem gerir mjög skilvirka gagnagreiningu kleift á mjög takmörkuðum tíma.Persónuleg gagnavinnsla er fáanleg á grundvelli staðlaðrar greiningar, þar á meðal stökkbreytt genafyrirspurn, PCR grunnhönnun osfrv.
-
mRNA (tilvísun)
Transcriptome er tengslin milli erfðafræðilegra erfðaupplýsinga og prótein líffræðilegrar virkni.Umritunarstigsstjórnun er mikilvægasti og mest rannsakaði stjórnunarmáti lífvera.Umskriftaröðun getur raðgreint umritið hvenær sem er eða við hvaða aðstæður sem er, með upplausn sem er nákvæm að einu núkleótíði. Hún getur endurspeglað á breytilegan hátt umritunarstig gena, samtímis auðkennt og magngreint sjaldgæf og eðlileg umrit og veitt byggingarupplýsingar um sýnishorn tiltekinna afrita.
Sem stendur hefur umritunarraðgreiningartækni verið mikið notuð í búfræði, læknisfræði og öðrum rannsóknasviðum, þar á meðal dýra- og plantnaþróunarreglugerð, umhverfisaðlögun, ónæmissamspil, staðsetning gena, erfðafræðilega þróun tegunda og uppgötvun æxla og erfðasjúkdóma.
-
Metagenomics (NGS)
Þessi greiningarvettvangur er hannaður fyrir metagenomic gagnagreiningu á haglabyssu á grundvelli margra ára reynslu.Það samanstendur af samþættu verkflæði sem inniheldur ýmsar algengar metagenomics greiningar, þar á meðal gagnavinnslu, tegundarannsóknir, genavirknistigsrannsóknir, metagenome binning, o.s.frv. Að auki eru sérsniðin gagnavinnsluverkfæri fáanleg á stöðluðu greiningarverkflæði, þar á meðal gena- og tegundafyrirspurn , færibreytustillingu, persónulega myndgerð o.s.frv.
-
LncRNA
Löng ókóðun RNA (lncRNA) eru tegund afrita með lengri lengd en 200 nt, sem geta ekki kóðað prótein.Uppsöfnuð sönnunargögn benda til þess að flest lncRNA séu mjög líkleg til að vera virk.Röðunartækni með miklum afköstum og lífupplýsingagreiningartæki gera okkur kleift að sýna lncRNA raðir og staðsetningarupplýsingar á skilvirkari hátt og leiða okkur til að uppgötva lncRNA með mikilvægum eftirlitsaðgerðum.BMKCloud er stolt af því að veita viðskiptavinum okkar lncRNA raðgreiningarvettvang til að ná hraðri, áreiðanlegri og sveigjanlegri lncRNA greiningu.
-
GWAS
Erfðafræðileg tengslarannsókn (GWAS) miðar að því að greina erfðaafbrigði (arfgerð) sem tengjast sérstökum eiginleikum (svipgerð).GWA rannsóknir rannsaka erfðamerki sem fara yfir heilt erfðamengi fjölda einstaklinga og spá fyrir um tengsl arfgerðar og svipgerða með tölfræðilegri greiningu á íbúastigi.Endurröðun heils erfðaefnis getur hugsanlega uppgötvað öll erfðaafbrigði.Með samtengingu við svipgerðargögn er hægt að vinna úr GWAS til að bera kennsl á svipgerðatengd SNP, QTL og kandidatgen, sem styður sterklega nútíma dýra-/plönturækt.SLAF er sjálfþróuð einfölduð erfðamengisraðgreiningaraðferð, sem uppgötvar erfðamengisdreifða merkja, SNP.Þessar SNPs, sem sameindaerfðavísar, er hægt að vinna úr fyrir tengslarannsóknir með markvissa eiginleika.Það er hagkvæm aðferð til að greina flókna eiginleika sem tengjast erfðabreytileika.
-
Nanopore Transcriptomics í fullri lengd
Flókin og breytileg önnur ísóform í lífverum eru mikilvægir erfðafræðilegir aðferðir til að stjórna tjáningu gena og fjölbreytileika próteina.Nákvæm auðkenning á uppskriftarbyggingum er grundvöllur fyrir ítarlegri rannsókn á stjórnun á genatjáningarmynstri.Nanopore raðgreiningarvettvangur hefur með góðum árangri fært transcriptomic rannsókn á isoform-stigi.Þessi greiningarvettvangur er hannaður til að greina RNA-Seq gögn sem myndast á Nanopore vettvangi á grundvelli viðmiðunarerfðamengisins, sem nær eigindlegri og megindlegri greiningu bæði á genastigi og umritastigi.
-
circ-RNA
Hringlaga RNA (circRNA) er tegund RNA sem ekki er kóðað, sem nýlega hefur reynst gegna mikilvægu hlutverki í eftirlitsnetum sem taka þátt í þróun, umhverfisþoli osfrv. Aðgreint frá línulegum RNA sameindum, td mRNA, lncRNA, 3′ og 5′ endar circRNA eru tengdir saman til að mynda hringlaga uppbyggingu, sem bjargar þeim frá meltingu exonucleasa og eru stöðugri en flest línuleg RNA.Í ljós hefur komið að CircRNA hefur margvíslega virkni við að stjórna tjáningu gena.CircRNA getur virkað sem ceRNA, sem binst miRNA samkeppnishæft, þekktur sem miRNA svampur.CircRNA raðgreiningarvettvangur styrkir circRNA uppbyggingu og tjáningargreiningu, markspá og samgreiningu með öðrum gerðum RNA sameinda
-
BSA
Bulked Segregant Analysis pallur samanstendur af eins þrepa staðlaðri greiningu og háþróaðri greiningu með sérsniðnum færibreytum.BSA er tækni sem notuð er til að bera kennsl á svipgerðartengd erfðamerki fljótt.Helstu vinnuflæði BSA inniheldur: 1. að velja tvo hópa einstaklinga með afar andstæðar svipgerðir;2. sameina DNA, RNA eða SLAF-seq (Þróað af Biomarker) allra einstaklinga til að mynda tvö magn af DNA;3. að bera kennsl á mismunandi raðir gegn viðmiðunarerfðamengi eða þar á milli, 4. spá fyrir um tengd svæði með ED og SNP-vísitölu reiknirit;5. Virknigreining og auðgun á genum á umsækjendum svæðum o.s.frv. Ítarlegri námuvinnslu í gögnum, þ.mt erfðamerkjaskimun og grunnhönnun er einnig fáanleg.
