Fréttir

Transposable element (TE) mögnun hefur verið viðurkennd sem drifkraftur sem miðlar stækkun og þróun erfðamengisstærðar, en afleiðingarnar fyrir mótun þrívíddar erfðafræðilegrar byggingarlistar eru að mestu óþekktar í plöntum.Hér greinum við frá erfðamengissamsetningum í viðmiðunargráðu fyrir þrjár bómullartegundir sem eru þrefalt að stærð, þ.e.Gossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2), ogG. raimondii(D5), með Oxford Nanopore Technologies.Samanburðargreiningar á erfðamengi skjalfesta upplýsingar um ættarsértæka TE mögnun sem stuðlar að miklum mun á erfðamengisstærð (K2, 2,44 Gb; A2, 1,62 Gb; D5, 750,19 Mb), og gefa til kynna tiltölulega varðveitt genainnihald og samsetningartengsl milli erfðamengja.Við komumst að því að um það bil 17% tilbúna gena sýna breytingu á litningastöðu milli virkra (“A”) og óvirkra (“B”) hólfa, og TE mögnun tengdist aukningu á hlutfalli A-hólfs í genasvæðum (~ 7.000 gen. ) í K2 og A2 miðað við D5.Aðeins 42% af landamærum landfræðilega tengdra léna (TAD) voru varðveitt meðal genamenganna þriggja.Gögnin okkar gefa til kynna nýlega mögnun á TE í kjölfar myndunar á ættarsértækum TAD mörkum.Þessi rannsókn varpar ljósi á hlutverk transposon-miðlaðrar erfðamengisstækkunar í þróun hærri röð litningabyggingar í plöntum.