GENOME
Samsetning á litningakvarða og greining á lífmassaræktun Miscanthus lutarioriparius erfðamengi
Nanopore raðgreining |Illumina |Hæ-C |RNA-raðgreining |Sýklafræði
Í þessari rannsókn veitti Biomarker Technologies tæknilega aðstoð við Nanopore raðgreiningu, de novo erfðamengissamsetningu, Hi-C aðstoðaða samsetningu o.s.frv.
Ágrip
Miscanthus, rhizomatous ævarandi planta, hefur mikla möguleika á líforkuframleiðslu fyrir mikla lífmassa og streituþol.Við greinum frá samsetningu á litningakvarða afMiscanthus lutarioripariuserfðamengi með því að sameina Oxford Nanopore raðgreiningu og Hi-C tækni.2,07-Gb samsetningin nær yfir 96,64% af erfðamenginu, með contig N50 upp á 1,71 Mb.Miðju og telómera röðin eru sett saman fyrir alla 19 litningana og litninga 10, í sömu röð.Allotetraploid uppruni M. lutarioriparius er staðfestur með því að nota miðlægar gervitunglaendurtekningar.Gerð er glögglega sýnt fram á uppbygging ferfróna erfðamengisins og nokkrar litningabreytingar miðað við sorghum.Tandem afrit gen afM. lutarioripariuseru hagnýt auðguð ekki aðeins hvað varðar streituviðbrögð, heldur frumuvegglífmyndun.Genfjölskyldur sem tengjast sjúkdómsþoli, frumuveggmyndun og málmjónaflutningi eru mjög stækkaðar og þróaðar.Stækkun þessara fjölskyldna getur verið mikilvægur erfðafræðilegur grunnur til að auka merkilega eiginleikaM. lutarioriparius.
Lykiltölfræði um samsetningu erfðamengis
Mynd.Yfirlit yfir erfðamengi M. lutarioriparius
Fréttir og hápunktur miðar að því að deila nýjustu farsælu málum með Biomarker Technologies, fanga ný vísindaleg afrek sem og áberandi tækni sem beitt var meðan á rannsókninni stóð.
Pósttími: Jan-05-2022