Metatranscriptome raðgreining auðkennir genatjáningu örvera (bæði heilkjörnunga og dreifkjörnunga) í náttúrulegu umhverfi (þ.e. jarðvegi, vatni, sjó, saur og þörmum.). Nánar tiltekið gerir þessi þjónusta þér kleift að fá heildar genatjáningarsnið flókinna örverusamfélaga, flokkunarfræðilega greiningu tegunda, virkniauðgunargreiningu á mismunandi tjáðum genum og fleira.