-
Proteomics
Próteomics felur í sér beitingu tækni til að mæla heildarpróteininnihald frumu, vefs eða lífveru.Próteomics-undirstaða tækni er notuð í ýmsum getu fyrir mismunandi rannsóknarstillingar eins og greiningu á ýmsum greiningarmerkjum, frambjóðendum til bóluefnaframleiðslu, skilning á sjúkdómsvaldandi aðferðum, breytingu á tjáningarmynstri sem svar við mismunandi merkjum og túlkun á virkum próteinferlum í mismunandi sjúkdómum.Sem stendur er megindlegri próteomics tækni aðallega skipt í TMT, Label Free og DIA megindlegar aðferðir.
-
Efnaskipti
Umbrotsefnið er endanleg niðurstreymisafurð erfðamengisins og samanstendur af heildaruppbót allra sameinda með lágmólþunga (umbrotsefni) í frumu, vef eða lífveru.Metabolomics miðar að því að mæla mikla breidd lítilla sameinda í samhengi við lífeðlisfræðilegt áreiti eða sjúkdómsástand.Efnaskiptaaðferðir falla í tvo aðgreinda hópa: efnaskiptafræði sem er ekki markviss, fyrirhuguð yfirgripsmikil greining á öllum mælanlegum greiningarefnum í sýni, þar á meðal efnafræðilega óþekkta með GC-MS/LC-MS, og markviss efnaskiptafræði, mælingar á skilgreindum hópum efnafræðilega einkennandi og lífefnafræðilega skýrt umbrotsefni.
-
Bulked Segregant greining
Bulked segregant analysis (BSA) er tækni sem notuð er til að bera kennsl á svipgerðartengd erfðamerki fljótt.Aðalverkflæði BSA felur í sér að velja tvo hópa einstaklinga með afar andstæðar svipgerðir, sameina DNA allra einstaklinga til að mynda tvö magn af DNA, greina mismunaraðir á milli tveggja hópa.Þessi tækni hefur verið mikið notuð til að bera kennsl á erfðamerki sem eru sterk tengd markgenum í erfðamengi plantna/dýra.
-
DNA/RNA raðgreining – Nanopore raðgreining
ONT raðgreining er ein sameind í rauntíma rafmerkja raðgreiningartækni sem byggir á nanóporum, raðgreiningarreglan hvers vettvangs er sú sama.Tvíþátta DNA/RNA mun bindast nanoporous próteini sem er fellt inn í líffilmuna og vinda ofan af undir forystu hreyfipróteins, undir áhrifum spennumunar frá báðum hliðum líffilmunnar, fara DNA/RNA þræðir í gegnum nanopore ráspróteinið á ákveðinni hlutfall.Vegna mismunandi efnafræðilegra eiginleika mismunandi basa á DNA/RNA strengnum, þegar ein basi eða DNA sameind fer í gegnum nanopore rásina, mun það valda breytingum á mismunandi rafboðum.Með því að greina og samsvara þessum merkjum er hægt að reikna út samsvarandi grunngerðir og ljúka rauntíma uppgötvun röðarinnar.
-
DNA/RNA raðgreining -PacBio Sequencer
PacBio raðgreiningarvettvangur er langlestur raðgreiningarvettvangur, sem einnig er þekktur sem ein af þriðju kynslóðar raðgreiningartækni (TGS).Kjarnatæknin, einni sameind í rauntíma (SMRT), eykur myndun lestra sem eru tugir kílóa að lengd.Á grundvelli „Raðunar-með-myndunar“ er einkjarnaupplausn náð með Zero-mode waveguide (ZMW), þar sem aðeins takmarkað rúmmál neðst (staður sameindamyndunar) er upplýst.Að auki forðast SMRT raðgreining að mestu raðsértæka hlutdrægni í NGS kerfi, þar sem flest PCR mögnunarþrep eru ekki nauðsynleg í byggingarferli bókasafns.
Leikvangur: Framhald II, Revio
