Kynntu þér möguleikana á að rannsaka villta fjölbreytni rannsóknartegunda, dæmigerð með lykilmáli frá viðskiptavinum BMKGENE.Nýlega birt í útgáfu þessa árs af Plant Biotechnology Journal, greinin sem heitir "Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" stendur sem verðmæt tilvísun.
Brasilíska gúmmítréð (Hevea brasiliensis) stendur hátt sem mikilvægur náttúrulegur gúmmígjafi.Alla síðustu öld kveikti hefðbundin ræktunaraðferðafræði ótrúlega sexfalda aukningu í gúmmíframleiðslu.Samt er undirliggjandi erfðafræðilegur berggrunnur sem ber ábyrgð á hugsanlegri aukningu gúmmíuppskeru enn óljós.
Þessi rannsókn hófst við að smíða erfðamengi á litningastigi fyrir villta gúmmítréð, með samvirkni Nanopore langlestrar raðgreiningar, Illumina NGS raðgreiningar og Hi-C tækni.
Samhliða því var safnað saman 147 kímstofnaauðlindum, sem innihélt afbrigði af mikilli uppskeru, villtum stofnum og skyldum tegundum, fyrir alhliða endurraðgreiningu á öllu erfðamengi (WGS) með því að nota Illumina vettvang.Röðunargögnin sem fylgdu í kjölfarið gengust undir stranga þýðiserfðagreiningu, sem gerði kleift að greina stofngerð, fjölbreytileika og ójafnvægi í tengingum.Þessi greining varpaði ljósi á breytileika í búskap milli íbúa.
Frekari rannsóknir fólu í sér greiningu sem náði til Fst, π, Tajima's D og LD, með það að markmiði að afhjúpa valmerki sem stafa af bættri latexuppskeru, einkum með áherslu á Wickham klóna.
Náði hámarki í erfðamengi-wide Association Analysis (GWAS), merkjum tengdum afraksturseiginleikum og í kjölfarið uppskerutengdum genum var bent á.Upphafleg staðfesting afhjúpaði áberandi umritunarvirkni yfir mismunandi stökkbrigði fyrir tvö ERF gen, sem gaf bráðabirgðasýn inn í starfræna þýðingu þeirra.Frekari staðfesting er áætluð innan væntanlegra rannsókna.
BMKGENE leggur metnað sinn í að leggja sitt af mörkum til víðtækrar raðgreiningar á öllu erfðamengi þessa stóra þýðis, ásamt mikilvægu hlutverki í lífupplýsingagreiningu.Víðtæk reynsla okkar nær yfir NGS/TGS raðgreiningu og multiomics lífupplýsingagreiningu yfir fjölda 1000+ tegunda.Við hlökkum til að eiga samstarf við þig um komandi verkefni.
Smelltu hér til aðlæra meira um þessa rannsókn
Birtingartími: 29. ágúst 2023