● Mjög reyndur: Yfir 200.000 sýni hafa verið unnin í BMK sem ná yfir fjölbreyttar sýnisgerðir, þar á meðal frumurækt, vefi, líkamsvökva osfrv. og yfir 7.000 mRNA-Seq verkefni lokuð sem ná yfir ýmis rannsóknarsvið.
● Strangt gæðaeftirlitskerfi: Kjarnagæðaeftirlitsstaðir í gegnum öll skref, þar á meðal sýnishorn, undirbúningur bókasafns, raðgreiningu og lífupplýsingafræði eru undir nánu eftirliti til að skila hágæða niðurstöðum.
● Margir gagnagrunnar tiltækir fyrir virkniskýringar og auðgunarrannsóknir til að uppfylla fjölbreytt rannsóknarmarkmið.
● Þjónusta eftir sölu: Þjónusta eftir sölu gildir í 3 mánuði eftir að verkefni lýkur, þar á meðal eftirfylgni verkefna, bilanaleit, spurningar og svör við niðurstöðum o.fl.
Bókasafn | Röðunarstefna | Mælt er með gögnum | Gæðaeftirlit |
Poly A auðgað | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Núkleótíð:
Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | Fyrir plöntur: RIN≥6,5; Fyrir dýr: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnhækkun |
Vefur: Þyngd (þurr):≥1 g
*Fyrir vef sem er minni en 5 mg, mælum við með að senda leifturfrosið (í fljótandi köfnunarefni) vefjasýni.
Frumulausn:Frumufjöldi = 3×106- 1×107
*Við mælum með að senda frosið frumulýsat.Ef sú fruma telur minna en 5×105.
Blóðsýni:Rúmmál ≥1 ml
Örvera:Massi ≥ 1 g
Ílát: 2 ml miðflóttahólkur (tini er ekki mælt með)
Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sending:
Lífupplýsingafræði
Heilkjörnungar Verkflæði mRNA raðgreiningar
Lífupplýsingafræði
ØGæðaeftirlit með hráum gögnum
ØTilvísun erfðamengi röðun
ØUppskriftargreining
ØTjáningafjöldi
ØMismunandi tjáningargreining
ØAðgerðaskýring og auðgun
1.mRNA Gögn Mettunarferill
2.Mismunatjáningargreining-Volcano plot
3.KEGG skýring á DEG
4.GO flokkun á DEG