●Pallar:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten og BGI-DNB-T7
●Röðunarstillingar:PE50, PE100, PE150, PE250
●Gæðaeftirlit með bókasöfnum fyrir röðun
●Röð gagnaafhendingar og QC:afhendingu á QC skýrslu og hráum gögnum á fastq sniði eftir afmultiplexing og síun Q30 lestra.
●Fjölhæfni raðgreiningarþjónustu:viðskiptavinurinn getur valið að raða eftir akrein, flæðihólfi eða magni gagna.
●Fjölhæfni palla:Hægt er að flytja DNB bókasöfn yfir á Illumina palla
●Víðtæk reynsla á Illumina raðkerfisvettvangi:með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsar tegundir.
●Afhending raðgreiningar QC skýrslu:með gæðamælingum, nákvæmni gagna og heildarframmistöðu raðgreiningarverkefnisins.
●Þroskað raðunarferli:með stuttum afgreiðslutíma.
●Strangt gæðaeftirlit: Við innleiðum strangar QC kröfur til að tryggja afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.
Gagnamagn (X) | Styrkur (qPCR/nM) | Bindi |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Pallur | Styrkur (qPCR/nM) | Bindi |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Auk styrks og heildarmagns er einnig krafist viðeigandi toppmynsturs.
Skýrsla um gæði safnsins er gefin fyrir raðgreiningu, mat á magni safns og sundrun.
Tafla 1. Tölfræði um raðgreiningargögn.
Sýnishorn | BMKID | Hrá les | Óunnin gögn (bp) | Hrein lesning (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Mynd 1. Gæðadreifing eftir lestri í hverju sýni
Mynd 2. Grunnefnisdreifing
Mynd 3. Dreifing lesins efnis í raðgreiningargögnum