circRNA raðgreiningu-Illumina
Eiginleikar
● rRNA eyðingu fylgt eftir með stefnubundinni undirbúningi safns, sem gerir raðgreiningargögnum kleift sem eru strengsértæk.
● Lífupplýsingavinnuflæði gerir circRNA spá og mælingu á tjáningu kleift
Þjónustukostir
●Umfangsmeiri RNA bókasöfn:við notum rRNA-eyðingu í stað línulegrar RNA-eyðingar í undirbúningi forsafnsins okkar, og tryggjum að raðgreiningargögnin innihaldi ekki aðeins circRNA heldur einnig mRNA og lncRNA, sem gerir sameiginlega greiningu á þessum gagnasöfnum kleift
●Valfrjáls greining á samkeppnishæfu innrænu RNA (ceRNA) netum: veita dýpri innsýn í frumustjórnunarkerfi
●Víðtæk sérfræðiþekking: Með afrekaskrá með að vinna yfir 20.000 sýni hjá BMK, sem spannar fjölbreyttar sýnishorn og lncRNA verkefni, færir teymið okkar mikla reynslu í hvert verkefni.
●Strangt gæðaeftirlit: við innleiðum kjarnastýringarpunkta á öllum stigum, frá undirbúningi sýna og bókasafns til raðgreiningar og lífupplýsingafræði.Þetta nákvæma eftirlit tryggir afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.
● Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu.Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
Dæmi um kröfur og afhending
| Bókasafn | Pallur | Mælt er með gögnum | Gagna QC |
| Poly A auðgað | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Dæmi um kröfur:
Núkleótíð:
| Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | Fyrir plöntur: RIN≥6,5; Fyrir dýr: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnhækkun |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg
Blað eða fræ: 300 mg
Ávextir: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þörmum: 450 mg
Innyfli eða heili: 240 mg
Vöðvar: 600 mg
Bein, hár eða húð: 1,5g
● Liðdýr:
Skordýr: 9g
Krabbadýr: 450 mg
● Heilblóð:2 rör
● Frumur: 106 frumur
● Sermi og plasma: 6 ml
Mælt er með sýnishornafhendingu
Ílát: 2 ml miðflóttahólkur (tini er ekki mælt með)
Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sending:
1. Þurrís: Pakka þarf sýnum í poka og grafa í þurrís.
2. RNA-stöðug rör: Hægt er að þurrka RNA-sýni í RNA-stöðugleikaglasi (td RNAstable®) og senda við stofuhita.
Þjónustuvinnuflæði
Hönnun tilrauna
Sýnishorn afhending
RNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Lífupplýsingafræði
circRNA spá: litningadreifing
Mismunandi tjáð circRNAs – Volcano plot
Mismunandi tjáð circRNAs – stigveldisþyrping
Virk auðgun hýsilgena circRNA
Kannaðu framfarirnar í rannsóknum sem auðveldað er með circRNA raðgreiningarþjónustu BMKGene í gegnum safn rita.
Wang, X. o.fl.(2021) 'CPSF4 stjórnar myndun circRNA og míkróRNA miðlaðri genaþöggun í lifrarfrumukrabbameini', Oncogene 2021 40:25, 40(25), bls. 4338–4351.Doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. o.fl.(2023) „X oo-svarandi umrit sýnir hlutverk hringlaga RNA133 í sjúkdómsþoli með því að stjórna tjáningu OsARAB í hrísgrjónum“, Phytopathology Research, 5(1), bls. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/MYNDIR/6.
Y, H. o.fl.(2023) „CPSF3 mótar jafnvægi hringlaga og línulegra umrita í lifrarfrumukrabbameini“.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. o.fl.(2023) „Alhliða mat á circRNAs í skorpulifur hjartavöðvakvilla fyrir og eftir lifrarígræðslu“, International Immunopharmacology, 114, bls.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
