Ngwaahịa

Usoro RNA otu nucleus

Ọganihu n'ime otu cell na usoro iwu ụlọ ọba akwụkwọ jikọtara ya na usoro ntinye dị elu na-enye ohere ọmụmụ mkpụrụ ndụ ihe nketa site na cell site na cell.Ọ na-eme ka nyocha nke sistemu dị omimi na nke zuru oke na ọnụ ọgụgụ sel dị mgbagwoju anya, nke ọ na-ezere nkpuchi nke ịdị iche iche ha site na iwere nkezi nke sel niile.

Otú ọ dị, ụfọdụ mkpụrụ ndụ adịghị mma ka e mee ya ka ọ bụrụ nkwusioru nke otu cell, ya mere, usoro nkwadebe ihe atụ ndị ọzọ - a na-ewepụta oghere site na anụ ahụ, ya bụ, a na-esi na anụ ahụ ma ọ bụ cell ewepụta ngwa ngwa ma kwadebe ya n'otu nkwusioru maka otu-nucleus. usoro cell.

BMK na-enye 10× Genomics ChromiumTM nke dabere na otu cell RNA ọrụ usoro.A na-eji ọrụ a eme ihe n'ọtụtụ ebe n'ọmụmụ ihe gbasara ọmụmụ ihe metụtara ọrịa, dị ka ọdịiche dị n'etiti cell immunodeficiency, ụdị ọrịa tumor, mmepe anụ ahụ, wdg.

Mgbawa transcriptome spatial: 10× Genomics

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Kpọtụrụ anyị

Nkọwa ọrụ

Bioinformatics

Nsonaazụ ngosi

Usoro nka

A na-enweta ikewapụ nke nuclei site na 10 × Genomics Chromium TM, nke nwere sistemụ microfluidics nke ọwa asatọ nwere ngafe abụọ.Na usoro a, a gel beads na barcodes na primer, enzymes na otu nucleus na-etinyere na mmanụ mmanụ nanoliter, na-emepụta Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Ozugbo e guzobere GEM, a na-eme lysis cell na ntọhapụ nke barcode na GEM ọ bụla.A na-atụgharị mRNA n'ime mkpụrụ ndụ cDNA nwere koodu barcode 10 × na UMI, ndị na-aga n'ihu maka iwu ụlọ ọba akwụkwọ nhazi usoro.

Anụ ahụ adịghị mma maka nkwadebe nkwusioru otu cell

Cell / anụ ahụ	Ihe kpatara ya
Megharịa anụ ahụ jụrụ oyi	Enweghị ike ịnweta ụlọ ọrụ ọhụrụ ma ọ bụ ndị echekwara ogologo oge
Mkpụrụ ndụ akwara, Megakaryocyte, abụba…	Dayameta cell dị oke ibu ịbanye ngwa
Imeju…	Ọ na-esighi ike ịgbaji, enweghị ike ịmata otu mkpụrụ ndụ
Mkpụrụ ndụ Neuron, Brain…	Ọ dị nro karịa, dị mfe nrụgide, ga-agbanwe nsonaazụ usoro
Pancreas, thyroid…	Ọgaranya na enzymes endogenous, na-emetụta mmepụta nke nkwusioru otu cell

Otu-nucleus vs Single-cell

Otu-nucleus	Otu cell
Dayameta cell na-akparaghị ókè	Dayameta cell: 10-40 μm
Ihe nwere ike ịbụ anụ ahụ jụrụ oyi	Ihe ga-abụrịrị anụ ahụ dị ọhụrụ
Obere nchekasị nke mkpụrụ ndụ oyi kpọnwụrụ	Ọgwụgwọ enzyme nwere ike ibute mmeghachi omume nrụgide cell
Ọ dịghị mkpụrụ ndụ ọbara uhie ka a ga-ewepụ	Ọ dị mkpa iwepụ mkpụrụ ndụ ọbara uhie
Nuklia na-egosipụta ozi bioin	Mkpụrụ ndụ niile na-egosipụta ozi bioin