-
Usoro Metatranscriptome
Metatranscriptome sequencing na-achọpụta mkpụrụ ndụ ihe nketa nke ụmụ nje (ma eukaryotes na prokaryotes) n'ime gburugburu ebe obibi (ya bụ ala, mmiri, oke osimiri, nsị, na eriri afọ) .Kpọmkwem, ọrụ a na-enye gị ohere ịnweta nkọwapụta mkpụrụ ndụ dum nke obodo microbial dị mgbagwoju anya, nyocha taxonomic. ụdị dị iche iche, nyocha nkwalite ọrụ nke mkpụrụ ndụ ihe nketa dị iche iche, na ndị ọzọ.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Fungal Genome
Teknụzụ Biomarker na-enye nyocha genome, ezigbo genome na genome zuru oke nke fungal dabere na ebumnuche nyocha akọwapụtara.Enwere ike nweta usoro genome, mgbakọ na nkọwa ọrụ site na ijikọta usoro nke ọgbọ na-abịa + usoro ọgbọ nke atọ iji nweta mgbakọ genome dị elu.Enwere ike iji teknụzụ Hi-C rụọ ọrụ iji kwado mgbakọ genome na ọkwa chromosome.
Platform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platform
-
Ngwa ngwa
BMKCloud bụ a na-eduga bioinformatic ikpo okwu na-enye onye-nkwụsị ngwọta maka genomic mmemme, nke ọtụtụ ndị na-eme nchọpụta tụkwasịrị obi na dị iche iche arena gụnyere ọgwụ, ugbo, gburugburu ebe obibi, wdg BMKCloud agba mbọ na-enye integrated, pụrụ ịdabere na oru oma ọrụ gụnyere bioinformatic analysis nyiwe na ngwaọrụ. , Mgbakọ akụrụngwa, ọha nchekwa data, bioinformtic online ọmụmụ, wdg BMKCloud nwere dị iche iche ugboro ugboro bioinformatic ngwá ọrụ nke gụnyere gene annotation, evolushọn mkpụrụ ndụ ihe nketa ngwá ọrụ, ncRNA, data àgwà akara, mgbakọ, alignment, data mmịpụta, mutations, ọnụ ọgụgụ, Figure generator, usoro. nyocha, wdg.
-
Nje bacteria zuru ezu Genome
Teknụzụ Biomarker na-enye ọrụ nhazi usoro maka iwulite genome nke nje bacteria na enweghị oghere efu.Isi ọrụ nje bacteria na-arụ ọrụ genome zuru oke gụnyere usoro ọgbọ nke atọ, mgbakọ, nkọwa ọrụ na nyocha bioinformatic dị elu na-emezu ebumnuche nyocha.Nkọwapụta nke genome nke nje bacteria na-enye ike ikpughe usoro ndị dị mkpa na-adabere na usoro ndu ha, nke nwekwara ike inye nkọwa bara uru maka nchọpụta mkpụrụ ndụ ihe nketa na ụdị eukaryotic dị elu.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
-
obere RNA
Obere RNA bụ ụdị RNA dị mkpụmkpụ na-abụghị koodu nke nwere ogologo 18-30 nt, gụnyere miRNA, siRNA na piRNA.A kọwapụtara obere RNA ndị a nke ukwuu na ha na-etinye aka na usoro ndu dị iche iche dị ka mmebi mRNA, mgbochi ntụgharị, nhazi heterochromatin, wdg. A na-etinye nyocha nke usoro obere RNA n'ọtụtụ ebe n'ọmụmụ ihe gbasara mmepe anụmanụ / osisi, ọrịa, nje, wdg. Obere RNA. usoro nyocha usoro ihe mejupụtara nyocha ọkọlọtọ na Ngwuputa data dị elu.Na ndabere nke data RNA-seq, nyocha ọkọlọtọ nwere ike nweta njirimara na amụma miRNA, amụma mkpụrụ ndụ ihe mgbaru ọsọ miRNA, nkọwa na nyocha okwu.Nyocha dị elu na-enyere aka nchọ na mmịpụta miRNA ahaziri ahaziri, ọgbọ eserese Venn, miRNA na ụlọ netwọkụ ezubere iche.
-
NGS-WGS (Ilumina/BGI)
NGS-WGS bụ usoro nyocha usoro nhazigharị genome dum, nke emepụtara na ndabere nke ahụmịhe bara ụba na Teknụzụ Biomarker.Ikpo okwu a dị mfe iji mee ihe na-enye ohere ntinye ngwa ngwa nke usoro nyocha agbakwunyere site na ịtọ ntọala ole na ole, nke dabara maka data usoro DNA sitere na ikpo okwu Illumina na usoro usoro BGI.A na-etinye ikpo okwu a na ihe nkesa kọmputa na-arụ ọrụ dị elu, nke na-enye ike nyocha data nke ọma na obere oge.Ngwuputa data ahaziri onwe ya dị na ndabere nke nyocha ọkọlọtọ, gụnyere ajụjụ mkpụrụ ndụ agbanwe agbanwe, imewe PCR primer, wdg.
-
mRNA(ntụaka)
Transcriptome bụ njikọ dị n'etiti ozi mkpụrụ ndụ ihe nketa na proteome nke ọrụ ndu.Usoro nhazi ọkwa ederede bụ nke kachasị mkpa na nke a kacha mụọ n'ọtụtụ ebe usoro ụkpụrụ nke ntule.Usoro transcriptome nwere ike ịhazi transcriptome n'oge ọ bụla n'oge ma ọ bụ n'ọnọdụ ọ bụla, na mkpebi ziri ezi na otu nucleotide. Ọ nwere ike gosipụta ọkwa nke mkpụrụ ndụ ihe nketa, n'otu oge chọpụta ma chọpụta transcript dị ụkọ na nke nkịtị, ma nye ozi nhazi nke sample kpọmkwem transcripts.
Ka ọ dị ugbu a, a na-eji teknụzụ transcriptome sequencing n'ọtụtụ ebe na agronomy, ọgwụ na mpaghara nyocha ndị ọzọ, gụnyere ụkpụrụ mmepe anụmanụ na osisi, mgbanwe gburugburu ebe obibi, mmekọrịta mgbochi ọrịa, mkpụrụ ndụ ihe nketa, ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa na etuto na nchọpụta ọrịa mkpụrụ ndụ ihe nketa.
-
Metagenomics (NGS)
Emebere ikpo okwu nyocha a maka nyocha data metagenomic ogbunigwe site na ahụmịhe afọ.Ọ mejupụtara arụ ọrụ agbakwunyere nke nwere nyocha metagenomics dị iche iche a na-achọkarị gụnyere nhazi data, ọmụmụ ọkwa ụdị, ọmụmụ ihe n'ọkwa ọrụ mkpụrụ ndụ ihe nketa, metagenome binning, wdg. Na mgbakwunye, ngwaọrụ Ngwuputa data ahaziri iche dị n'elu usoro nyocha ọkọlọtọ, gụnyere mkpụrụ ndụ ihe nketa na ajụjụ ụdị. , ntọala paramita, imepụta ọnụ ọgụgụ ahaziri iche, wdg.
-
LncRNA
Ogologo RNA ndị na-abụghị koodu (lncRNA) bụ ụdị ederede nwere ogologo ogologo karịa 200 nt, nke na-enweghị ike ịmepụta protein.Mgbakọ akaebe na-egosi na ọtụtụ n'ime lncRNA nwere ike ịrụ ọrụ.Teknụzụ usoro nrụpụta dị elu na ngwaọrụ nyocha bioinformatic na-enye anyị ike ikpughe usoro lncRNA na idobe ozi nke ọma ma duga anyị ịchọpụta lncRNA nwere ọrụ nhazi dị mkpa.BMKCloud dị mpako ịnye ndị ahịa anyị usoro nyocha usoro lncRNA iji nweta nyocha ngwa ngwa, ntụkwasị obi na mgbanwe lncRNA.
-
GWAS
Ọmụmụ ihe gbasara njikọ genome-wide (GWAS) na-achọ ịchọpụta ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa (genotype) nke jikọtara ya na njirimara ụfọdụ (phenotype).Ọmụmụ GWA na-enyocha akara mkpụrụ ndụ ihe nketa na-agafe genome nke ọnụ ọgụgụ mmadụ buru ibu ma buru amụma banyere mkpakọrịta genotype-phenotype site na nyocha ọnụ ọgụgụ na ọkwa ọnụ ọgụgụ mmadụ.Nhazi nke genome zuru oke nwere ike ịchọpụta ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa niile.N'ijikọ na data phenotypic, GWAS nwere ike hazie iji chọpụta phenotype metụtara SNPs, QTL na mkpụrụ ndụ ihe nketa, nke na-akwadosi ike ịzụlite anụmanụ/osisi ọgbara ọhụrụ.SLAF bụ atụmatụ usoro usoro genome dị mfe nke mepụtara onwe ya, nke na-achọpụta akara nrịbama nke kesara genome, SNP.Ndị SNP ndị a, dị ka ihe nrịbama mkpụrụ ndụ ihe nketa molekụla, enwere ike ịhazi maka ọmụmụ mkpakọrịta nwere àgwà ezubere iche.Ọ bụ atụmatụ dị ọnụ ahịa iji chọpụta àgwà dị mgbagwoju anya metụtara ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa.
-
Nanopore transcriptomics zuru oke
Mgbagwoju anya na mgbanwe dị iche iche dị n'ime ihe dị ndụ bụ usoro mkpụrụ ndụ ihe dị mkpa maka ịhazi okwu mkpụrụ ndụ ihe nketa na ụdị protein dị iche iche.Nchọpụta nke ọma nke nhazi ederede bụ ihe ndabere maka nyocha miri emi nke usoro nhazi okwu mkpụrụ ndụ ihe nketa.Ikpo okwu usoro Nanopore ewetala ọmụmụ ihe trancriptomic nke ọma na ọkwa isoform.Ezubere ikpo okwu nyocha a iji nyochaa data RNA-Seq ewepụtara na ikpo okwu Nanopore na ntọala genome, nke na-enweta nyocha qualitative na quantitative na ọkwa mkpụrụ ndụ ihe nketa yana ọkwa transcript.
-
circ-RNA
Circular RNA (circRNA) bụ ụdị RNA na-abụghị koodu, bụ nke achọpụtara n'oge na-adịbeghị anya na-arụ ọrụ dị mkpa na netwọk nchịkwa na-etinye aka na mmepe, nguzogide gburugburu ebe obibi, wdg. Dị iche na mkpụrụ ndụ RNA linear, dịka mRNA, lncRNA, 3' na 5′ A na-ejikọta nsọtụ circRNA ọnụ iji mepụta okirikiri okirikiri, nke na-azọpụta ha na mgbari nke exonuclease ma kwụsie ike karịa ọtụtụ RNA linear.Achọpụtala CircRNA nwere ọrụ dị iche iche n'ịhazi okwu mkpụrụ ndụ ihe nketa.CircRNA nwere ike ịrụ dị ka ceRNA, nke na-ejikọta miRNA na asọmpi, nke a maara dị ka sponge miRNA.Usoro nyocha usoro nke CircRNA na-enye ikike nhazi circRNA na nyocha okwu, amụma ebumnuche na nyocha njikọta na ụdị ụmụ irighiri RNA ndị ọzọ.
