-
Nyocha gbasara mkpokọta Genome
Ọmụmụ ihe gbasara njikọ genome-wide (GWAS) na-achọ ịchọpụta ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa (genotype) nke jikọtara ya na njirimara ụfọdụ (phenotype).Ọmụmụ GWAS na-enyocha akara mkpụrụ ndụ ihe nketa na-agafe genome nke ọnụ ọgụgụ mmadụ buru ibu ma buru amụma banyere mkpakọrịta genotype-phenotype site na nyocha ndekọ ọnụ ọgụgụ na ọkwa ọnụ ọgụgụ mmadụ.A tinyela ya n'ọrụ n'ọtụtụ ebe n'ime nyocha gbasara ọrịa mmadụ na ngwuputa mkpụrụ ndụ ihe nketa na-arụ ọrụ na àgwà mgbagwoju anya nke anụmanụ ma ọ bụ osisi.
-
Usoro ihe ọkụkụ/anụmanụ dum genome
Usoro nhazigharị genome dum, nke a makwaara dị ka WGS, na-enyere aka ikpughe ma mmụgharị nkịtị na nke na-adịghị ahụkebe na genome niile gụnyere Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Nhichapụ ntinye (InDel), mgbanwe nhazi (SV), na Ụdị Ntugharị nọmba (CNV). ).SV na-eme ka akụkụ dị ukwuu nke isi mgbanwe dị iche iche karịa SNP ma nwee mmetụta dị ukwuu na genome, nke nwere mmetụta dị ukwuu na ihe ndị dị ndụ.Ịgụgharị ogologo oge na-enye ohere ịmatakwu nkenke nke nnukwu iberibe na ọdịiche dị mgbagwoju anya n'ihi na ogologo oge na-agụ na-eme ka ọ dịkwuo mfe ịgafe chromosomal na mpaghara mgbagwoju anya dị ka tandem na-emegharị, GC/AT-ọgaranya mpaghara, na mpaghara hyper-variable.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Genetics evolushọn
Mkpụrụ ndụ ihe nketa evolushọn bụ ọrụ njupụta nke emebere maka inye nkọwa zuru oke na ozi evolushọn nke ihe enyere dabere na mgbanwe mkpụrụ ndụ ihe nketa, gụnyere SNPs, InDels, SVs na CNV.Ọ na-enye nyocha niile dị mkpa achọrọ maka ịkọwa mgbanwe mgbanwe evolushọn na njirimara mkpụrụ ndụ ihe nketa nke ọnụ ọgụgụ mmadụ, dị ka usoro ọnụọgụgụ, ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa, mmekọrịta phylogeny, wdg.
-
Genomics atụnyere
Ntụnyere genomics pụtara n'ụzọ nkịtị iji atụnyere usoro genome zuru oke na nhazi nke ụdị dị iche iche.Ọzụzụ a na-achọ ikpughe ụdị evolushọn, ọrụ mkpụrụ ndụ ihe nketa, usoro nhazi mkpụrụ ndụ ihe nketa na ọkwa genome site n'ịchọpụta usoro usoro na ihe ndị echekwara ma ọ bụ dị iche n'ofe ụdị dị iche iche.Ọmụmụ ihe ọmụmụ genomics na-ahụkarị gụnyere nyocha na ezinụlọ mkpụrụ ndụ ihe nketa, mmepe evolushọn, mbigharị genome dum, nrụgide nhọrọ, wdg.
-
Mgbakọ Genome dabere na Hi-C
Hi-C bụ usoro emebere iji weghara nhazi chromosome site na ijikọta mmekọrịta dabere na nso nso yana usoro ntinye dị elu.A na-ekwenye na ike mmekọrịta ndị a na-adịghị mma na anya anụ ahụ na chromosomes.Ya mere, data Hi-C nwere ike iduzi nchịkọta, ịtụ na nhazi nke usoro agbakọtara na mkpụrụ ndụ ihe nketa na itinye ndị ahụ na ọnụ ọgụgụ chromosomes ụfọdụ.Nkà na ụzụ a na-enye ike mgbakọ genome ọkwa chromosome na-enweghị maapụ mkpụrụ ndụ ihe nketa dabere na ọnụ ọgụgụ mmadụ.Ọ bụla genome chọrọ Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Osisi/Anụmanụ De Novo Genome Sequencing
De Novousoro nke na-ezo aka n'iwu nke ụdị 'genome dum site na iji teknụzụ usoro usoro, dịka PacBio, Nanopore, NGS, wdg, na enweghị genome ntụaka.Ọganihu dị ịrịba ama na ogologo ọgụgụ nke ọgbọ nke atọ usoro teknụzụ ewetawo ohere ọhụrụ n'ịchịkọta genomes dị mgbagwoju anya, dị ka ndị nwere heterozygosity dị elu, oke nke mpaghara ugboro ugboro, polyploids, wdg. Na-agụ ogologo na iri puku kwuru iri kilobases larịị, ndị a sequencing na-agụ na-enyere aka. idozi ihe ndị na-emegharị ugboro ugboro, mpaghara nwere ọdịnaya GC na-adịghị mma na mpaghara ndị ọzọ dị mgbagwoju anya.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Usoro ihe omume mmadụ dum
A na-ahụta usoro exome exome (WES) dị ka atụmatụ usoro usoro dị ọnụ ahịa iji chọpụta mmụgharị na-ebute ọrịa.Ọ bụ ezie na exons na-ewe ihe dịka 1.7% nke genome dum, ọ na-anọchite anya profaịlụ nke ọrụ protein zuru ezu ozugbo.Na genome mmadụ, a kọwapụtara na ihe karịrị 85% nke mmụgharị metụtara ọrịa na-eme na mpaghara nzuzo protein.
BMKGENE na-enye ọrụ zuru oke ma na-agbanwe agbanwe nke mmadụ dum exome sequencing atumatu dị iche iche exon ijide atụmatụ dị iji mezuo ebumnuche nyocha dị iche iche.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Usoro Mpempe Mpempe Akọwapụtara kpọmkwem-Locus (SLAF-Seq)
Genotyping dị elu, karịsịa na ọnụ ọgụgụ buru ibu, bụ nzọụkwụ dị mkpa na ọmụmụ ihe ọmụmụ mkpụrụ ndụ ihe nketa, nke na-enye ndabere mkpụrụ ndụ ihe nketa maka nchọpụta mkpụrụ ndụ ọrụ, nyocha evolushọn, wdg. ) ewebata iji belata ọnụ ahịa usoro n'otu nlele, ka na-ejigide arụmọrụ ezi uche dị na nchọpụta mkpụrụ ndụ ihe nketa.A na-enwetakarị nke a site n'iwepụta iberibe mmachi n'ime oke oke enyere, nke akpọrọ ọbá akwụkwọ nnọchite anya belatara (RRL).Sequencing nkebi nke mpaghara akọwapụtara (SLAF-Seq) bụ atụmatụ emepụtara onwe ya maka SNP genotyping nwere ma ọ bụ na-enweghị genome ntụaka.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
