Akụkọ

Aghọtala nkwalite ihe nwere ike imegharị (TE) dị ka ihe na-anya ụgbọ ala na-agbasa mgbasawanye nha genome na evolushọn, mana nsonaazụ maka ịkpụzi 3D genomic architecture ka amabeghị na osisi.N'ebe a, anyị na-akọ banyere mgbakọ genome nke akwụkwọ ntụaka maka ụdị owu atọ nwere okpukpu atọ na nha genome, ya bụ.Gossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2), naG. raimondii(D5), na-eji Oxford Nanopore Teknụzụ.Ntụle genome atụnyere na-edepụta nkọwapụta nke usoro ọmụmụ nke TE nke na-enye aka na nnukwu ọdịiche nha genome (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), ma gosipụta ọdịnaya mkpụrụ ndụ echekwara echekwabara na mmekọrịta dị n'etiti genome.Anyị chọpụtara na ihe dịka 17% nke mkpụrụ ndụ ihe nketa syntenic na-egosipụta mgbanwe ọnọdụ chromatin n'etiti ndị na-arụ ọrụ ("A") na ndị na-adịghị arụ ọrụ ("B"), na mmụba TE jikọtara ọnụ na mmụba nke akụkụ A na mpaghara mkpụrụ ndụ (~ 7,000 genes). ) na K2 na A2 metụtara D5.Naanị 42% nke ngalaba na-akpakọrịta topologically (TAD) ka echekwara n'etiti genome atọ ahụ.Ihe data anyị na-emetụta mmụba TE n'oge na-adịbeghị anya na-esochi nhazi nke ókèala TAD kpọmkwem.Ọmụmụ ihe a na-eme ka ìhè dị n'ọrụ mgbasawanye genome na-agbasa transposon na mmalite nke nhazi chromatin dị elu na osisi.