Nyocha gbasara mkpokọta Genome
1.Uru ọrụ
● Ihe gbasara ọrụ bara ụba: kemgbe e guzobere ya na 2009, BMKGENE arụchaala ọtụtụ narị ụdị ọrụ dị iche iche na nyocha GWAS nke ọnụ ọgụgụ mmadụ, nyere ndị nchọpụta aka ibipụta ihe karịrị 100 akụkọ, ihe nchịkọta mmetụta ruru 500.
● Ndị nyocha ọkachamara.
● Usoro nyocha nkenke.
● Ngwuputa data ziri ezi.
2. Nkọwa ọrụ
| Ụdị | Ọnụ ọgụgụ ndị mmadụ | Usoro nhazi usoro na omimi |
| SLF-GWAS | Nọmba nlele ≥200 | Nha genome <400M, nwere ref-genome, WGS ka akwadoro |
| Nha genome ≤ 1G, 100K Tags na 10X | ||
| 1G ≤ Genome size ≤ 2G, 200K Tags na 10X | ||
| Nha genome> 2G, Tags 300K na 10X | ||
| WGS-GWAS | Nọmba nlele ≥200 | 10X maka nlele ọ bụla |
3. Nhọrọ ihe
Ụdị dị iche iche, ụdị subspecies, landraces / genebanks / ezinụlọ agwakọtara / akụ anụ ọhịa
Ụdị dị iche iche, ụdị ala, ala
Ezinụlọ ọkara-sib/ezinaụlọ zuru oke/ihe anụ ọhịa
4. Nyocha ihe ọmụma bioinformation
● Nyocha njikọ gbasara genome
● Nyocha na nyocha nke SNP dị mkpa
● Nkọwa ọrụ nke mkpụrụ ndụ ihe nketa
5. Usoro ọrụ ọrụ
Nnwale imewe
Nbufe ihe atụ
mmịpụta RNA
Ịrụ ụlọ akwụkwọ
Usoro
Nyocha data
Mgbe-ire ọrụ
a.Phenotype QC
histogram nkesa ugboro ugboro
Ọnụọgụ Phenotype
b.Nyocha ndị otu (Nlereanya: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
Atụmatụ QQ
Manhattan atụmatụ
| Afọ | Akwụkwọ akụkọ | IF | Aha |
| 2022 | NC | 17.69 | Genomic ndabere nke giga-chromosomes na giga-genome nke osisi peony Paeonia ostii. |
| 2015 | NP | 7.43 | Akara ukwu nke ụlọ na-akwado mpaghara genomic nke mkpa agronomic dị na soybean |
| 2018 | MP | 9.32 | Mkpokọta mkpụrụ ndụ ihe nketa zuru ụwa ọnụ nke mbịakọta mkpụrụ n'ike n'ike na-ekpughe ndabere mkpụrụ ndụ ihe nketa nke ụdị ọdịdị ha dị iche. |
| 2022 | HR | 7.29 | Ntụle njikọ gbasara genome na-enye nleba anya nke mkpụrụ ndụ n'ụdị dị iche iche nke oke mkpụrụ anyụ |
