RNA kecil adalah jenis RNA non-coding pendek dengan panjang rata-rata 18-30 nt, termasuk miRNA, siRNA, dan piRNA.RNA kecil ini telah dilaporkan secara besar-besaran terlibat dalam berbagai proses biologis seperti degradasi mRNA, penghambatan translasi, pembentukan heterokromatin, dll. Analisis sekuensing SmallRNA telah diterapkan secara luas dalam penelitian tentang perkembangan hewan/tanaman, penyakit, virus, dll. RNA kecil platform analisis sekuensing terdiri dari analisis standar dan penambangan data tingkat lanjut.Berdasarkan data RNA-seq, analisis standar dapat mencapai identifikasi dan prediksi miRNA, prediksi gen target miRNA, anotasi dan analisis ekspresi.Analisis tingkat lanjut memungkinkan pencarian dan ekstraksi miRNA yang disesuaikan, pembuatan diagram Venn, miRNA, dan pembangunan jaringan gen target.