-
BSA
Platform Analisis Segregant Massal terdiri dari analisis standar satu langkah dan analisis lanjutan dengan pengaturan parameter yang disesuaikan.BSA adalah teknik yang digunakan untuk mengidentifikasi dengan cepat penanda genetik terkait fenotip.Alur kerja utama BSA berisi: 1. memilih dua kelompok individu dengan fenotipe yang sangat berlawanan;2. menyatukan DNA, RNA atau SLAF-seq (Dikembangkan oleh Biomarker) dari semua individu untuk membentuk dua sebagian besar DNA;3. mengidentifikasi urutan diferensial terhadap genom referensi atau di antaranya, 4. memprediksi kandidat wilayah terkait dengan algoritma indeks ED dan SNP;5. Analisis fungsional dan pengayaan gen di wilayah kandidat, dll. Penambangan data yang lebih maju termasuk penyaringan penanda genetik dan desain primer juga tersedia.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Platform Amplicon (16S/18S/ITS) dikembangkan dengan pengalaman bertahun-tahun dalam analisis proyek keanekaragaman mikroba, yang berisi analisis dasar standar dan analisis yang dipersonalisasi: analisis dasar mencakup konten analisis arus utama dari penelitian mikroba saat ini, konten analisis kaya dan komprehensif, dan hasil analisis disajikan dalam bentuk laporan proyek;Isi analisis yang dipersonalisasi beragam.Sampel dapat dipilih dan parameter dapat diatur secara fleksibel sesuai dengan laporan analisis dasar dan tujuan penelitian, untuk mewujudkan kebutuhan yang dipersonalisasi.Sistem operasi Windows, sederhana dan cepat.
-
Genetika Evolusioner
Genetika evolusioner adalah layanan pengurutan yang dirancang untuk memberikan interpretasi komprehensif tentang informasi evolusi dari materi tertentu berdasarkan variasi genetik, termasuk SNP, InDels, SV, dan CNV.Ini memberikan semua analisis mendasar yang diperlukan untuk menggambarkan perubahan evolusioner dan fitur genetik populasi, seperti struktur populasi, keragaman genetik, hubungan filogeni, dll. Ini juga berisi studi tentang aliran gen, yang memberdayakan estimasi ukuran populasi efektif, waktu divergensi.
-
Genomik Komparatif
Genomik komparatif secara harfiah berarti membandingkan urutan genom lengkap dan struktur spesies berbeda.Disiplin ini bertujuan untuk mengungkap evolusi spesies, fungsi gen, mekanisme pengaturan gen pada tingkat genom dengan mengidentifikasi struktur urutan dan elemen yang melestarikan atau membedakan spesies yang berbeda.Studi genomik komparatif yang umum mencakup analisis dalam keluarga gen, perkembangan evolusi, duplikasi seluruh genom, tekanan selektif, dll.
-
Genetika Evolusioner
Platform analisis populasi dan genetika evolusioner dibangun berdasarkan pengalaman masif yang dikumpulkan tim Litbang BMK selama bertahun-tahun.Ini adalah alat yang ramah pengguna terutama bagi peneliti yang bukan jurusan bioinformatika.Platform ini memungkinkan analisis dasar terkait genetika evolusioner termasuk konstruksi pohon filogenetik, analisis disekuilibrium keterkaitan, penilaian keanekaragaman genetik, analisis sapuan selektif, analisis kekerabatan, PCA, analisis struktur populasi, dll.
-
Majelis Genom berbasis Hi-C
Hi-C adalah metode yang dirancang untuk menangkap konfigurasi kromosom dengan menggabungkan interaksi berbasis kedekatan dan pengurutan throughput tinggi.Intensitas interaksi ini diyakini berkorelasi negatif dengan jarak fisik pada kromosom.Oleh karena itu, data Hi-C dapat memandu pengelompokan, pengurutan, dan orientasi rangkaian rangkaian dalam rancangan genom dan mengikatnya ke sejumlah kromosom tertentu.Teknologi ini memberdayakan perakitan genom tingkat kromosom tanpa adanya peta genetik berbasis populasi.Setiap genom membutuhkan Hi-C.
Platform：Platform Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Pengurutan Genom Tumbuhan/Hewan De Novo
De Novopengurutan mengacu pada konstruksi seluruh genom suatu spesies menggunakan teknologi pengurutan, misalnya PacBio, Nanopore, NGS, dll., tanpa adanya genom referensi.Peningkatan luar biasa dalam panjang baca pada teknologi sekuensing generasi ketiga telah membawa peluang baru dalam merakit genom yang kompleks, seperti genom dengan heterozigositas tinggi, rasio daerah berulang yang tinggi, poliploid, dll. Dengan panjang baca pada tingkat puluhan kilobase, pembacaan sekuensing ini memungkinkan penyelesaian elemen berulang, wilayah dengan konten GC abnormal, dan wilayah lain yang sangat kompleks.
Platform： PacBio Sekuel II /Nanopore PromethION P48/ Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan Exome Utuh Manusia
Whole exome sequencing (WES) dianggap sebagai strategi sequencing yang hemat biaya untuk mengidentifikasi mutasi penyebab penyakit.Meskipun ekson hanya menempati sekitar 1,7% dari keseluruhan genom, ekson mewakili profil fungsi total protein secara langsung.Pada genom manusia, dilaporkan bahwa lebih dari 85% mutasi terkait penyakit terjadi pada wilayah pengkode protein.
BMKGENE menawarkan layanan pengurutan eksome seluruh manusia yang komprehensif dan fleksibel dengan strategi penangkapan ekson berbeda yang tersedia untuk memenuhi berbagai tujuan penelitian.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan Fragmen yang Diperkuat Lokus Spesifik (SLAF-Seq)
Genotipe dengan throughput tinggi, terutama pada populasi skala besar, merupakan langkah mendasar dalam studi asosiasi genetik, yang memberikan dasar genetik untuk penemuan gen fungsional, analisis evolusi, dll. Daripada melakukan pengurutan ulang seluruh genom secara mendalam, lebih baik dilakukan pengurutan genom representasi tereduksi (RRGS). ) diperkenalkan untuk meminimalkan biaya pengurutan per sampel, sekaligus menjaga efisiensi yang wajar dalam penemuan penanda genetik.Hal ini biasanya dicapai dengan mengekstraksi fragmen pembatasan dalam rentang ukuran tertentu, yang disebut perpustakaan representasi tereduksi (RRL).Pengurutan fragmen yang diperkuat lokus spesifik (SLAF-Seq) adalah strategi yang dikembangkan sendiri untuk genotipe SNP dengan atau tanpa genom referensi.
Platform: Platform Illumina NovaSeq -
Iluminasi dan BGI
Teknologi pengurutan Illumina, berdasarkan Sequencing by Synthesis (SBS), adalah inovasi NGS yang dianut secara global, bertanggung jawab menghasilkan lebih dari 90% data pengurutan dunia.Prinsip SBS melibatkan pencitraan terminator reversibel berlabel fluoresensi saat setiap dNTP ditambahkan, dan kemudian dibelah untuk memungkinkan penggabungan basis berikutnya.Dengan keempat dNTP terikat terminator reversibel yang ada di setiap siklus pengurutan, persaingan alami meminimalkan bias penggabungan.Teknologi serbaguna ini mendukung perpustakaan single-read dan pair-end, yang melayani berbagai aplikasi genomik.Kemampuan dan presisi pengurutan Illumina yang tinggi menempatkannya sebagai landasan dalam penelitian genomik, memberdayakan para ilmuwan untuk mengungkap seluk-beluk genom dengan detail dan efisiensi yang tak tertandingi.
DNBSEQ, yang dikembangkan oleh BGI, adalah teknologi NGS inovatif lainnya yang telah berhasil menurunkan biaya pengurutan dan meningkatkan throughput.Persiapan perpustakaan DNBSEQ melibatkan fragmentasi DNA, persiapan ssDNA dan amplifikasi lingkaran bergulir untuk mendapatkan bola nano DNA (DNB).Ini kemudian dimuat ke permukaan padat dan selanjutnya diurutkan dengan Probe-Anchor Synthesis kombinatorial (cPAS).
Layanan pengurutan perpustakaan siap pakai kami memfasilitasi pelanggan dalam mempersiapkan perpustakaan pengurutan mereka dari beragam sumber (mRNA, seluruh genom, amplikon, dan lain-lain).Selanjutnya, perpustakaan ini dapat dikirimkan ke pusat pengurutan kami untuk kontrol kualitas dan pengurutan di platform Illumina atau BGI.
