-
Urutan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq menyediakan profil target DNA di seluruh genom untuk modifikasi histon, faktor transkripsi, dan protein terkait DNA lainnya.Ini menggabungkan selektivitas kromatin imunopresipitasi (ChIP) untuk memulihkan kompleks protein-DNA tertentu, dengan kekuatan pengurutan generasi berikutnya (NGS) untuk pengurutan throughput tinggi dari DNA yang dipulihkan.Selain itu, karena kompleks protein-DNA diperoleh dari sel hidup, lokasi pengikatan dapat dibandingkan pada jenis sel dan jaringan berbeda, atau dalam kondisi berbeda.Penerapannya berkisar dari regulasi transkripsional hingga jalur perkembangan hingga mekanisme penyakit dan seterusnya.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan bisulfit seluruh genom
Metilasi DNA pada posisi kelima dalam sitosin (5-mC) memiliki pengaruh mendasar terhadap ekspresi gen dan aktivitas seluler.Pola metilasi yang tidak normal telah dikaitkan dengan beberapa kondisi dan penyakit, seperti kanker.WGBS telah menjadi standar emas untuk mempelajari metilasi genom pada resolusi basa tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Uji Kromatin yang Dapat Diakses Transposase dengan Urutan Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq adalah metode pengurutan throughput tinggi untuk analisis aksesibilitas kromatin seluruh genom, yang penting untuk kontrol epigenetik global atas ekspresi gen.Adaptor pengurutan dimasukkan ke daerah kromatin terbuka oleh transposase Tn5 yang hiperaktif.Setelah amplifikasi PCR, perpustakaan sequencing dibangun.Semua wilayah kromatin terbuka dapat diperoleh dalam kondisi ruang-waktu tertentu, tidak hanya terbatas pada situs pengikatan faktor transkripsi, atau wilayah modifikasi histon tertentu.
-
Pengurutan Bisulfit Representasi yang Dikurangi (RRBS)
Penelitian metilasi DNA selalu menjadi topik hangat dalam penelitian penyakit, dan berkaitan erat dengan ekspresi gen dan sifat fenotipik.RRBS adalah metode yang akurat, efisien dan ekonomis untuk penelitian metilasi DNA.Pengayaan wilayah pulau promotor dan CpG dengan pembelahan enzimatik (Msp I), dikombinasikan dengan sekuensing Bisulfit, menghasilkan deteksi metilasi DNA resolusi tinggi.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
