Highlight
Dalam webinar berdurasi dua jam ini, merupakan kehormatan besar bagi kami untuk mengundang enam pakar di bidang genomik tanaman.Pembicara kami akan memberikan interpretasi mendalam tentang dua studi genom Rye, yang baru-baru ini dipublikasikanGenetika Alam:
1. Perakitan genom skala kromosom memberikan wawasan tentang biologi gandum hitam, evolusi, dan potensi agronomi
2. Perakitan genom berkualitas tinggi menyoroti karakteristik genom gandum hitam dan gen-gen yang penting secara agronomi
Selain itu, kami senang memiliki Ilmuwan Litbang Senior dari Biomarker Technologies untuk berbagi pengalamannya dalam perakitan genom de novo.
Jadwal acara
09:00 WIB
Sambutan Menyambut
Zheng Hong Kun
Pendiri & CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Presiden, Sekolah Ilmu Pertanian Tingkat Lanjut Universitas Peking
09:15
Meningkatkan perbaikan gandum hitam, triticale, dan gandum melalui penggunaan urutan genom referensi berkualitas tinggi
Dalam webinar ini, Prof. Wang memberi kami informasi terkini secara keseluruhan mengenai status terkini penelitian genom triticeae dan menunjukkan keberhasilan dan terobosan dari dua karya luar biasa dalam studi genom Rye, yang baru-baru ini diterbitkan di Nature Genetics dan memperkenalkan keseluruhan penelitian. kelompok yang memimpin dan berkontribusi dalam pekerjaan.
09:25
Genomik sereal @ IPK Gatersleben
Rumput serealia suku Triticeae telah menjadi sumber makanan utama di daerah beriklim sedang, yang telah lama dianggap sebagai pusat perbaikan dan pemuliaan tanaman.Di antara semua spesies yang dibudidayakan, suku ini terkenal dengan fitur genomnya yang sangat kompleks termasuk ukuran genom yang besar, kandungan TE yang tinggi, poliploidi, dll. Dalam sesi ini, Prof. Nils Stein memberi kami pengenalan menyeluruh tentang IPK Gatersleben dan status sereal saat ini. penelitian genom@IPK Gatersleben.
09:35
Perakitan genom skala kromosom memberikan wawasan tentang biologi gandum hitam, evolusi, dan potensi agronomi
M Timothy Rabanus-Wallace, Institut Penelitian Genetika Tanaman dan Perencanaan Tanaman (IPK) LeibnizRye (Secale Cereale L.) merupakan tanaman serealia yang sangat tahan iklim, digunakan secara luas untuk menghasilkan varietas gandum yang lebih baik melalui hibridisasi introgresif, dan memiliki seluruh daftar gen yang diperlukan untuk memungkinkan pembiakan hibrida.Gandum hitam bersifat alogam dan baru didomestikasi, sehingga memberikan akses bagi gandum hitam yang dibudidayakan ke kumpulan gen liar yang beragam dan dapat dieksploitasi.Untuk lebih meningkatkan potensi agronomi gandum hitam, kami memproduksi rangkaian genom gandum hitam berukuran 7,9 Mbp yang dianotasi pada skala kromosom, dan memvalidasi kualitasnya secara ekstensif menggunakan serangkaian sumber daya genetik molekuler.Kami mendemonstrasikan penerapan sumber daya ini dengan berbagai investigasi.Kami menyajikan temuan mengenai isolasi genetik gandum hitam yang tidak lengkap dari kerabatnya yang liar, mekanisme evolusi struktural genom, ketahanan terhadap patogen, toleransi suhu rendah, sistem kontrol kesuburan untuk pemuliaan hibrida, dan manfaat hasil introgresi gandum hitam.
10:05
Perakitan genom berkualitas tinggi menyoroti karakteristik genom gandum hitam dan gen-gen yang penting secara agronomi
Rye adalah tanaman pangan dan hijauan yang berharga, sumber daya genetik yang penting untuk perbaikan gandum dan triticale, dan bahan yang sangat diperlukan untuk studi genomik komparatif yang efisien pada rumput.Di sini, kami mengurutkan genom gandum hitam Weining, varietas gandum hitam elit Tiongkok.Contig yang dirakit (7,74 Gb) menyumbang 98,47% dari perkiraan ukuran genom (7,86 Gb), dengan 93,67% contig (7,25 Gb) ditugaskan ke tujuh kromosom.Elemen berulang merupakan 90,31% dari genom yang dirangkai.Dibandingkan dengan genom Triticeae yang diurutkan sebelumnya, retrotransposon Daniela, Sumaya dan Sumana menunjukkan ekspansi yang kuat pada gandum hitam.Analisis lebih lanjut dari perakitan Weining memberikan pencerahan baru pada duplikasi gen di seluruh genom dan dampaknya terhadap gen biosintesis pati, organisasi fisik lokus prolamin kompleks, fitur ekspresi gen yang mendasari sifat awal, dan wilayah kromosom dan lokus yang diduga terkait dengan domestikasi dalam gandum hitam.Urutan genom ini menjanjikan untuk mempercepat studi genomik dan pemuliaan gandum hitam dan tanaman serealia terkait.
10:35
Tantangan, solusi, dan masa depan perakitan genome de novo
Genom berkualitas tinggi adalah dasar studi genom.Meskipun perkembangan pesat dalam pengurutan dan algoritme telah memberdayakan perakitan genom yang lebih sederhana dan efisien, persyaratan dalam akurasi dan kelengkapan perakitan juga meningkat seiring dengan semakin dalamnya tujuan penelitian.Dalam pembicaraan ini saya akan membahas teknologi populer saat ini dalam perakitan genom dengan beberapa kasus yang berhasil dan melihat sekilas perkembangan di masa depan.
Waktu posting: 08 Januari 2022