Pengurutan Transkriptome Panjang Penuh Berbasis Nanopori
Pengurutan nanopori membedakan dirinya dari platform pengurutan lainnya, karena nukleotida dibaca secara langsung tanpa sintesis DNA dan menghasilkan pembacaan panjang pada puluhan kilobase.Hal ini memberdayakan pembacaan transkrip lengkap secara langsung dan mengatasi tantangan dalam studi transkriptomik.
√ Bias spesifik urutan rendah
√ Pembacaan lengkap cDNA untuk studi struktur gen
√ Lebih sedikit data yang diperlukan untuk mencakup jumlah transkrip yang sama
√ Identifikasi beberapa isoform per gen
√ Kuantifikasi ekspresi pada tingkat isoform
Pipa Bioinformatika Khas
Kasus Sukses Terbaru dengan Teknologi Biomarker
1. Analisis komparatif transkriptom full-length mengungkapkan dinamika perkembangan batang Gnetum luofuense
Jurnal: Perbatasan dalam Genetika
Diterbitkan: Maret 2021
Kata Kunci: Minion |Penyambungan alternatif |APA |lncRNA |Transkrip yang diungkapkan secara berbeda
Baca teks lengkap
2. Pergerakan searah RNA kecil dari pucuk ke akar pada heterograft interspesifik
Jurnal: Tumbuhan Alam
Diterbitkan: Januari 2021
Kata Kunci : Nanopori |Menerangi |deteksi mRNA seluler full-length
3. Analisis transkriptom akar asparagus secara menyeluruh mengungkap mekanisme molekuler toleransi garam yang disebabkan oleh jamur mikoriza arbuskula
Jurnal: Botani Lingkungan dan Eksperimental
Diterbitkan: Januari 2021
Kata Kunci: Minion |Transkrip yang diungkapkan secara berbeda |Faktor transkripsi |Penyambungan alternatif
4. Perubahan Karakteristik Fisiologis dan Transkriptome Panjang Penuh Akar dan Daun Mawar (Rosa chinensis) sebagai Respon terhadap Stres Kekeringan
Jurnal: Fisiologi Tumbuhan dan Sel
Diterbitkan: Oktober 2020
Kata Kunci : Promethion |Transkrip yang diungkapkan secara berbeda |Prediksi fungsional |Isoform yang disambung |TF dan lncRNA
5. Analisis dan perbandingan komprehensif sequencing RNA berbasis PacBio dan nanopore dari transkriptom Arabidopsis
Jurnal: Metode Tumbuhan
Diterbitkan: April 2020
Kata Kunci: GridION |Prometion |Sekuel PacBio |Iluminasi NovaSeq |Penyelarasan genom |Identifikasi transkrip |Penyambungan alternatif |RSK |LncRNA |Kuantifikasi isoform
Berita dan Sorotan bertujuan untuk berbagi kasus-kasus sukses terbaru dengan Biomarker Technologies, menangkap pencapaian ilmiah baru serta teknik-teknik terkemuka yang diterapkan selama penelitian.
Waktu posting: 08 Januari 2022